RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390935.1

RNA5SP18-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 18, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP18, Length 121 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP18-201ENST00000390935 SHANK3Q9BYB0 1731 aa10.71□□□□□ -0.69
RNA5SP18-201ENST00000390935 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
RNA5SP18-201ENST00000390935 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
RNA5SP18-201ENST00000390935 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
RNA5SP18-201ENST00000390935 KIF24Q5T7B8 1368 aa10.69□□□□□ -0.7
RNA5SP18-201ENST00000390935 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
RNA5SP18-201ENST00000390935 POLKQ9UBT6 870 aa10.69□□□□□ -0.7
RNA5SP18-201ENST00000390935 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa10.69□□□□□ -0.7
RNA5SP18-201ENST00000390935 WASHC2AQ641Q2 1341 aa10.68□□□□□ -0.7
RNA5SP18-201ENST00000390935 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
RNA5SP18-201ENST00000390935 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa10.68□□□□□ -0.7
RNA5SP18-201ENST00000390935 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
RNA5SP18-201ENST00000390935 DOT1LQ8TEK3 1739 aa10.67□□□□□ -0.7
RNA5SP18-201ENST00000390935 TATP17735 454 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
RNA5SP18-201ENST00000390935 SLC15A2Q16348 729 aa10.66□□□□□ -0.7
RNA5SP18-201ENST00000390935 EYA1Q99502 592 aa10.66□□□□□ -0.7
RNA5SP18-201ENST00000390935 SPON1Q9HCB6 807 aa10.66□□□□□ -0.7
RNA5SP18-201ENST00000390935 LRRC4BQ9NT99 713 aa10.66□□□□□ -0.7
RNA5SP18-201ENST00000390935 STK32BQ9NY57 414 aa10.66□□□□□ -0.7
RNA5SP18-201ENST00000390935 CASZ1Q86V15 1759 aa10.66□□□□□ -0.7
RNA5SP18-201ENST00000390935 KIF7Q2M1P5 1343 aa10.65□□□□□ -0.7
RNA5SP18-201ENST00000390935 CYP27B1O15528 508 aa10.64□□□□□ -0.71
RNA5SP18-201ENST00000390935 ZBTB7AO95365 584 aa10.64□□□□□ -0.71
RNA5SP18-201ENST00000390935 KCNQ4P56696 695 aa10.64□□□□□ -0.71
RNA5SP18-201ENST00000390935 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
RNA5SP18-201ENST00000390935 KNSTRNQ9Y448 316 aa10.64□□□□□ -0.71
RNA5SP18-201ENST00000390935 NSD2O96028 1365 aa10.64□□□□□ -0.71
RNA5SP18-201ENST00000390935 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa10.63□□□□□ -0.71
RNA5SP18-201ENST00000390935 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa10.63□□□□□ -0.71
RNA5SP18-201ENST00000390935 PAPPAQ13219 1627 aa10.63□□□□□ -0.71
RNA5SP18-201ENST00000390935 ZNF827Q17R98 1081 aa10.63□□□□□ -0.71
RNA5SP18-201ENST00000390935 MORC1Q86VD1 984 aa10.63□□□□□ -0.71
RNA5SP18-201ENST00000390935 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
RNA5SP18-201ENST00000390935 NCAPD2Q15021 1401 aa10.63□□□□□ -0.71
RNA5SP18-201ENST00000390935 LY75O60449 1722 aa10.63□□□□□ -0.71
RNA5SP18-201ENST00000390935 ITGB4P16144 1822 aa10.63□□□□□ -0.71
RNA5SP18-201ENST00000390935 PKD1L3Q7Z443 1732 aa10.62□□□□□ -0.71
RNA5SP18-201ENST00000390935 SLC27A3Q5K4L6 730 aa10.62□□□□□ -0.71
RNA5SP18-201ENST00000390935 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
RNA5SP18-201ENST00000390935 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
RNA5SP18-201ENST00000390935 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa10.61□□□□□ -0.71
RNA5SP18-201ENST00000390935 AKT1S1Q96B36 256 aa10.61□□□□□ -0.71
RNA5SP18-201ENST00000390935 SPG7Q9UQ90 795 aa10.61□□□□□ -0.71
RNA5SP18-201ENST00000390935 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa10.61□□□□□ -0.71
RNA5SP18-201ENST00000390935 PTGER2P43116 358 aa10.6□□□□□ -0.71
RNA5SP18-201ENST00000390935 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
RNA5SP18-201ENST00000390935 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
