RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557021.5

UBE2V1-222, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 V1, human

TSL 5 BASIC

Gene UBE2V1, Length 2,258 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2V1-222	ENST00000557021	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		13.46	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		13.46	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	RAB23	Q9ULC3	237 aa		13.46	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	PI4KA	P42356	2102 aa		13.45	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		13.45	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	OR1I1	O60431	355 aa		13.45	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	ACSL3	O95573	720 aa		13.45	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	FUCA1	P04066	466 aa		13.45	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	CNR2	P34972	360 aa		13.45	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	IRX4	P78413	519 aa		13.45	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	CTBP1	Q13363	440 aa		13.45	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	CRYM	Q14894	314 aa		13.45	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		13.45	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		13.45	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		13.45	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		13.45	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		13.45	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	ZNF398	Q8TD17	642 aa		13.45	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		13.45	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		13.45	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	WDR26	Q9H7D7	661 aa		13.45	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	TREX1	Q9NSU2	369 aa		13.45	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		13.45	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	C10orf142	B7Z368	130 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	PSMD11	O00231	422 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	SDC3	O75056	442 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	MAGEA4	P43358	317 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	PGGT1B	P53609	377 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	CDK3	Q00526	305 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	SPEM2	Q0P670	501 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	NFATC2	Q13469	925 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	PALM2	Q8IXS6	379 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	APOO	Q9BUR5	198 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	IL21R	Q9HBE5	538 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	KLF15	Q9UIH9	416 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	OR2AG2	A6NM03	316 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	POLB	P06746	335 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	MPL	P40238	635 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	PTPN5	P54829	565 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	GPX6	P59796	221 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	KIF19	Q2TAC6	998 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	TMEM135	Q86UB9	458 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	OR4L1	Q8NH43	312 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	OR2AG1	Q9H205	316 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	PGAM1	P18669	254 aa		13.43	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	HADHA	P40939	763 aa		13.43	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	THOP1	P52888	689 aa		13.43	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	BNC1	Q01954	994 aa		13.43	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	13.43	□□□□□ -0.26	3e-9	■■■■□ 21.3
UBE2V1-222	ENST00000557021	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		13.43	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	SYT12	Q8IV01	421 aa		13.43	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	RBFA	Q8N0V3	343 aa		13.43	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	SGF29	Q96ES7	293 aa		13.43	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	PDXP	Q96GD0	296 aa		13.43	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	RANBP9	Q96S59	729 aa		13.43	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		13.43	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		13.43	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		13.43	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		13.43	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		13.43	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021		A0A1W2PR77	199 aa		13.43	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	TLR4	O00206	839 aa		13.43	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	AKT1	P31749	480 aa		13.43	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	NUBP1	P53384	320 aa		13.43	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	PFN3	P60673	137 aa		13.43	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	PDE1B	Q01064	536 aa		13.43	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	C1orf61	Q13536	156 aa		13.43	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	CUL1	Q13616	776 aa		13.43	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		13.43	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		13.43	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		13.43	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		13.43	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	13.43	□□□□□ -0.26
UBE2V1-222	ENST00000557021	GLYATL1	Q969I3	302 aa		13.43	□□□□□ -0.26

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