RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365174.1

RNA5SP223-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 223, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP223, Length 120 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP223-201ENST00000365174 APBB1O00213 710 aa6.7□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 HOXC9P31274 260 aa6.7□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 GNAI1P63096 354 aa6.7□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa6.7□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 USP35Q9P2H5 1018 aa6.7□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 FANCIQ9NVI1 1328 aa6.7□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 PEAK1Q9H792 1746 aa6.7□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa6.69□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa6.69□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 SMC4Q9NTJ3 1288 aa6.69□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 SLIT3O75094 1523 aa6.69□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 RNF123Q5XPI4 1314 aa6.69□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 KIF16BQ96L93 1317 aa6.69□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 STRCP1A6NGW2 1772 aa6.69□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 NFAT5O94916 1531 aa6.68□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 C1orf141Q5JVX7 400 aa6.68□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 IP6K1Q92551 441 aa6.68□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 ZNF592Q92610 1267 aa6.68□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 IFT57Q9NWB7 429 aa6.68□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 IGSF1Q8N6C5 1336 aa6.68□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 RGPD1P0DJD0 1748 aa6.67□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 PLIN1O60240 522 aa6.67□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 GCP02774 474 aa6.67□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 AEBP1Q8IUX7 1158 aa6.67□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 ZNF428Q96B54 188 aa6.67□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 CRBNQ96SW2 442 aa6.67□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 TRIM35Q9UPQ4 493 aa6.67□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 USP19O94966 1318 aa6.67□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 ALS2Q96Q42 1657 aa6.66□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa6.66□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 BRINP3Q76B58 766 aa6.66□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 EXOC6Q8TAG9 804 aa6.66□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 ANKRD24Q8TF21 1146 aa6.66□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa6.66□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 PHACTR3Q96KR7 559 aa6.66□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 EYA1Q99502 592 aa6.66□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 BCL2L13Q9BXK5 485 aa6.66□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 SLAIN2Q9P270 581 aa6.66□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 MAP3K5Q99683 1374 aa6.66□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 ABCC6O95255 1503 aa6.66□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 GNAT3A8MTJ3 354 aa6.65□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 PDE3AQ14432 1141 aa6.65□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 USHBP1Q8N6Y0 703 aa6.65□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 PRDM11Q9NQV5 511 aa6.65□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 TSPYL4Q9UJ04 414 aa6.65□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa6.65□□□□□ -1.35
RNA5SP223-201ENST00000365174 KDRP35968 1356 aa6.65□□□□□ -1.35
RNA5SP223-201ENST00000365174 PXDNQ92626 1479 aa6.65□□□□□ -1.35
RNA5SP223-201ENST00000365174 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
RNA5SP223-201ENST00000365174 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RNA5SP223-201ENST00000365174 RGL2O15211 777 aa6.64□□□□□ -1.35
RNA5SP223-201ENST00000365174 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RNA5SP223-201ENST00000365174 BCAR3O75815 825 aa6.64□□□□□ -1.35
RNA5SP223-201ENST00000365174 TATP17735 454 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RNA5SP223-201ENST00000365174 RARSP54136 660 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RNA5SP223-201ENST00000365174 TEFQ10587 303 aa6.64□□□□□ -1.35
RNA5SP223-201ENST00000365174 AAMPQ13685 434 aa6.64□□□□□ -1.35
RNA5SP223-201ENST00000365174 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RNA5SP223-201ENST00000365174 ALDH1L2Q3SY69 923 aa6.64□□□□□ -1.35
RNA5SP223-201ENST00000365174 AMOTQ4VCS5 1084 aa6.64□□□□□ -1.35
RNA5SP223-201ENST00000365174 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RNA5SP223-201ENST00000365174 MCM10Q7L590 875 aa6.64□□□□□ -1.35
RNA5SP223-201ENST00000365174 ARHGEF25Q86VW2 580 aa6.64□□□□□ -1.35
RNA5SP223-201ENST00000365174 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RNA5SP223-201ENST00000365174 MBIPQ9NS73 344 aa6.64□□□□□ -1.35
RNA5SP223-201ENST00000365174 NLRP2Q9NX02 1062 aa6.64□□□□□ -1.35
RNA5SP223-201ENST00000365174 DLG5Q8TDM6 1919 aa6.64□□□□□ -1.35
RNA5SP223-201ENST00000365174 FAM83GA6ND36 823 aa6.63□□□□□ -1.35
RNA5SP223-201ENST00000365174 DCTN1Q14203 1278 aa6.63□□□□□ -1.35
RNA5SP223-201ENST00000365174 NCAPD2Q15021 1401 aa6.63□□□□□ -1.35
RNA5SP223-201ENST00000365174 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RNA5SP223-201ENST00000365174 CCDC125Q86Z20 511 aa6.63□□□□□ -1.35
RNA5SP223-201ENST00000365174 CERS3Q8IU89 383 aa6.63□□□□□ -1.35
RNA5SP223-201ENST00000365174 ITPRIPQ8IWB1 547 aa6.63□□□□□ -1.35
RNA5SP223-201ENST00000365174 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RNA5SP223-201ENST00000365174 STK31Q9BXU1 1019 aa6.63□□□□□ -1.35
RNA5SP223-201ENST00000365174 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RNA5SP223-201ENST00000365174 SPG7Q9UQ90 795 aa6.63□□□□□ -1.35
RNA5SP223-201ENST00000365174 KIAA0232Q92628 1395 aa6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 148.8 ms