RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBTB17Q13105 803 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SQSTM1Q13501 440 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP25.98■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MANEAQ5SRI9 462 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLD5Q8N7P1 536 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNTD1Q8N815 330 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR4D9Q8NGE8 314 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MED8Q96G25 268 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DPYSL5Q9BPU6 564 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRKAB1Q9Y478 270 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa25.97■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RGSL1A5PLK6 1076 aa25.97■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNAJC6O75061 913 aa25.97■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FASLGP48023 281 aa25.97■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC37A2Q8TED4 501 aa25.97■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SGF29Q96ES7 293 aa25.97■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COL6A6A6NMZ7 2263 aa25.97■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FADS2P1A8MWK0 482 aa25.96■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 APOL1O14791 398 aa25.96■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TPM1P09493 284 aa25.96■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CSF2RBP32927 897 aa25.96■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGAP25P42331 645 aa25.96■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPLD1P80108 840 aa25.96■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AP1B1Q10567 949 aa25.96■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GALNT3Q14435 633 aa25.96■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC9A4Q6AI14 798 aa25.96■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VASH2Q86V25 355 aa25.96■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VSIG1Q86XK7 387 aa25.96■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DTX1Q86Y01 620 aa25.96■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SFRP1Q8N474 314 aa25.96■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AGBL5Q8NDL9 886 aa25.96■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC38A3Q99624 504 aa25.96■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZMYND15Q9H091 742 aa25.96■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RMI1Q9H9A7 625 aa25.96■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EML2O95834 649 aa25.95■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDK1Q15118 436 aa25.95■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa25.95■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RHOT2Q8IXI1 618 aa25.95■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC42Q96M95 316 aa25.95■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAAR9Q96RI9 348 aa25.95■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHP1Q99653 195 aa25.95■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CEP41Q9BYV8 373 aa25.95■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABHD10Q9NUJ1 306 aa25.95■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPTLC3Q9NUV7 552 aa25.95■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTA2O94776 668 aa25.94■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRT1P04264 644 aa25.94■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 THRAP10827 490 aa25.94■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MPSTP25325 297 aa25.94■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP25.94■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM71Q6P5X7 295 aa25.94■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC112Q8NEF3 446 aa25.94■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR10G6Q8NH81 332 aa25.94■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa25.94■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM9Q9P0T7 183 aa25.94■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBC1D29Q9UFV1 150 aa25.94■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNK6Q9Y257 313 aa25.94■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STMND1H3BQB6 276 aa25.93■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACP5P13686 325 aa25.93■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HHEXQ03014 270 aa25.93■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ODF2Q5BJF6 829 aa25.93■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPNTQ6UXI9 565 aa25.93■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KDELC2Q7Z4H8 507 aa25.93■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NT5DC3Q86UY8 548 aa25.93■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RFX6Q8HWS3 928 aa25.93■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VSTM4Q8IW00 320 aa25.93■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa25.93■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AGAP3Q96P47 875 aa25.93■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIB3Q96RU7 358 aa25.93■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa25.93■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa25.93■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DUX1O43812 170 aa25.92■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM182AQ5T1J6 154 aa25.92■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC38Q5VT99 294 aa25.92■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ART4Q93070 314 aa25.92■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OLFM3Q96PB7 478 aa25.92■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HERPUD2Q9BSE4 406 aa25.92■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPATA16Q9BXB7 569 aa25.92■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC25A51Q9H1U9 297 aa25.92■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CARD9Q9H257 536 aa25.92■■□□□ 1.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85 ms