RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393888.1

CNP-201, Transcript of 2',3'-cyclic nucleotide 3' phosphodiesterase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CNP, Length 2,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNP-201ENST00000393888 VGFO15240 615 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CNP-201ENST00000393888 DCTN1Q14203 1278 aa20.13■□□□□ 0.81
CNP-201ENST00000393888 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CNP-201ENST00000393888 CABP1Q9NZU7 370 aa20.13■□□□□ 0.81
CNP-201ENST00000393888 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa20.13■□□□□ 0.81
CNP-201ENST00000393888 GNAI1P63096 354 aa20.12■□□□□ 0.81
CNP-201ENST00000393888 PRAM1Q96QH2 718 aa20.12■□□□□ 0.81
CNP-201ENST00000393888 FAM135BQ49AJ0 1406 aa20.12■□□□□ 0.81
CNP-201ENST00000393888 POLKQ9UBT6 870 aa20.12■□□□□ 0.81
CNP-201ENST00000393888 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa20.12■□□□□ 0.81
CNP-201ENST00000393888 PNPLA6Q8IY17 1366 aa20.11■□□□□ 0.81
CNP-201ENST00000393888 PRDM10Q9NQV6 1147 aa20.11■□□□□ 0.81
CNP-201ENST00000393888 TPRNQ4KMQ1 711 aa20.11■□□□□ 0.81
CNP-201ENST00000393888 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.11■□□□□ 0.81
CNP-201ENST00000393888 CD163L1Q9NR16 1453 aa20.11■□□□□ 0.81
CNP-201ENST00000393888 PTMAP06454 111 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CNP-201ENST00000393888 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CNP-201ENST00000393888 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CNP-201ENST00000393888 IFT57Q9NWB7 429 aa20.1■□□□□ 0.81
CNP-201ENST00000393888 KRT24Q2M2I5 525 aa20.09■□□□□ 0.81
CNP-201ENST00000393888 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.09■□□□□ 0.81
CNP-201ENST00000393888 MAP7D2Q96T17 732 aa20.09■□□□□ 0.81
CNP-201ENST00000393888 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa20.09■□□□□ 0.81
CNP-201ENST00000393888 NEK4P51957 841 aa20.08■□□□□ 0.81
CNP-201ENST00000393888 CASC1Q6TDU7 716 aa20.08■□□□□ 0.81
CNP-201ENST00000393888 TSC1Q92574 1164 aa20.08■□□□□ 0.81
CNP-201ENST00000393888 LMTK2Q8IWU2 1503 aa20.08■□□□□ 0.81
CNP-201ENST00000393888 ZNF853P0CG23 659 aa20.07■□□□□ 0.8
CNP-201ENST00000393888 SASS6Q6UVJ0 657 aa20.07■□□□□ 0.8
CNP-201ENST00000393888 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CNP-201ENST00000393888 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.07■□□□□ 0.8
CNP-201ENST00000393888 DYNC1I1O14576 645 aa20.07■□□□□ 0.8
CNP-201ENST00000393888 CDK19Q9BWU1 502 aa20.07■□□□□ 0.8
CNP-201ENST00000393888 TSHZ3Q63HK5 1081 aa20.06■□□□□ 0.8
CNP-201ENST00000393888 TMX3Q96JJ7 454 aa20.06■□□□□ 0.8
CNP-201ENST00000393888 MLECQ14165 292 aa20.06■□□□□ 0.8
CNP-201ENST00000393888 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CNP-201ENST00000393888 ANKRD44Q8N8A2 993 aa20.06■□□□□ 0.8
CNP-201ENST00000393888 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.88e-8■■■■□ 25.3
CNP-201ENST00000393888 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa20.06■□□□□ 0.8
CNP-201ENST00000393888 CEP85Q6P2H3 762 aa20.05■□□□□ 0.8
CNP-201ENST00000393888 REC8O95072 547 aa20.04■□□□□ 0.8
CNP-201ENST00000393888 CFAP44Q96MT7 982 aa20.04■□□□□ 0.8
CNP-201ENST00000393888 ERC2O15083 957 aa20.04■□□□□ 0.8
CNP-201ENST00000393888 MCM5P33992 734 aa20.04■□□□□ 0.8
CNP-201ENST00000393888 REREQ9P2R6 1566 aa20.04■□□□□ 0.8
CNP-201ENST00000393888 IDI1Q13907 227 aa20.03■□□□□ 0.8
CNP-201ENST00000393888 MEIS3Q99687 375 aa20.03■□□□□ 0.8
CNP-201ENST00000393888 TSPY26PQ9H489 355 aa20.03■□□□□ 0.8
