RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 FLT4P35916 1363 aa37.17■■■■□ 3.54
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GNPTAB-202ENST00000392919 SHANK3Q9BYB0 1731 aa37.16■■■■□ 3.54
GNPTAB-202ENST00000392919 BTAF1O14981 1849 aa37.15■■■■□ 3.54
GNPTAB-202ENST00000392919 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP37.15■■■■□ 3.54
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GNPTAB-202ENST00000392919 NSD2O96028 1365 aa37.14■■■■□ 3.54
GNPTAB-202ENST00000392919 KIF24Q5T7B8 1368 aa37.13■■■■□ 3.53
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GNPTAB-202ENST00000392919 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP37.09■■■■□ 3.53
GNPTAB-202ENST00000392919 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa37.08■■■■□ 3.53
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GNPTAB-202ENST00000392919 CASZ1Q86V15 1759 aa37.05■■■■□ 3.52
GNPTAB-202ENST00000392919 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa37.05■■■■□ 3.52
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GNPTAB-202ENST00000392919 MORC1Q86VD1 984 aa37.03■■■■□ 3.52
GNPTAB-202ENST00000392919 STK32BQ9NY57 414 aa37.03■■■■□ 3.52
GNPTAB-202ENST00000392919 POLKQ9UBT6 870 aa37.03■■■■□ 3.52
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GNPTAB-202ENST00000392919 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP37.02■■■■□ 3.52
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC15A2Q16348 729 aa37.02■■■■□ 3.52
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GNPTAB-202ENST00000392919 LRRC4BQ9NT99 713 aa37■■■■□ 3.51
GNPTAB-202ENST00000392919 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa37■■■■□ 3.51
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GNPTAB-202ENST00000392919 EYA1Q99502 592 aa36.93■■■■□ 3.5
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GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF827Q17R98 1081 aa36.91■■■■□ 3.5
GNPTAB-202ENST00000392919 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa36.9■■■■□ 3.5
GNPTAB-202ENST00000392919 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa36.9■■■■□ 3.5
GNPTAB-202ENST00000392919 CYP27B1O15528 508 aa36.9■■■■□ 3.5
GNPTAB-202ENST00000392919 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP36.9■■■■□ 3.5
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GNPTAB-202ENST00000392919 PKD1L3Q7Z443 1732 aa36.88■■■■□ 3.49
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GNPTAB-202ENST00000392919 LY75O60449 1722 aa36.87■■■■□ 3.49
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP36.86■■■■□ 3.49
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC27A3Q5K4L6 730 aa36.86■■■■□ 3.49
GNPTAB-202ENST00000392919 PTGER2P43116 358 aa36.84■■■■□ 3.49
GNPTAB-202ENST00000392919 AKT1S1Q96B36 256 aa36.83■■■■□ 3.49
GNPTAB-202ENST00000392919 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa36.82■■■■□ 3.49
GNPTAB-202ENST00000392919 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa36.77■■■■□ 3.48
GNPTAB-202ENST00000392919 MTFR1LQ9H019 292 aa36.77■■■■□ 3.48
GNPTAB-202ENST00000392919 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP36.77■■■■□ 3.48
GNPTAB-202ENST00000392919 SPG7Q9UQ90 795 aa36.77■■■■□ 3.48
GNPTAB-202ENST00000392919 ITGB4P16144 1822 aa36.75■■■■□ 3.47
GNPTAB-202ENST00000392919 MTHFSP49914 203 aa36.75■■■■□ 3.47
GNPTAB-202ENST00000392919 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa36.74■■■■□ 3.47
GNPTAB-202ENST00000392919 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
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GNPTAB-202ENST00000392919 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP36.73■■■■□ 3.47
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GNPTAB-202ENST00000392919 QSER1Q2KHR3 1735 aa36.71■■■■□ 3.47
GNPTAB-202ENST00000392919 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa36.7■■■■□ 3.47
GNPTAB-202ENST00000392919 PALLDQ8WX93 1383 aa36.69■■■■□ 3.46
GNPTAB-202ENST00000392919 PHKG2P15735 406 aa36.68■■■■□ 3.46
GNPTAB-202ENST00000392919 PIGBQ92521 554 aa36.68■■■■□ 3.46
GNPTAB-202ENST00000392919 IFNL2Q8IZJ0 200 aa36.66■■■■□ 3.46
GNPTAB-202ENST00000392919 PPP2R1AP30153 589 aa36.65■■■■□ 3.46
GNPTAB-202ENST00000392919 C5P01031 1676 aa36.64■■■■□ 3.46
GNPTAB-202ENST00000392919 AEBP1Q8IUX7 1158 aa36.63■■■■□ 3.45
GNPTAB-202ENST00000392919 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP36.62■■■■□ 3.45
GNPTAB-202ENST00000392919 IL13P35225 146 aa36.61■■■■□ 3.45
GNPTAB-202ENST00000392919 TAF1LQ8IZX4 1826 aa36.6■■■■□ 3.45
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC16A10Q8TF71 515 aa36.59■■■■□ 3.45
GNPTAB-202ENST00000392919 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
GNPTAB-202ENST00000392919 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa36.58■■■■□ 3.45
GNPTAB-202ENST00000392919 ARXQ96QS3 562 aa36.58■■■■□ 3.45
GNPTAB-202ENST00000392919 SYT17Q9BSW7 474 aa36.58■■■■□ 3.45
GNPTAB-202ENST00000392919 TMOD3Q9NYL9 352 aa36.57■■■■□ 3.44
GNPTAB-202ENST00000392919 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
GNPTAB-202ENST00000392919 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
GNPTAB-202ENST00000392919 RALBP1Q15311 655 aa36.55■■■■□ 3.44
GNPTAB-202ENST00000392919 COL24A1Q17RW2 1714 aa36.55■■■■□ 3.44
GNPTAB-202ENST00000392919 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP36.55■■■■□ 3.44
GNPTAB-202ENST00000392919 ASAP1Q9ULH1 1129 aa36.55■■■■□ 3.44
GNPTAB-202ENST00000392919 SULT6B1Q6IMI4 303 aa36.54■■■■□ 3.44
GNPTAB-202ENST00000392919 MSH5O43196 834 aa36.52■■■■□ 3.44
GNPTAB-202ENST00000392919 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
GNPTAB-202ENST00000392919 C4BP0C0L5 1744 aa36.51■■■■□ 3.44
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP36.51■■■■□ 3.44
GNPTAB-202ENST00000392919 KDRP35968 1356 aa36.5■■■■□ 3.43
GNPTAB-202ENST00000392919 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa36.49■■■■□ 3.43
GNPTAB-202ENST00000392919 SIK1P57059 783 aa36.49■■■■□ 3.43
GNPTAB-202ENST00000392919 AMOTQ4VCS5 1084 aa36.49■■■■□ 3.43
GNPTAB-202ENST00000392919 ATG3Q9NT62 314 aa36.49■■■■□ 3.43
GNPTAB-202ENST00000392919 AMIGO3Q86WK7 504 aa36.48■■■■□ 3.43
GNPTAB-202ENST00000392919 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP36.48■■■■□ 3.43
GNPTAB-202ENST00000392919 DCAF8L1A6NGE4 600 aa36.47■■■■□ 3.43
GNPTAB-202ENST00000392919 POLD1P28340 1107 aa36.47■■■■□ 3.43
GNPTAB-202ENST00000392919 DCAF5Q96JK2 942 aa36.47■■■■□ 3.43
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