RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.74■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 BRMS1Q9HCU9 246 aa24.74■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 BRPF3Q9ULD4 1205 aa24.74■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.73■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 MBIPQ9NS73 344 aa24.73■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 CEP126Q9P2H0 1117 aa24.73■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.73■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 FAM83GA6ND36 823 aa24.73■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa24.73■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa24.73■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 CCDC39Q9UFE4 941 aa24.73■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 HOMER1Q86YM7 354 aa24.72■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.72■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 KINO60870 393 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 RAB11FIP3O75154 756 aa24.72■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 IGHDP01880 384 aa24.72■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 PDRG1Q9NUG6 133 aa24.71■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 MTMR7Q9Y216 660 aa24.71■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 PTPRCP08575 1304 aa24.7■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 ATP2B1P20020 1258 aa24.7■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 TNRQ92752 1358 aa24.69■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 MPHOSPH8Q99549 860 aa24.69■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 PZPP20742 1482 aa24.69■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 FLIIQ13045 1269 aa24.69■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 OLFM4Q6UX06 510 aa24.69■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.68■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 STK38Q15208 465 aa24.68■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 CEP89Q96ST8 783 aa24.67■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 DISP1Q96F81 1524 aa24.67■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 TRIM5Q9C035 493 aa24.67■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.67■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.66■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 PDE4CQ08493 712 aa24.66■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 KRT85P78386 507 aa24.66■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa24.65■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 MYD88Q99836 296 aa24.65■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 NACAP1Q9BZK3 213 aa24.65■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa24.64■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 CCDC173Q0VFZ6 552 aa24.64■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 FAM13BQ9NYF5 915 aa24.64■■□□□ 1.54
NISCH-201ENST00000345716 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
NISCH-201ENST00000345716 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
NISCH-201ENST00000345716 KRT32Q14532 448 aa24.64■■□□□ 1.53
NISCH-201ENST00000345716 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
NISCH-201ENST00000345716 CASTP20810 708 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
NISCH-201ENST00000345716 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa24.63■■□□□ 1.53
NISCH-201ENST00000345716 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.62■■□□□ 1.53
NISCH-201ENST00000345716 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
NISCH-201ENST00000345716 GRPEL1Q9HAV7 217 aa24.62■■□□□ 1.53
NISCH-201ENST00000345716 STARD3NLO95772 234 aa24.62■■□□□ 1.53
NISCH-201ENST00000345716 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.62■■□□□ 1.53
NISCH-201ENST00000345716 CTNNA3Q9UI47 895 aa24.61■■□□□ 1.53
NISCH-201ENST00000345716 STK11IPQ8N1F8 1099 aa24.61■■□□□ 1.53
NISCH-201ENST00000345716 TBC1D2Q9BYX2 928 aa24.61■■□□□ 1.53
NISCH-201ENST00000345716 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.61■■□□□ 1.53
NISCH-201ENST00000345716 BOLA2Q9H3K6 86 aa24.61■■□□□ 1.53
NISCH-201ENST00000345716 FMNL2Q96PY5 1086 aa24.6■■□□□ 1.53
NISCH-201ENST00000345716 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.6■■□□□ 1.53
NISCH-201ENST00000345716 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
NISCH-201ENST00000345716 HYPKQ9NX55 129 aa24.6■■□□□ 1.53
NISCH-201ENST00000345716 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
NISCH-201ENST00000345716 BMP2KLQ5H9B9 411 aa24.59■■□□□ 1.53
NISCH-201ENST00000345716 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
NISCH-201ENST00000345716 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.59■■□□□ 1.53
NISCH-201ENST00000345716 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.59■■□□□ 1.53
NISCH-201ENST00000345716 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
NISCH-201ENST00000345716 CCDC192P0DO97 292 aa24.59■■□□□ 1.53
NISCH-201ENST00000345716 ARHGAP45Q92619 1136 aa24.59■■□□□ 1.53
NISCH-201ENST00000345716 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.59■■□□□ 1.53
NISCH-201ENST00000345716 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
NISCH-201ENST00000345716 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.58■■□□□ 1.53
NISCH-201ENST00000345716 ME1P48163 572 aa24.58■■□□□ 1.53
NISCH-201ENST00000345716 JMYQ8N9B5 988 aa24.58■■□□□ 1.53
NISCH-201ENST00000345716 TNMDQ9H2S6 317 aa24.58■■□□□ 1.53
NISCH-201ENST00000345716 TRIM22Q8IYM9 498 aa24.58■■□□□ 1.52
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