RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 FMNL2Q96PY5 1086 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPCPD1Q9NPB8 672 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 MOXD2PA6NHM9 499 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 DGKGP49619 791 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPIRE2Q8WWL2 714 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 CARD14Q9BXL6 1004 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 CFHR5Q9BXR6 569 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 DYRK1BQ9Y463 629 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 CFAP99D6REC4 459 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 ADH1AP07327 375 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 CLCN1P35523 988 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 PTGIRP43119 386 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAP2K5Q13163 448 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 ERFEQ4G0M1 354 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 BTBD6Q96KE9 485 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPIHBP1Q8IV16 184 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 P3H3Q8IVL6 736 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 IRF6O14896 467 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 RIC3Q7Z5B4 369 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC10A4Q96EP9 437 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 GGA1Q9UJY5 639 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 PHF24Q9UPV7 400 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 EPXP11678 715 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 F11P03951 625 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 BMP4P12644 408 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 ELNP15502 786 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPC1P35052 558 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 ADD1P35611 737 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 POU4F2Q12837 409 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLVAPQ9BX97 442 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 LILRA1O75019 489 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 APBA3O96018 575 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 THBS1P07996 1170 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 H2AFB1P0C5Y9 115 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 H2AFB2P0C5Z0 115 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 CHSY3Q70JA7 882 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 RNF135Q8IUD6 432 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRIM11Q96F44 468 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZBTB3Q9H5J0 574 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 C2CD2LO14523 706 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 HRCP23327 699 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 GJA5P36382 358 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 NBPF15Q8N660 670 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-170P-201ENST00000362832 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-170P-201ENST00000362832 NEURL1BA8MQ27 555 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARAFP10398 606 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-170P-201ENST00000362832 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-170P-201ENST00000362832 RAB15P59190 212 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRRT3Q5FWE3 981 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC27A3Q5K4L6 730 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-170P-201ENST00000362832 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZBTB33Q86T24 672 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-170P-201ENST00000362832 TSC1Q92574 1164 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCDC102AQ96A19 550 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-170P-201ENST00000362832 RNF114Q9Y508 228 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPDYE3A6NKU9 549 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-170P-201ENST00000362832 MEN1O00255 615 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-170P-201ENST00000362832 IRAK1P51617 712 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-170P-201ENST00000362832 WDR44Q5JSH3 913 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-170P-201ENST00000362832 PDXDC2PQ6P474 469 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-170P-201ENST00000362832 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-170P-201ENST00000362832 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-170P-201ENST00000362832 ERVH48-1M5A8F1 160 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-170P-201ENST00000362832 WASLO00401 505 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-170P-201ENST00000362832 FGFR3P22607 806 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-170P-201ENST00000362832 JAG1P78504 1218 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-170P-201ENST00000362832 CTBSQ01459 385 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-170P-201ENST00000362832 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-170P-201ENST00000362832 LBRQ14739 615 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-170P-201ENST00000362832 NBPF20Q3BBV1 942 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.5 ms