RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370408.2

ERLIN1-201, Transcript of ER lipid raft associated 1, humanhuman

TSL 5

Gene ERLIN1, Length 962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERLIN1-201ENST00000370408 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
ERLIN1-201ENST00000370408 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa30.14■■■□□ 2.42
ERLIN1-201ENST00000370408 LRRC4BQ9NT99 713 aa30.14■■■□□ 2.42
ERLIN1-201ENST00000370408 KIF24Q5T7B8 1368 aa30.14■■■□□ 2.41
ERLIN1-201ENST00000370408 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
ERLIN1-201ENST00000370408 RGPD2P0DJD1 1756 aa30.13■■■□□ 2.41
ERLIN1-201ENST00000370408 CGNL1Q0VF96 1302 aa30.12■■■□□ 2.41
ERLIN1-201ENST00000370408 KIF20BQ96Q89 1820 aa30.11■■■□□ 2.41
ERLIN1-201ENST00000370408 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
ERLIN1-201ENST00000370408 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
ERLIN1-201ENST00000370408 TATP17735 454 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
ERLIN1-201ENST00000370408 BTAF1O14981 1849 aa30.09■■■□□ 2.41
ERLIN1-201ENST00000370408 CASZ1Q86V15 1759 aa30.09■■■□□ 2.41
ERLIN1-201ENST00000370408 PTGER2P43116 358 aa30.07■■■□□ 2.4
ERLIN1-201ENST00000370408 ZNF827Q17R98 1081 aa30.07■■■□□ 2.4
ERLIN1-201ENST00000370408 KAT6BQ8WYB5 2073 aa30.06■■■□□ 2.4
ERLIN1-201ENST00000370408 NSD2O96028 1365 aa30.05■■■□□ 2.4
ERLIN1-201ENST00000370408 SLC27A3Q5K4L6 730 aa30.05■■■□□ 2.4
ERLIN1-201ENST00000370408 KCNQ4P56696 695 aa30.04■■■□□ 2.4
ERLIN1-201ENST00000370408 POLKQ9UBT6 870 aa30.04■■■□□ 2.4
ERLIN1-201ENST00000370408 WASHC2AQ641Q2 1341 aa30.03■■■□□ 2.4
ERLIN1-201ENST00000370408 PANK3Q9H999 370 aa30.03■■■□□ 2.4
ERLIN1-201ENST00000370408 AKT1S1Q96B36 256 aa30.02■■■□□ 2.4
ERLIN1-201ENST00000370408 MTFR1LQ9H019 292 aa30.02■■■□□ 2.4
ERLIN1-201ENST00000370408 PAPPAQ13219 1627 aa30.01■■■□□ 2.39
ERLIN1-201ENST00000370408 SHANK3Q9BYB0 1731 aa30.01■■■□□ 2.39
ERLIN1-201ENST00000370408 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
ERLIN1-201ENST00000370408 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa29.99■■■□□ 2.39
ERLIN1-201ENST00000370408 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa29.99■■■□□ 2.39
ERLIN1-201ENST00000370408 CYP27B1O15528 508 aa29.99■■■□□ 2.39
ERLIN1-201ENST00000370408 EYA1Q99502 592 aa29.98■■■□□ 2.39
ERLIN1-201ENST00000370408 SGIP1Q9BQI5 828 aa29.98■■■□□ 2.39
ERLIN1-201ENST00000370408 DOT1LQ8TEK3 1739 aa29.96■■■□□ 2.39
ERLIN1-201ENST00000370408 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
ERLIN1-201ENST00000370408 NCAPD2Q15021 1401 aa29.94■■■□□ 2.38
ERLIN1-201ENST00000370408 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa29.93■■■□□ 2.38
ERLIN1-201ENST00000370408 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
ERLIN1-201ENST00000370408 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa29.92■■■□□ 2.38
ERLIN1-201ENST00000370408 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
ERLIN1-201ENST00000370408 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa29.91■■■□□ 2.38
ERLIN1-201ENST00000370408 SPG7Q9UQ90 795 aa29.91■■■□□ 2.38
ERLIN1-201ENST00000370408 DCAF8L1A6NGE4 600 aa29.9■■■□□ 2.38
ERLIN1-201ENST00000370408 ARXQ96QS3 562 aa29.89■■■□□ 2.38
ERLIN1-201ENST00000370408 SYT17Q9BSW7 474 aa29.89■■■□□ 2.38
ERLIN1-201ENST00000370408 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa29.88■■■□□ 2.37
ERLIN1-201ENST00000370408 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
ERLIN1-201ENST00000370408 SLC16A10Q8TF71 515 aa29.88■■■□□ 2.37
ERLIN1-201ENST00000370408 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
