RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243893.10

UBE2C-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene UBE2C, Length 476 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-201ENST00000243893 CCDC146Q8IYE0 955 aa27.03■■□□□ 1.92
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UBE2C-201ENST00000243893 WNK3Q9BYP7 1800 aa27.02■■□□□ 1.92
UBE2C-201ENST00000243893 PHACTR3Q96KR7 559 aa27.02■■□□□ 1.92
UBE2C-201ENST00000243893 GLI3P10071 1580 aa27.01■■□□□ 1.92
UBE2C-201ENST00000243893 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
UBE2C-201ENST00000243893 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
UBE2C-201ENST00000243893 NGEFQ8N5V2 710 aa26.99■■□□□ 1.91
UBE2C-201ENST00000243893 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.99■■□□□ 1.91
UBE2C-201ENST00000243893 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26.99■■□□□ 1.91
UBE2C-201ENST00000243893 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
UBE2C-201ENST00000243893 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
UBE2C-201ENST00000243893 SPG7Q9UQ90 795 aa26.98■■□□□ 1.91
UBE2C-201ENST00000243893 APAF1O14727 1248 aa26.97■■□□□ 1.91
UBE2C-201ENST00000243893 NFE2L2Q16236 605 aa26.96■■□□□ 1.91
UBE2C-201ENST00000243893 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
UBE2C-201ENST00000243893 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.95■■□□□ 1.91
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UBE2C-201ENST00000243893 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
UBE2C-201ENST00000243893 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
UBE2C-201ENST00000243893 TNS2Q63HR2 1409 aa26.95■■□□□ 1.9
UBE2C-201ENST00000243893 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
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UBE2C-201ENST00000243893 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26.92■■□□□ 1.9
UBE2C-201ENST00000243893 EXOC5O00471 708 aa26.91■■□□□ 1.9
UBE2C-201ENST00000243893 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
UBE2C-201ENST00000243893 LRRC37A3O60309 1634 aa26.9■■□□□ 1.9
UBE2C-201ENST00000243893 DDB1Q16531 1140 aa26.9■■□□□ 1.9
UBE2C-201ENST00000243893 AKAP4Q5JQC9 854 aa26.9■■□□□ 1.9
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UBE2C-201ENST00000243893 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.89■■□□□ 1.9
UBE2C-201ENST00000243893 CCDC27Q2M243 656 aa26.89■■□□□ 1.9
UBE2C-201ENST00000243893 MAP3K5Q99683 1374 aa26.88■■□□□ 1.89
UBE2C-201ENST00000243893 RXRBP28702 533 aa26.88■■□□□ 1.89
UBE2C-201ENST00000243893 RIPK4P57078 832 aa26.88■■□□□ 1.89
UBE2C-201ENST00000243893 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.88■■□□□ 1.89
UBE2C-201ENST00000243893 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.88■■□□□ 1.89
UBE2C-201ENST00000243893 SHANK3Q9BYB0 1731 aa26.87■■□□□ 1.89
UBE2C-201ENST00000243893 GNAT3A8MTJ3 354 aa26.87■■□□□ 1.89
UBE2C-201ENST00000243893 CYP27B1O15528 508 aa26.87■■□□□ 1.89
UBE2C-201ENST00000243893 PHKG2P15735 406 aa26.87■■□□□ 1.89
UBE2C-201ENST00000243893 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.87■■□□□ 1.89
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UBE2C-201ENST00000243893 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
UBE2C-201ENST00000243893 NEUROD2Q15784 382 aa26.84■■□□□ 1.89
UBE2C-201ENST00000243893 SEPT12Q8IYM1 358 aa26.84■■□□□ 1.89
UBE2C-201ENST00000243893 DLG5Q8TDM6 1919 aa26.83■■□□□ 1.89
UBE2C-201ENST00000243893 A0A0G2JS52 829 aa26.83■■□□□ 1.89
UBE2C-201ENST00000243893 MYT1Q01538 1121 aa26.83■■□□□ 1.89
UBE2C-201ENST00000243893 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.83■■□□□ 1.89
UBE2C-201ENST00000243893 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
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UBE2C-201ENST00000243893 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.81■■□□□ 1.88
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UBE2C-201ENST00000243893 DCAF5Q96JK2 942 aa26.8■■□□□ 1.88
UBE2C-201ENST00000243893 ZNF521Q96K83 1311 aa26.8■■□□□ 1.88
UBE2C-201ENST00000243893 PDE3BQ13370 1112 aa26.79■■□□□ 1.88
UBE2C-201ENST00000243893 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa26.79■■□□□ 1.88
UBE2C-201ENST00000243893 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
UBE2C-201ENST00000243893 BCL9O00512 1426 aa26.77■■□□□ 1.88
UBE2C-201ENST00000243893 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
UBE2C-201ENST00000243893 RGS12O14924 1447 aa26.76■■□□□ 1.87
UBE2C-201ENST00000243893 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.76■■□□□ 1.87
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UBE2C-201ENST00000243893 WDR63Q8IWG1 891 aa26.76■■□□□ 1.87
UBE2C-201ENST00000243893 IL17REQ8NFR9 667 aa26.76■■□□□ 1.87
UBE2C-201ENST00000243893 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
UBE2C-201ENST00000243893 MCM10Q7L590 875 aa26.74■■□□□ 1.87
UBE2C-201ENST00000243893 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
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UBE2C-201ENST00000243893 IL16Q14005 1332 aa26.73■■□□□ 1.87
UBE2C-201ENST00000243893 MRC1P22897 1456 aa26.73■■□□□ 1.87
UBE2C-201ENST00000243893 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.72■■□□□ 1.87
UBE2C-201ENST00000243893 DCTN1Q14203 1278 aa26.72■■□□□ 1.87
UBE2C-201ENST00000243893 KRT27Q7Z3Y8 459 aa26.72■■□□□ 1.87
UBE2C-201ENST00000243893 LGR6Q9HBX8 967 aa26.72■■□□□ 1.87
UBE2C-201ENST00000243893 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
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UBE2C-201ENST00000243893 TEFQ10587 303 aa26.68■■□□□ 1.86
UBE2C-201ENST00000243893 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.68■■□□□ 1.86
UBE2C-201ENST00000243893 BABAM1Q9NWV8 329 aa26.68■■□□□ 1.86
UBE2C-201ENST00000243893 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
UBE2C-201ENST00000243893 IFT57Q9NWB7 429 aa26.67■■□□□ 1.86
UBE2C-201ENST00000243893 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa26.67■■□□□ 1.86
UBE2C-201ENST00000243893 ZNF853P0CG23 659 aa26.65■■□□□ 1.86
UBE2C-201ENST00000243893 CABP4P57796 275 aa26.65■■□□□ 1.86
UBE2C-201ENST00000243893 GNAI1P63096 354 aa26.65■■□□□ 1.86
UBE2C-201ENST00000243893 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
UBE2C-201ENST00000243893 CFAP44Q96MT7 982 aa26.65■■□□□ 1.86
UBE2C-201ENST00000243893 FAM196AQ6ZSG2 479 aa26.64■■□□□ 1.86
UBE2C-201ENST00000243893 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
UBE2C-201ENST00000243893 DOT1LQ8TEK3 1739 aa26.63■■□□□ 1.85
UBE2C-201ENST00000243893 E9PSI1 815 aa26.63■■□□□ 1.85
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