CNP-201ENST00000393888 ZRANB1Q9UGI0 708 aa20.03■□□□□ 0.8
CNP-201ENST00000393888 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CNP-201ENST00000393888 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CNP-201ENST00000393888 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa20.03■□□□□ 0.8
CNP-201ENST00000393888 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.03■□□□□ 0.8
CNP-201ENST00000393888 ATP10DQ9P241 1426 aa20.02■□□□□ 0.8
CNP-201ENST00000393888 FAM177BA6PVY3 158 aa20.02■□□□□ 0.8
CNP-201ENST00000393888 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.01■□□□□ 0.79
CNP-201ENST00000393888 MBD3O95983 291 aa20.01■□□□□ 0.79
CNP-201ENST00000393888 PALD1Q9ULE6 856 aa20.01■□□□□ 0.79
CNP-201ENST00000393888 ABCC3O15438 1527 aa20.01■□□□□ 0.79
CNP-201ENST00000393888 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
CNP-201ENST00000393888 IL13P35225 146 aa20■□□□□ 0.79
CNP-201ENST00000393888 MSH6P52701 1360 aa20■□□□□ 0.79
CNP-201ENST00000393888 ZFYVE9O95405 1425 aa20■□□□□ 0.79
CNP-201ENST00000393888 BRD1O95696 1058 aa19.99■□□□□ 0.79
CNP-201ENST00000393888 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
CNP-201ENST00000393888 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
CNP-201ENST00000393888 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
CNP-201ENST00000393888 PTPRMP28827 1452 aa19.98■□□□□ 0.79
CNP-201ENST00000393888 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
CNP-201ENST00000393888 KIF20BQ96Q89 1820 aa19.98■□□□□ 0.79
CNP-201ENST00000393888 RTL1A6NKG5 1358 aa19.98■□□□□ 0.79
CNP-201ENST00000393888 DLG5Q8TDM6 1919 aa19.98■□□□□ 0.79
CNP-201ENST00000393888 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa19.97■□□□□ 0.79
CNP-201ENST00000393888 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
CNP-201ENST00000393888 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa19.97■□□□□ 0.79
CNP-201ENST00000393888 NME9Q86XW9 330 aa19.97■□□□□ 0.79
CNP-201ENST00000393888 USP25Q9UHP3 1055 aa19.97■□□□□ 0.79
CNP-201ENST00000393888 RIMS2Q9UQ26 1411 aa19.97■□□□□ 0.79
CNP-201ENST00000393888 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
CNP-201ENST00000393888 PDE1AP54750 535 aa19.96■□□□□ 0.79
CNP-201ENST00000393888 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
CNP-201ENST00000393888 USP48Q86UV5 1035 aa19.96■□□□□ 0.79
CNP-201ENST00000393888 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
CNP-201ENST00000393888 SLC4A10Q6U841 1118 aa19.95■□□□□ 0.78
CNP-201ENST00000393888 WAPLQ7Z5K2 1190 aa19.95■□□□□ 0.78
CNP-201ENST00000393888 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa19.95■□□□□ 0.78
CNP-201ENST00000393888 RGS12O14924 1447 aa19.95■□□□□ 0.78
CNP-201ENST00000393888 MYRIPQ8NFW9 859 aa19.94■□□□□ 0.78
CNP-201ENST00000393888 ANO2Q9NQ90 1003 aa19.94■□□□□ 0.78
CNP-201ENST00000393888 MCM10Q7L590 875 aa19.94■□□□□ 0.78
CNP-201ENST00000393888 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
CNP-201ENST00000393888 KIF24Q5T7B8 1368 aa19.94■□□□□ 0.78
CNP-201ENST00000393888 ZNF710Q8N1W2 664 aa19.93■□□□□ 0.78
CNP-201ENST00000393888 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP19.93■□□□□ 0.78
CNP-201ENST00000393888 RILPL2Q969X0 211 aa19.93■□□□□ 0.78
CNP-201ENST00000393888 F6X3S4 739 aa19.93■□□□□ 0.78
CNP-201ENST00000393888 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP19.93■□□□□ 0.78
CNP-201ENST00000393888 PLCB2Q00722 1185 aa19.92■□□□□ 0.78
CNP-201ENST00000393888 LMOD3Q0VAK6 560 aa19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms