RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373162.5

TRAPPC3-202, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,056 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-202ENST00000373162 NSD2O96028 1365 aa24.89■■□□□ 1.57
TRAPPC3-202ENST00000373162 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC3-202ENST00000373162 TXNRD1Q16881 649 aa24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC3-202ENST00000373162 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC3-202ENST00000373162 ACSBG1Q96GR2 724 aa24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC3-202ENST00000373162 PANK3Q9H999 370 aa24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC3-202ENST00000373162 POLKQ9UBT6 870 aa24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC3-202ENST00000373162 NBPF14Q5TI25 921 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC3-202ENST00000373162 LY75O60449 1722 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC3-202ENST00000373162 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC3-202ENST00000373162 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC3-202ENST00000373162 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC3-202ENST00000373162 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC3-202ENST00000373162 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC3-202ENST00000373162 EYA1Q99502 592 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC3-202ENST00000373162 QSER1Q2KHR3 1735 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC3-202ENST00000373162 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC3-202ENST00000373162 LRRC4BQ9NT99 713 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC3-202ENST00000373162 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC3-202ENST00000373162 TATP17735 454 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC3-202ENST00000373162 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC3-202ENST00000373162 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC3-202ENST00000373162 CYP27B1O15528 508 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC3-202ENST00000373162 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC3-202ENST00000373162 SLC15A2Q16348 729 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC3-202ENST00000373162 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC3-202ENST00000373162 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC3-202ENST00000373162 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC3-202ENST00000373162 ITGB4P16144 1822 aa24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC3-202ENST00000373162 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC3-202ENST00000373162 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC3-202ENST00000373162 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC3-202ENST00000373162 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF827Q17R98 1081 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC3-202ENST00000373162 COL24A1Q17RW2 1714 aa24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC3-202ENST00000373162 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC3-202ENST00000373162 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC3-202ENST00000373162 STK32BQ9NY57 414 aa24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC3-202ENST00000373162 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC3-202ENST00000373162 SLC27A3Q5K4L6 730 aa24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC3-202ENST00000373162 AKT1S1Q96B36 256 aa24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC3-202ENST00000373162 SPON1Q9HCB6 807 aa24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC3-202ENST00000373162 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC3-202ENST00000373162 PTGER2P43116 358 aa24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC3-202ENST00000373162 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC3-202ENST00000373162 MORC1Q86VD1 984 aa24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC3-202ENST00000373162 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC3-202ENST00000373162 TAF1LQ8IZX4 1826 aa24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC3-202ENST00000373162 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC3-202ENST00000373162 C5P01031 1676 aa24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC3-202ENST00000373162 KDRP35968 1356 aa24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC3-202ENST00000373162 KCNQ4P56696 695 aa24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC3-202ENST00000373162 SPG7Q9UQ90 795 aa24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZBTB7AO95365 584 aa24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC3-202ENST00000373162 PHKG2P15735 406 aa24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC3-202ENST00000373162 IL13P35225 146 aa24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC3-202ENST00000373162 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC3-202ENST00000373162 PALLDQ8WX93 1383 aa24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC3-202ENST00000373162 MTFR1LQ9H019 292 aa24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC3-202ENST00000373162 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
TRAPPC3-202ENST00000373162 PIGBQ92521 554 aa24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC3-202ENST00000373162 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC3-202ENST00000373162 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC3-202ENST00000373162 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC3-202ENST00000373162 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC3-202ENST00000373162 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC3-202ENST00000373162 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC3-202ENST00000373162 C4BP0C0L5 1744 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF831Q5JPB2 1677 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC3-202ENST00000373162 MTHFSP49914 203 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC3-202ENST00000373162 SLC16A10Q8TF71 515 aa24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC3-202ENST00000373162 UBR3Q6ZT12 1888 aa24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC3-202ENST00000373162 UTRNP46939 3433 aa24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC3-202ENST00000373162 MAP3K5Q99683 1374 aa24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC3-202ENST00000373162 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC3-202ENST00000373162 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC3-202ENST00000373162 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC3-202ENST00000373162 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC3-202ENST00000373162 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC3-202ENST00000373162 SCN11AQ9UI33 1791 aa24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC3-202ENST00000373162 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC3-202ENST00000373162 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC3-202ENST00000373162 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC3-202ENST00000373162 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC3-202ENST00000373162 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC3-202ENST00000373162 ASAP1Q9ULH1 1129 aa24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC3-202ENST00000373162 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC3-202ENST00000373162 AMIGO3Q86WK7 504 aa24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC3-202ENST00000373162 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC3-202ENST00000373162 DCAF5Q96JK2 942 aa24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC3-202ENST00000373162 ATG3Q9NT62 314 aa24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC3-202ENST00000373162 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC3-202ENST00000373162 MRC1P22897 1456 aa24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC3-202ENST00000373162 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC3-202ENST00000373162 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC3-202ENST00000373162 SIK1P57059 783 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC3-202ENST00000373162 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC3-202ENST00000373162 ITPK1Q13572 414 aa24.42■■□□□ 1.5
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