RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362752.1

RN7SKP20-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 20, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP20, Length 313 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP20-201ENST00000362752 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
RN7SKP20-201ENST00000362752 FANCIQ9NVI1 1328 aa16.02■□□□□ 0.16
RN7SKP20-201ENST00000362752 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
RN7SKP20-201ENST00000362752 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
RN7SKP20-201ENST00000362752 ZNF428Q96B54 188 aa16.02■□□□□ 0.16
RN7SKP20-201ENST00000362752 CFAP44Q96MT7 982 aa16.02■□□□□ 0.16
RN7SKP20-201ENST00000362752 BABAM1Q9NWV8 329 aa16.02■□□□□ 0.16
RN7SKP20-201ENST00000362752 NRAPQ86VF7 1730 aa16.02■□□□□ 0.15
RN7SKP20-201ENST00000362752 WNK3Q9BYP7 1800 aa16.01■□□□□ 0.15
RN7SKP20-201ENST00000362752 GNAT3A8MTJ3 354 aa16.01■□□□□ 0.15
RN7SKP20-201ENST00000362752 CHRNA2Q15822 529 aa16.01■□□□□ 0.15
RN7SKP20-201ENST00000362752 CRB1P82279 1406 aa16.01■□□□□ 0.15
RN7SKP20-201ENST00000362752 SCN11AQ9UI33 1791 aa16■□□□□ 0.15
RN7SKP20-201ENST00000362752 USHBP1Q8N6Y0 703 aa16■□□□□ 0.15
RN7SKP20-201ENST00000362752 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
RN7SKP20-201ENST00000362752 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa16■□□□□ 0.15
RN7SKP20-201ENST00000362752 JCADQ9P266 1359 aa16■□□□□ 0.15
RN7SKP20-201ENST00000362752 PLEKHG5O94827 1062 aa15.99■□□□□ 0.15
RN7SKP20-201ENST00000362752 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa15.99■□□□□ 0.15
RN7SKP20-201ENST00000362752 RRP1P56182 461 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
RN7SKP20-201ENST00000362752 AKAP4Q5JQC9 854 aa15.99■□□□□ 0.15
RN7SKP20-201ENST00000362752 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
RN7SKP20-201ENST00000362752 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa15.99■□□□□ 0.15
RN7SKP20-201ENST00000362752 CARD10Q9BWT7 1032 aa15.99■□□□□ 0.15
RN7SKP20-201ENST00000362752 NLRP2Q9NX02 1062 aa15.99■□□□□ 0.15
RN7SKP20-201ENST00000362752 PIP4K2BP78356 416 aa15.98■□□□□ 0.15
RN7SKP20-201ENST00000362752 MEGF6O75095 1541 aa15.98■□□□□ 0.15
RN7SKP20-201ENST00000362752 KDM3BQ7LBC6 1761 aa15.98■□□□□ 0.15
RN7SKP20-201ENST00000362752 FAM83GA6ND36 823 aa15.97■□□□□ 0.15
RN7SKP20-201ENST00000362752 TATP17735 454 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RN7SKP20-201ENST00000362752 CHL1O00533 1208 aa15.96■□□□□ 0.15
RN7SKP20-201ENST00000362752 SPG7Q9UQ90 795 aa15.96■□□□□ 0.15
RN7SKP20-201ENST00000362752 SHANK3Q9BYB0 1731 aa15.96■□□□□ 0.15
RN7SKP20-201ENST00000362752 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
RN7SKP20-201ENST00000362752 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa15.95■□□□□ 0.14
RN7SKP20-201ENST00000362752 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
RN7SKP20-201ENST00000362752 FKBP8Q14318 412 aa15.95■□□□□ 0.14
RN7SKP20-201ENST00000362752 C1orf141Q5JVX7 400 aa15.95■□□□□ 0.14
RN7SKP20-201ENST00000362752 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
RN7SKP20-201ENST00000362752 ALDH1L2Q3SY69 923 aa15.94■□□□□ 0.14
RN7SKP20-201ENST00000362752 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
RN7SKP20-201ENST00000362752 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa15.94■□□□□ 0.14
RN7SKP20-201ENST00000362752 MCM10Q7L590 875 aa15.94■□□□□ 0.14
RN7SKP20-201ENST00000362752 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RN7SKP20-201ENST00000362752 MBIPQ9NS73 344 aa15.94■□□□□ 0.14
RN7SKP20-201ENST00000362752 SLIT2O94813 1529 aa15.94■□□□□ 0.14
RN7SKP20-201ENST00000362752 CACNA1FO60840 1977 aa15.93■□□□□ 0.14
RN7SKP20-201ENST00000362752 MRC1P22897 1456 aa15.93■□□□□ 0.14
RN7SKP20-201ENST00000362752 RARSP54136 660 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
RN7SKP20-201ENST00000362752 EVA1CP58658 441 aa15.93■□□□□ 0.14
RN7SKP20-201ENST00000362752 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
RN7SKP20-201ENST00000362752 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
RN7SKP20-201ENST00000362752 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
RN7SKP20-201ENST00000362752 DCTN1Q14203 1278 aa15.92■□□□□ 0.14
RN7SKP20-201ENST00000362752 BTG4Q9NY30 223 aa15.92■□□□□ 0.14
RN7SKP20-201ENST00000362752 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
RN7SKP20-201ENST00000362752 IL17REQ8NFR9 667 aa15.91■□□□□ 0.14
RN7SKP20-201ENST00000362752 DISP2A7MBM2 1401 aa15.91■□□□□ 0.14
RN7SKP20-201ENST00000362752 IL2RBP14784 551 aa15.9■□□□□ 0.14
RN7SKP20-201ENST00000362752 IFNL2Q8IZJ0 200 aa15.9■□□□□ 0.14
RN7SKP20-201ENST00000362752 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
RN7SKP20-201ENST00000362752 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa15.9■□□□□ 0.14
RN7SKP20-201ENST00000362752 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa15.9■□□□□ 0.14
RN7SKP20-201ENST00000362752 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
RN7SKP20-201ENST00000362752 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
RN7SKP20-201ENST00000362752 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
RN7SKP20-201ENST00000362752 KIF16BQ96L93 1317 aa15.89■□□□□ 0.13
RN7SKP20-201ENST00000362752 LRP6O75581 1613 aa15.88■□□□□ 0.13
RN7SKP20-201ENST00000362752 RNMTO43148 476 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
RN7SKP20-201ENST00000362752 MS4A1P11836 297 aa15.88■□□□□ 0.13
RN7SKP20-201ENST00000362752 PHKG2P15735 406 aa15.88■□□□□ 0.13
RN7SKP20-201ENST00000362752 PDE3AQ14432 1141 aa15.88■□□□□ 0.13
RN7SKP20-201ENST00000362752 CHMP4AQ9BY43 222 aa15.88■□□□□ 0.13
RN7SKP20-201ENST00000362752 STRN4Q9NRL3 753 aa15.88■□□□□ 0.13
RN7SKP20-201ENST00000362752 TSPYL4Q9UJ04 414 aa15.88■□□□□ 0.13
RN7SKP20-201ENST00000362752 VAMP4O75379 141 aa15.87■□□□□ 0.13
RN7SKP20-201ENST00000362752 TEFQ10587 303 aa15.87■□□□□ 0.13
RN7SKP20-201ENST00000362752 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
RN7SKP20-201ENST00000362752 DCAF5Q96JK2 942 aa15.87■□□□□ 0.13
RN7SKP20-201ENST00000362752 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
RN7SKP20-201ENST00000362752 HOXB7P09629 217 aa15.86■□□□□ 0.13
RN7SKP20-201ENST00000362752 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
RN7SKP20-201ENST00000362752 BCAR3O75815 825 aa15.85■□□□□ 0.13
RN7SKP20-201ENST00000362752 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
RN7SKP20-201ENST00000362752 PPP4R2Q9NY27 417 aa15.85■□□□□ 0.13
RN7SKP20-201ENST00000362752 PAPPAQ13219 1627 aa15.85■□□□□ 0.13
RN7SKP20-201ENST00000362752 AAMPQ13685 434 aa15.84■□□□□ 0.13
RN7SKP20-201ENST00000362752 ARHGAP45Q92619 1136 aa15.84■□□□□ 0.13
RN7SKP20-201ENST00000362752 LGR6Q9HBX8 967 aa15.84■□□□□ 0.13
RN7SKP20-201ENST00000362752 SMC4Q9NTJ3 1288 aa15.84■□□□□ 0.13
RN7SKP20-201ENST00000362752 TNS2Q63HR2 1409 aa15.84■□□□□ 0.13
RN7SKP20-201ENST00000362752 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
RN7SKP20-201ENST00000362752 CYP27B1O15528 508 aa15.83■□□□□ 0.12
RN7SKP20-201ENST00000362752 ADAMTS2O95450 1211 aa15.83■□□□□ 0.12
RN7SKP20-201ENST00000362752 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa15.83■□□□□ 0.12
RN7SKP20-201ENST00000362752 C8orf58Q8NAV2 365 aa15.83■□□□□ 0.12
RN7SKP20-201ENST00000362752 SSH1Q8WYL5 1049 aa15.83■□□□□ 0.12
RN7SKP20-201ENST00000362752 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa15.83■□□□□ 0.12
RN7SKP20-201ENST00000362752 UBR2Q8IWV8 1755 aa15.82■□□□□ 0.12
RN7SKP20-201ENST00000362752 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 125.1 ms