RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.41■■□□□ 1.82
PTPRM-201ENST00000332175 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.41■■□□□ 1.82
PTPRM-201ENST00000332175 NEFHP12036 1026 aa26.41■■□□□ 1.82
PTPRM-201ENST00000332175 DCTN1Q14203 1278 aa26.41■■□□□ 1.82
PTPRM-201ENST00000332175 USHBP1Q8N6Y0 703 aa26.41■■□□□ 1.82
PTPRM-201ENST00000332175 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
PTPRM-201ENST00000332175 SPATA32Q96LK8 384 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRM-201ENST00000332175 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
PTPRM-201ENST00000332175 H0YHG0 523 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRM-201ENST00000332175 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
PTPRM-201ENST00000332175 DDX11Q96FC9 970 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPRM-201ENST00000332175 NSD3Q9BZ95 1437 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC181Q5TID7 509 aa26.39■■□□□ 1.81
PTPRM-201ENST00000332175 AIDAQ96BJ3 306 aa26.39■■□□□ 1.81
PTPRM-201ENST00000332175 METTL24Q5JXM2 366 aa26.38■■□□□ 1.81
PTPRM-201ENST00000332175 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.38■■□□□ 1.81
PTPRM-201ENST00000332175 CDKL5O76039 1030 aa26.38■■□□□ 1.81
PTPRM-201ENST00000332175 NESP48681 1621 aa26.38■■□□□ 1.81
PTPRM-201ENST00000332175 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPRM-201ENST00000332175 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPRM-201ENST00000332175 CTNNA3Q9UI47 895 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM57Q8N5G2 664 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPRM-201ENST00000332175 ANKRD62A6NC57 917 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPRM-201ENST00000332175 STARD3NLO95772 234 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPRM-201ENST00000332175 CASTP20810 708 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
PTPRM-201ENST00000332175 NFE2L2Q16236 605 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPRM-201ENST00000332175 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
PTPRM-201ENST00000332175 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
PTPRM-201ENST00000332175 MYD88Q99836 296 aa26.35■■□□□ 1.81
PTPRM-201ENST00000332175 FCHSD2O94868 740 aa26.34■■□□□ 1.81
PTPRM-201ENST00000332175 ATAD2Q6PL18 1390 aa26.34■■□□□ 1.81
PTPRM-201ENST00000332175 ERLIN2O94905 339 aa26.34■■□□□ 1.81
PTPRM-201ENST00000332175 RBM10P98175 930 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
PTPRM-201ENST00000332175 BRPF3Q9ULD4 1205 aa26.34■■□□□ 1.81
PTPRM-201ENST00000332175 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
PTPRM-201ENST00000332175 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.34■■□□□ 1.81
PTPRM-201ENST00000332175 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.34■■□□□ 1.81
PTPRM-201ENST00000332175 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.33■■□□□ 1.81
PTPRM-201ENST00000332175 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
PTPRM-201ENST00000332175 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.33■■□□□ 1.8
PTPRM-201ENST00000332175 CEP57L1Q8IYX8 460 aa26.32■■□□□ 1.8
PTPRM-201ENST00000332175 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
PTPRM-201ENST00000332175 HECW1Q76N89 1606 aa26.32■■□□□ 1.8
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC184Q52MB2 194 aa26.32■■□□□ 1.8
PTPRM-201ENST00000332175 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.32■■□□□ 1.8
PTPRM-201ENST00000332175 MINDY4BA8MYZ0 360 aa26.31■■□□□ 1.8
PTPRM-201ENST00000332175 CHMP4BP1P59074 171 aa26.31■■□□□ 1.8
PTPRM-201ENST00000332175 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
PTPRM-201ENST00000332175 TSPYL1Q9H0U9 437 aa26.31■■□□□ 1.8
PTPRM-201ENST00000332175 DAPK1P53355 1430 aa26.3■■□□□ 1.8
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC191Q8NCU4 936 aa26.3■■□□□ 1.8
PTPRM-201ENST00000332175 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
PTPRM-201ENST00000332175 ZPR1O75312 459 aa26.3■■□□□ 1.8
PTPRM-201ENST00000332175 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
PTPRM-201ENST00000332175 CENPHQ9H3R5 247 aa26.3■■□□□ 1.8
PTPRM-201ENST00000332175 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
PTPRM-201ENST00000332175 CBFA2T2O43439 604 aa26.29■■□□□ 1.8
PTPRM-201ENST00000332175 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.29■■□□□ 1.8
PTPRM-201ENST00000332175 ADAMTS2O95450 1211 aa26.29■■□□□ 1.8
PTPRM-201ENST00000332175 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa26.29■■□□□ 1.8
PTPRM-201ENST00000332175 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.29■■□□□ 1.8
PTPRM-201ENST00000332175 CAMK4Q16566 473 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRM-201ENST00000332175 TMOD2Q9NZR1 351 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRM-201ENST00000332175 CFAP45Q9UL16 551 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRM-201ENST00000332175 FAM193AP78312 1265 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRM-201ENST00000332175 NUP62CLQ9H1M0 184 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRM-201ENST00000332175 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
PTPRM-201ENST00000332175 GOLGA6L10A6NI86 522 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRM-201ENST00000332175 KRT32Q14532 448 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRM-201ENST00000332175 BOLA2Q9H3K6 86 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRM-201ENST00000332175 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
PTPRM-201ENST00000332175 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRM-201ENST00000332175 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRM-201ENST00000332175 BACH2Q9BYV9 841 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRM-201ENST00000332175 SYNJ1O43426 1573 aa26.26■■□□□ 1.8
PTPRM-201ENST00000332175 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 SSR1P43307 286 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC83Q8IWF9 413 aa26.26■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 CAVIN4Q5BKX8 364 aa26.26■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.26■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF652Q9Y2D9 606 aa26.25■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 NCAPD3P42695 1498 aa26.25■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 IFT140Q96RY7 1462 aa26.25■■□□□ 1.79
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PTPRM-201ENST00000332175 MKNK2Q9HBH9 465 aa26.24■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 TAX1BP1Q86VP1 789 aa26.24■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
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PTPRM-201ENST00000332175 FERMT3Q86UX7 667 aa26.24■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 EIF5P55010 431 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 LEKR1Q6ZMV7 388 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 NME9Q86XW9 330 aa26.23■■□□□ 1.79
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