RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 ARNTLO00327 626 aa9.82□□□□□ -0.84
HCG18-242ENST00000602319 SCO2O43819 266 aa9.82□□□□□ -0.84
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HCG18-242ENST00000602319 WARSP23381 471 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
HCG18-242ENST00000602319 TGFBR2P37173 567 aa9.82□□□□□ -0.84
HCG18-242ENST00000602319 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
HCG18-242ENST00000602319 GEMP55040 296 aa9.82□□□□□ -0.84
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HCG18-242ENST00000602319 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
HCG18-242ENST00000602319 POU6F1Q14863 301 aa9.82□□□□□ -0.84
HCG18-242ENST00000602319 MEP1AQ16819 746 aa9.82□□□□□ -0.84
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HCG18-242ENST00000602319 AFMIDQ63HM1 303 aa9.82□□□□□ -0.84
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HCG18-242ENST00000602319 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa9.82□□□□□ -0.84
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HCG18-242ENST00000602319 GIMAP2Q9UG22 337 aa9.82□□□□□ -0.84
HCG18-242ENST00000602319 A0A087WZ62 844 aa9.82□□□□□ -0.84
HCG18-242ENST00000602319 FAM234BA2RU67 622 aa9.82□□□□□ -0.84
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HCG18-242ENST00000602319 IL1RNP18510 177 aa9.82□□□□□ -0.84
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HCG18-242ENST00000602319 SLC12A2P55011 1212 aa9.82□□□□□ -0.84
HCG18-242ENST00000602319 CXCR4P61073 352 aa9.82□□□□□ -0.84
HCG18-242ENST00000602319 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
HCG18-242ENST00000602319 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
HCG18-242ENST00000602319 RAB41Q5JT25 222 aa9.82□□□□□ -0.84
HCG18-242ENST00000602319 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
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HCG18-242ENST00000602319 HID1Q8IV36 788 aa9.82□□□□□ -0.84
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HCG18-242ENST00000602319 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
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HCG18-242ENST00000602319 ATOH8Q96SQ7 321 aa9.82□□□□□ -0.84
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HCG18-242ENST00000602319 LIMK1P53667 647 aa9.81□□□□□ -0.84
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HCG18-242ENST00000602319 GLYATQ6IB77 296 aa9.81□□□□□ -0.84
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HCG18-242ENST00000602319 FATE1Q969F0 183 aa9.81□□□□□ -0.84
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HCG18-242ENST00000602319 NSMCE2Q96MF7 247 aa9.81□□□□□ -0.84
HCG18-242ENST00000602319 MFSD1Q9H3U5 465 aa9.81□□□□□ -0.84
HCG18-242ENST00000602319 HOXC10Q9NYD6 342 aa9.81□□□□□ -0.84
HCG18-242ENST00000602319 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP9.81□□□□□ -0.84
HCG18-242ENST00000602319 FAM172BPA6NC97 362 aa9.81□□□□□ -0.84
HCG18-242ENST00000602319 G3V2T6 193 aa9.81□□□□□ -0.84
HCG18-242ENST00000602319 S1PR4O95977 384 aa9.81□□□□□ -0.84
HCG18-242ENST00000602319 ANXA6P08133 673 aa9.81□□□□□ -0.84
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