RNA5SP18-201ENST00000390935 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa10.59□□□□□ -0.71
RNA5SP18-201ENST00000390935 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
RNA5SP18-201ENST00000390935 MTFR1LQ9H019 292 aa10.59□□□□□ -0.71
RNA5SP18-201ENST00000390935 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP10.59□□□□□ -0.71
RNA5SP18-201ENST00000390935 IGSF1Q8N6C5 1336 aa10.58□□□□□ -0.71
RNA5SP18-201ENST00000390935 PHKG2P15735 406 aa10.58□□□□□ -0.72
RNA5SP18-201ENST00000390935 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
RNA5SP18-201ENST00000390935 IFNL2Q8IZJ0 200 aa10.58□□□□□ -0.72
RNA5SP18-201ENST00000390935 PIGBQ92521 554 aa10.58□□□□□ -0.72
RNA5SP18-201ENST00000390935 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa10.58□□□□□ -0.72
RNA5SP18-201ENST00000390935 QSER1Q2KHR3 1735 aa10.58□□□□□ -0.72
RNA5SP18-201ENST00000390935 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa10.58□□□□□ -0.72
RNA5SP18-201ENST00000390935 TAF1LQ8IZX4 1826 aa10.57□□□□□ -0.72
RNA5SP18-201ENST00000390935 AEBP1Q8IUX7 1158 aa10.57□□□□□ -0.72
RNA5SP18-201ENST00000390935 SGIP1Q9BQI5 828 aa10.57□□□□□ -0.72
RNA5SP18-201ENST00000390935 PALLDQ8WX93 1383 aa10.56□□□□□ -0.72
RNA5SP18-201ENST00000390935 IL13P35225 146 aa10.56□□□□□ -0.72
RNA5SP18-201ENST00000390935 MTHFSP49914 203 aa10.56□□□□□ -0.72
RNA5SP18-201ENST00000390935 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
RNA5SP18-201ENST00000390935 C5P01031 1676 aa10.56□□□□□ -0.72
RNA5SP18-201ENST00000390935 UTRNP46939 3433 aa10.55□□□□□ -0.72
RNA5SP18-201ENST00000390935 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
RNA5SP18-201ENST00000390935 SULT6B1Q6IMI4 303 aa10.55□□□□□ -0.72
RNA5SP18-201ENST00000390935 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
RNA5SP18-201ENST00000390935 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
RNA5SP18-201ENST00000390935 TMOD3Q9NYL9 352 aa10.55□□□□□ -0.72
RNA5SP18-201ENST00000390935 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
RNA5SP18-201ENST00000390935 SLC16A10Q8TF71 515 aa10.54□□□□□ -0.72
RNA5SP18-201ENST00000390935 ARXQ96QS3 562 aa10.54□□□□□ -0.72
RNA5SP18-201ENST00000390935 SYT17Q9BSW7 474 aa10.54□□□□□ -0.72
RNA5SP18-201ENST00000390935 ASAP1Q9ULH1 1129 aa10.54□□□□□ -0.72
RNA5SP18-201ENST00000390935 MSH5O43196 834 aa10.53□□□□□ -0.72
RNA5SP18-201ENST00000390935 AMOTQ4VCS5 1084 aa10.53□□□□□ -0.72
RNA5SP18-201ENST00000390935 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
RNA5SP18-201ENST00000390935 ATG3Q9NT62 314 aa10.53□□□□□ -0.72
RNA5SP18-201ENST00000390935 COL24A1Q17RW2 1714 aa10.53□□□□□ -0.72
RNA5SP18-201ENST00000390935 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa10.52□□□□□ -0.72
RNA5SP18-201ENST00000390935 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa10.52□□□□□ -0.73
RNA5SP18-201ENST00000390935 ERVV-2B6SEH9 535 aa10.52□□□□□ -0.73
RNA5SP18-201ENST00000390935 SIK1P57059 783 aa10.52□□□□□ -0.73
RNA5SP18-201ENST00000390935 DCAF5Q96JK2 942 aa10.52□□□□□ -0.73
RNA5SP18-201ENST00000390935 C4BP0C0L5 1744 aa10.52□□□□□ -0.73
RNA5SP18-201ENST00000390935 KDRP35968 1356 aa10.52□□□□□ -0.73
RNA5SP18-201ENST00000390935 DCAF8L1A6NGE4 600 aa10.51□□□□□ -0.73
RNA5SP18-201ENST00000390935 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
RNA5SP18-201ENST00000390935 HMOX1P09601 288 aa10.51□□□□□ -0.73
RNA5SP18-201ENST00000390935 POLD1P28340 1107 aa10.51□□□□□ -0.73
RNA5SP18-201ENST00000390935 ATP6V1AP38606 617 aa10.51□□□□□ -0.73
RNA5SP18-201ENST00000390935 SMIM5Q71RC9 77 aa10.51□□□□□ -0.73
RNA5SP18-201ENST00000390935 AMIGO3Q86WK7 504 aa10.51□□□□□ -0.73
RNA5SP18-201ENST00000390935 LINC00116Q8NCU8 138 aa10.51□□□□□ -0.73
RNA5SP18-201ENST00000390935 UBR3Q6ZT12 1888 aa10.51□□□□□ -0.73
RNA5SP18-201ENST00000390935 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms