RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa39.19■■■■□ 3.86
ECHS1-201ENST00000368547 POTEAQ6S8J7 498 aa39.19■■■■□ 3.86
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ECHS1-201ENST00000368547 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP39.18■■■■□ 3.86
ECHS1-201ENST00000368547 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP39.18■■■■□ 3.86
ECHS1-201ENST00000368547 PHACTR3Q96KR7 559 aa39.18■■■■□ 3.86
ECHS1-201ENST00000368547 RUNDC1Q96C34 613 aa39.16■■■■□ 3.86
ECHS1-201ENST00000368547 PKD1L3Q7Z443 1732 aa39.16■■■■□ 3.86
ECHS1-201ENST00000368547 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa39.16■■■■□ 3.86
ECHS1-201ENST00000368547 NEFMP07197 916 aa39.15■■■■□ 3.86
ECHS1-201ENST00000368547 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa39.15■■■■□ 3.86
ECHS1-201ENST00000368547 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa39.14■■■■□ 3.86
ECHS1-201ENST00000368547 LRRC37A3O60309 1634 aa39.13■■■■□ 3.85
ECHS1-201ENST00000368547 A0A0G2JS52 829 aa39.12■■■■□ 3.85
ECHS1-201ENST00000368547 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP39.12■■■■□ 3.85
ECHS1-201ENST00000368547 RXRBP28702 533 aa39.12■■■■□ 3.85
ECHS1-201ENST00000368547 MYT1Q01538 1121 aa39.12■■■■□ 3.85
ECHS1-201ENST00000368547 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP39.11■■■■□ 3.85
ECHS1-201ENST00000368547 SHANK3Q9BYB0 1731 aa39.1■■■■□ 3.85
ECHS1-201ENST00000368547 AMOTQ4VCS5 1084 aa39.1■■■■□ 3.85
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ECHS1-201ENST00000368547 SPG7Q9UQ90 795 aa39.09■■■■□ 3.85
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ECHS1-201ENST00000368547 DDB1Q16531 1140 aa39.07■■■■□ 3.85
ECHS1-201ENST00000368547 TNS2Q63HR2 1409 aa39.07■■■■□ 3.84
ECHS1-201ENST00000368547 SEPT12Q8IYM1 358 aa39.06■■■■□ 3.84
ECHS1-201ENST00000368547 APAF1O14727 1248 aa39.03■■■■□ 3.84
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP39.03■■■■□ 3.84
ECHS1-201ENST00000368547 GAS2L2Q8NHY3 880 aa39.03■■■■□ 3.84
ECHS1-201ENST00000368547 DLG5Q8TDM6 1919 aa39.02■■■■□ 3.84
ECHS1-201ENST00000368547 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa39.02■■■■□ 3.84
ECHS1-201ENST00000368547 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa39.01■■■■□ 3.84
ECHS1-201ENST00000368547 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa39.01■■■■□ 3.84
ECHS1-201ENST00000368547 NFE2L2Q16236 605 aa39■■■■□ 3.83
ECHS1-201ENST00000368547 TMPOP42166 694 aaKnown RBP39■■■■□ 3.83
ECHS1-201ENST00000368547 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP39■■■■□ 3.83
ECHS1-201ENST00000368547 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP39■■■■□ 3.83
ECHS1-201ENST00000368547 BRWD3Q6RI45 1802 aa38.99■■■■□ 3.83
ECHS1-201ENST00000368547 CYP27B1O15528 508 aa38.99■■■■□ 3.83
ECHS1-201ENST00000368547 NEUROD2Q15784 382 aa38.97■■■■□ 3.83
ECHS1-201ENST00000368547 RGS12O14924 1447 aa38.97■■■■□ 3.83
ECHS1-201ENST00000368547 C1orf141Q5JVX7 400 aa38.96■■■■□ 3.83
ECHS1-201ENST00000368547 IFNL2Q8IZJ0 200 aa38.96■■■■□ 3.83
ECHS1-201ENST00000368547 PHKG2P15735 406 aa38.95■■■■□ 3.83
ECHS1-201ENST00000368547 PDE3BQ13370 1112 aa38.95■■■■□ 3.83
ECHS1-201ENST00000368547 RIPK4P57078 832 aa38.94■■■■□ 3.82
ECHS1-201ENST00000368547 AKAP4Q5JQC9 854 aa38.94■■■■□ 3.82
ECHS1-201ENST00000368547 MAP3K5Q99683 1374 aa38.92■■■■□ 3.82
ECHS1-201ENST00000368547 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP38.92■■■■□ 3.82
ECHS1-201ENST00000368547 GNAT3A8MTJ3 354 aa38.91■■■■□ 3.82
ECHS1-201ENST00000368547 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP38.9■■■■□ 3.82
ECHS1-201ENST00000368547 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP38.89■■■■□ 3.82
ECHS1-201ENST00000368547 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP38.88■■■■□ 3.81
ECHS1-201ENST00000368547 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa38.85■■■■□ 3.81
ECHS1-201ENST00000368547 KRT27Q7Z3Y8 459 aa38.85■■■■□ 3.81
ECHS1-201ENST00000368547 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP38.85■■■■□ 3.81
ECHS1-201ENST00000368547 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP38.85■■■■□ 3.81
ECHS1-201ENST00000368547 SCN11AQ9UI33 1791 aa38.84■■■■□ 3.81
ECHS1-201ENST00000368547 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP38.84■■■■□ 3.81
ECHS1-201ENST00000368547 TRIM35Q9UPQ4 493 aa38.84■■■■□ 3.81
ECHS1-201ENST00000368547 FAM182BQ5T319 152 aa38.83■■■■□ 3.81
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ECHS1-201ENST00000368547 LMOD3Q0VAK6 560 aa38.82■■■■□ 3.81
ECHS1-201ENST00000368547 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP38.82■■■■□ 3.81
ECHS1-201ENST00000368547 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa38.82■■■■□ 3.81
ECHS1-201ENST00000368547 DCTN1Q14203 1278 aa38.81■■■■□ 3.8
ECHS1-201ENST00000368547 DCAF5Q96JK2 942 aa38.81■■■■□ 3.8
ECHS1-201ENST00000368547 MCM10Q7L590 875 aa38.81■■■■□ 3.8
ECHS1-201ENST00000368547 LGR6Q9HBX8 967 aa38.81■■■■□ 3.8
ECHS1-201ENST00000368547 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa38.79■■■■□ 3.8
ECHS1-201ENST00000368547 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP38.79■■■■□ 3.8
ECHS1-201ENST00000368547 NGEFQ8N5V2 710 aa38.79■■■■□ 3.8
ECHS1-201ENST00000368547 IL17REQ8NFR9 667 aa38.79■■■■□ 3.8
ECHS1-201ENST00000368547 RNMTO43148 476 aaKnown RBP38.78■■■■□ 3.8
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC27Q2M243 656 aa38.78■■■■□ 3.8
ECHS1-201ENST00000368547 DOT1LQ8TEK3 1739 aa38.77■■■■□ 3.8
ECHS1-201ENST00000368547 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP38.77■■■■□ 3.8
ECHS1-201ENST00000368547 ZBED9Q6R2W3 1325 aa38.76■■■■□ 3.8
ECHS1-201ENST00000368547 WWC1Q8IX03 1113 aa38.75■■■■□ 3.79
ECHS1-201ENST00000368547 KAT6BQ8WYB5 2073 aa38.74■■■■□ 3.79
ECHS1-201ENST00000368547 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa38.74■■■■□ 3.79
ECHS1-201ENST00000368547 ITGB4P16144 1822 aa38.71■■■■□ 3.79
ECHS1-201ENST00000368547 BCL9O00512 1426 aa38.71■■■■□ 3.79
ECHS1-201ENST00000368547 SBF2Q86WG5 1849 aa38.7■■■■□ 3.79
ECHS1-201ENST00000368547 ERVV-2B6SEH9 535 aa38.69■■■■□ 3.78
ECHS1-201ENST00000368547 ACSBG1Q96GR2 724 aa38.69■■■■□ 3.78
ECHS1-201ENST00000368547 EP400Q96L91 3159 aa38.68■■■■□ 3.78
ECHS1-201ENST00000368547 FAM196AQ6ZSG2 479 aa38.68■■■■□ 3.78
ECHS1-201ENST00000368547 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP38.67■■■■□ 3.78
ECHS1-201ENST00000368547 ILDR2Q71H61 639 aa38.67■■■■□ 3.78
ECHS1-201ENST00000368547 MRC1P22897 1456 aa38.67■■■■□ 3.78
ECHS1-201ENST00000368547 TEFQ10587 303 aa38.67■■■■□ 3.78
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF521Q96K83 1311 aa38.66■■■■□ 3.78
ECHS1-201ENST00000368547 CABP4P57796 275 aa38.66■■■■□ 3.78
ECHS1-201ENST00000368547 SLC52A2Q9HAB3 445 aa38.66■■■■□ 3.78
ECHS1-201ENST00000368547 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP38.65■■■■□ 3.78
ECHS1-201ENST00000368547 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP38.65■■■■□ 3.78
ECHS1-201ENST00000368547 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa38.64■■■■□ 3.78
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