ERLIN1-201ENST00000370408 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP29.87■■■□□ 2.375e-7■■□□□ 11.4
ERLIN1-201ENST00000370408 MORC1Q86VD1 984 aa29.85■■■□□ 2.37
ERLIN1-201ENST00000370408 LY75O60449 1722 aa29.85■■■□□ 2.37
ERLIN1-201ENST00000370408 PALLDQ8WX93 1383 aa29.83■■■□□ 2.37
ERLIN1-201ENST00000370408 PIGBQ92521 554 aa29.83■■■□□ 2.37
ERLIN1-201ENST00000370408 YY1P25490 414 aa29.82■■■□□ 2.36
ERLIN1-201ENST00000370408 KNSTRNQ9Y448 316 aa29.82■■■□□ 2.36
ERLIN1-201ENST00000370408 PKD1L3Q7Z443 1732 aa29.8■■■□□ 2.36
ERLIN1-201ENST00000370408 PHKG2P15735 406 aa29.8■■■□□ 2.36
ERLIN1-201ENST00000370408 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
ERLIN1-201ENST00000370408 IFNL2Q8IZJ0 200 aa29.8■■■□□ 2.36
ERLIN1-201ENST00000370408 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
ERLIN1-201ENST00000370408 KIF7Q2M1P5 1343 aa29.79■■■□□ 2.36
ERLIN1-201ENST00000370408 IGSF1Q8N6C5 1336 aa29.79■■■□□ 2.36
ERLIN1-201ENST00000370408 MSH5O43196 834 aa29.78■■■□□ 2.36
ERLIN1-201ENST00000370408 POLD1P28340 1107 aa29.78■■■□□ 2.36
ERLIN1-201ENST00000370408 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa29.76■■■□□ 2.35
ERLIN1-201ENST00000370408 QSER1Q2KHR3 1735 aa29.75■■■□□ 2.35
ERLIN1-201ENST00000370408 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
ERLIN1-201ENST00000370408 TMOD3Q9NYL9 352 aa29.75■■■□□ 2.35
ERLIN1-201ENST00000370408 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
ERLIN1-201ENST00000370408 MAP3K5Q99683 1374 aa29.74■■■□□ 2.35
ERLIN1-201ENST00000370408 KLHL34Q8N239 644 aa29.72■■■□□ 2.35
ERLIN1-201ENST00000370408 ASAP1Q9ULH1 1129 aa29.72■■■□□ 2.35
ERLIN1-201ENST00000370408 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa29.71■■■□□ 2.35
ERLIN1-201ENST00000370408 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
ERLIN1-201ENST00000370408 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa29.7■■■□□ 2.35
ERLIN1-201ENST00000370408 AEBP1Q8IUX7 1158 aa29.7■■■□□ 2.35
ERLIN1-201ENST00000370408 ITGB4P16144 1822 aa29.69■■■□□ 2.34
ERLIN1-201ENST00000370408 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa29.69■■■□□ 2.34
ERLIN1-201ENST00000370408 SIK1P57059 783 aa29.69■■■□□ 2.34
ERLIN1-201ENST00000370408 MSL1Q68DK7 614 aa29.69■■■□□ 2.34
ERLIN1-201ENST00000370408 FLAD1Q8NFF5 587 aa29.69■■■□□ 2.34
ERLIN1-201ENST00000370408 AMIGO3Q86WK7 504 aa29.68■■■□□ 2.34
ERLIN1-201ENST00000370408 ATG3Q9NT62 314 aa29.68■■■□□ 2.34
ERLIN1-201ENST00000370408 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
ERLIN1-201ENST00000370408 IL13P35225 146 aa29.67■■■□□ 2.34
ERLIN1-201ENST00000370408 AK7Q96M32 723 aa29.67■■■□□ 2.34
ERLIN1-201ENST00000370408 AMOTQ4VCS5 1084 aa29.66■■■□□ 2.34
ERLIN1-201ENST00000370408 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
ERLIN1-201ENST00000370408 SMIM5Q71RC9 77 aa29.66■■■□□ 2.34
ERLIN1-201ENST00000370408 LINC00116Q8NCU8 138 aa29.66■■■□□ 2.34
ERLIN1-201ENST00000370408 SULT6B1Q6IMI4 303 aa29.65■■■□□ 2.34
ERLIN1-201ENST00000370408 C5P01031 1676 aa29.65■■■□□ 2.34
ERLIN1-201ENST00000370408 ERVV-2B6SEH9 535 aa29.64■■■□□ 2.34
ERLIN1-201ENST00000370408 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
ERLIN1-201ENST00000370408 ITPK1Q13572 414 aa29.64■■■□□ 2.34
ERLIN1-201ENST00000370408 DCAF5Q96JK2 942 aa29.64■■■□□ 2.34
ERLIN1-201ENST00000370408 COL24A1Q17RW2 1714 aa29.64■■■□□ 2.34
ERLIN1-201ENST00000370408 ATP6V1AP38606 617 aa29.63■■■□□ 2.33
ERLIN1-201ENST00000370408 MTHFSP49914 203 aa29.62■■■□□ 2.33
ERLIN1-201ENST00000370408 NLGN2Q8NFZ4 835 aa29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms