RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345807.6

CLTB-202, Transcript of clathrin light chain B, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLTB, Length 1,161 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTB-202ENST00000345807 INSRP06213 1382 aa31.55■■■□□ 2.64
CLTB-202ENST00000345807 FLT4P35916 1363 aa31.55■■■□□ 2.64
CLTB-202ENST00000345807 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP31.54■■■□□ 2.64
CLTB-202ENST00000345807 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP31.54■■■□□ 2.64
CLTB-202ENST00000345807 KIF24Q5T7B8 1368 aa31.54■■■□□ 2.64
CLTB-202ENST00000345807 LRRC4BQ9NT99 713 aa31.53■■■□□ 2.64
CLTB-202ENST00000345807 DOT1LQ8TEK3 1739 aa31.52■■■□□ 2.64
CLTB-202ENST00000345807 CGNL1Q0VF96 1302 aa31.52■■■□□ 2.64
CLTB-202ENST00000345807 PTGER2P43116 358 aa31.52■■■□□ 2.64
CLTB-202ENST00000345807 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP31.52■■■□□ 2.64
CLTB-202ENST00000345807 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa31.51■■■□□ 2.63
CLTB-202ENST00000345807 ZNF827Q17R98 1081 aa31.49■■■□□ 2.63
CLTB-202ENST00000345807 MTFR1LQ9H019 292 aa31.49■■■□□ 2.63
CLTB-202ENST00000345807 TATP17735 454 aaPredicted RBP31.48■■■□□ 2.63
CLTB-202ENST00000345807 SLC27A3Q5K4L6 730 aa31.48■■■□□ 2.63
CLTB-202ENST00000345807 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa31.48■■■□□ 2.63
CLTB-202ENST00000345807 NSD2O96028 1365 aa31.47■■■□□ 2.63
CLTB-202ENST00000345807 POLR3GLQ9BT43 218 aa31.46■■■□□ 2.63
CLTB-202ENST00000345807 DCAF8L1A6NGE4 600 aa31.45■■■□□ 2.63
CLTB-202ENST00000345807 AKT1S1Q96B36 256 aa31.43■■■□□ 2.62
CLTB-202ENST00000345807 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
CLTB-202ENST00000345807 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP31.41■■■□□ 2.62
CLTB-202ENST00000345807 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
CLTB-202ENST00000345807 SGIP1Q9BQI5 828 aa31.41■■■□□ 2.62
CLTB-202ENST00000345807 LY75O60449 1722 aa31.41■■■□□ 2.62
CLTB-202ENST00000345807 KCNQ4P56696 695 aa31.4■■■□□ 2.62
CLTB-202ENST00000345807 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa31.4■■■□□ 2.62
CLTB-202ENST00000345807 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa31.4■■■□□ 2.62
CLTB-202ENST00000345807 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa31.4■■■□□ 2.62
CLTB-202ENST00000345807 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
CLTB-202ENST00000345807 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
CLTB-202ENST00000345807 QSER1Q2KHR3 1735 aa31.37■■■□□ 2.61
CLTB-202ENST00000345807 WASHC2AQ641Q2 1341 aa31.36■■■□□ 2.61
CLTB-202ENST00000345807 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
CLTB-202ENST00000345807 YY1P25490 414 aa31.35■■■□□ 2.61
CLTB-202ENST00000345807 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa31.35■■■□□ 2.61
CLTB-202ENST00000345807 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
CLTB-202ENST00000345807 NCAPD2Q15021 1401 aa31.34■■■□□ 2.61
CLTB-202ENST00000345807 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa31.34■■■□□ 2.61
CLTB-202ENST00000345807 ARXQ96QS3 562 aa31.34■■■□□ 2.61
CLTB-202ENST00000345807 SYT17Q9BSW7 474 aa31.34■■■□□ 2.61
CLTB-202ENST00000345807 CYP27B1O15528 508 aa31.33■■■□□ 2.61
CLTB-202ENST00000345807 POLKQ9UBT6 870 aa31.33■■■□□ 2.61
CLTB-202ENST00000345807 SLC16A10Q8TF71 515 aa31.32■■■□□ 2.6
CLTB-202ENST00000345807 PKD1L3Q7Z443 1732 aa31.32■■■□□ 2.6
CLTB-202ENST00000345807 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa31.31■■■□□ 2.6
CLTB-202ENST00000345807 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP31.29■■■□□ 2.6
CLTB-202ENST00000345807 EYA1Q99502 592 aa31.29■■■□□ 2.6
CLTB-202ENST00000345807 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa31.28■■■□□ 2.6
CLTB-202ENST00000345807 PANK3Q9H999 370 aa31.28■■■□□ 2.6
CLTB-202ENST00000345807 SPG7Q9UQ90 795 aa31.27■■■□□ 2.6
CLTB-202ENST00000345807 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa31.27■■■□□ 2.6
CLTB-202ENST00000345807 POLD1P28340 1107 aa31.24■■■□□ 2.59
CLTB-202ENST00000345807 PALLDQ8WX93 1383 aa31.24■■■□□ 2.59
CLTB-202ENST00000345807 MAP3K5Q99683 1374 aa31.24■■■□□ 2.59
CLTB-202ENST00000345807 COL24A1Q17RW2 1714 aa31.24■■■□□ 2.59
CLTB-202ENST00000345807 ITGB4P16144 1822 aa31.23■■■□□ 2.59
CLTB-202ENST00000345807 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
CLTB-202ENST00000345807 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP31.22■■■□□ 2.59
CLTB-202ENST00000345807 C5P01031 1676 aa31.22■■■□□ 2.59
CLTB-202ENST00000345807 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP31.21■■■□□ 2.59
CLTB-202ENST00000345807 MSH5O43196 834 aa31.19■■■□□ 2.58
CLTB-202ENST00000345807 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
CLTB-202ENST00000345807 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP31.19■■■□□ 2.58
CLTB-202ENST00000345807 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP31.19■■■□□ 2.58
CLTB-202ENST00000345807 PIGBQ92521 554 aa31.18■■■□□ 2.58
CLTB-202ENST00000345807 KLHL34Q8N239 644 aa31.17■■■□□ 2.58
CLTB-202ENST00000345807 TAF1LQ8IZX4 1826 aa31.16■■■□□ 2.58
CLTB-202ENST00000345807 IFNL2Q8IZJ0 200 aa31.15■■■□□ 2.58
CLTB-202ENST00000345807 PHKG2P15735 406 aa31.14■■■□□ 2.58
CLTB-202ENST00000345807 MORC1Q86VD1 984 aa31.13■■■□□ 2.57
CLTB-202ENST00000345807 IGSF1Q8N6C5 1336 aa31.13■■■□□ 2.57
CLTB-202ENST00000345807 TMOD3Q9NYL9 352 aa31.12■■■□□ 2.57
CLTB-202ENST00000345807 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa31.12■■■□□ 2.57
CLTB-202ENST00000345807 C4BP0C0L5 1744 aa31.11■■■□□ 2.57
CLTB-202ENST00000345807 FLAD1Q8NFF5 587 aa31.1■■■□□ 2.57
CLTB-202ENST00000345807 KNSTRNQ9Y448 316 aa31.1■■■□□ 2.57
CLTB-202ENST00000345807 MSL1Q68DK7 614 aa31.08■■■□□ 2.57
CLTB-202ENST00000345807 AK7Q96M32 723 aa31.08■■■□□ 2.57
CLTB-202ENST00000345807 UTRNP46939 3433 aa31.07■■■□□ 2.56
CLTB-202ENST00000345807 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa31.06■■■□□ 2.56
CLTB-202ENST00000345807 SIK1P57059 783 aa31.06■■■□□ 2.56
CLTB-202ENST00000345807 GPR162Q16538 588 aa31.06■■■□□ 2.56
CLTB-202ENST00000345807 ASAP1Q9ULH1 1129 aa31.06■■■□□ 2.56
CLTB-202ENST00000345807 NLGN2Q8NFZ4 835 aa31.04■■■□□ 2.56
CLTB-202ENST00000345807 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP31.03■■■□□ 2.56
CLTB-202ENST00000345807 KIF7Q2M1P5 1343 aa31.02■■■□□ 2.56
CLTB-202ENST00000345807 AMIGO3Q86WK7 504 aa31.02■■■□□ 2.56
CLTB-202ENST00000345807 LINC00116Q8NCU8 138 aa31.02■■■□□ 2.56
CLTB-202ENST00000345807 CHD4Q14839 1912 aa31.02■■■□□ 2.56
CLTB-202ENST00000345807 UBR3Q6ZT12 1888 aa31.01■■■□□ 2.56
CLTB-202ENST00000345807 ATG3Q9NT62 314 aa31.01■■■□□ 2.55
CLTB-202ENST00000345807 PHF14O94880 888 aa31■■■□□ 2.55
CLTB-202ENST00000345807 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
CLTB-202ENST00000345807 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
CLTB-202ENST00000345807 ATP6V1AP38606 617 aa30.99■■■□□ 2.55
CLTB-202ENST00000345807 AMOTQ4VCS5 1084 aa30.99■■■□□ 2.55
CLTB-202ENST00000345807 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP30.99■■■□□ 2.55
CLTB-202ENST00000345807 AEBP1Q8IUX7 1158 aa30.99■■■□□ 2.55
CLTB-202ENST00000345807 DCAF5Q96JK2 942 aa30.99■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms