RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517349.1

SMIM18-201, Transcript of small integral membrane protein 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SMIM18, Length 905 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM18-201ENST00000517349 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
SMIM18-201ENST00000517349 NEURL2Q9BR09 285 aa3.41□□□□□ -1.86
SMIM18-201ENST00000517349 CSTL1Q9H114 145 aa3.41□□□□□ -1.86
SMIM18-201ENST00000517349 ASAH2Q9NR71 780 aa3.41□□□□□ -1.86
SMIM18-201ENST00000517349 PGAP2Q9UHJ9 254 aa3.41□□□□□ -1.86
SMIM18-201ENST00000517349 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa3.41□□□□□ -1.86
SMIM18-201ENST00000517349 A0A1W2PQM1 296 aa3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 NCAM2O15394 837 aa3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 EDIL3O43854 480 aa3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 FTCDO95954 541 aa3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 PAX1P15863 534 aa3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 ZNF23P17027 643 aa3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 ITGA2P17301 1181 aa3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 TIMP3P35625 211 aa3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 GGT5P36269 586 aa3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 MAPK9P45984 424 aa3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 PTP4A2Q12974 167 aa3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 ALFQ53S48 1182 aa3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 DCST1Q5T197 706 aa3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 FAM69AQ5T7M9 428 aa3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 PQLC2Q6ZP29 291 aa3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 HAPLN4Q86UW8 402 aa3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 SLC24A4Q8NFF2 622 aa3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 CADM4Q8NFZ8 388 aa3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 NFKBIDQ8NI38 313 aa3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 RNF125Q96EQ8 232 aa3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 TMEM68Q96MH6 324 aa3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 TMEM47Q9BQJ4 181 aa3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 TKTL2Q9H0I9 626 aa3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 ZNF69Q9UC07 566 aa3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 POLG2Q9UHN1 485 aa3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 SARDHQ9UL12 918 aa3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 PTPRCP08575 1304 aa3.4□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 RRN3P2A6NIE6 340 aa3.39□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 HS3ST1O14792 307 aa3.39□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 ZNHIT1O43257 154 aa3.39□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 CAVIN2O95810 425 aa3.39□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 EGFP01133 1207 aa3.39□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 CFC1BP0CG36 223 aa3.39□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 CFC1P0CG37 223 aa3.39□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 HOXC9P31274 260 aa3.39□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 AMPHP49418 695 aa3.39□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 ERVK11-1P61568 191 aa3.39□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 PMP22Q01453 160 aa3.39□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 OLIG2Q13516 323 aa3.39□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 FGFBP1Q14512 234 aa3.39□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 DECR1Q16698 335 aa3.39□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa3.39□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 SLC27A1Q6PCB7 646 aa3.39□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 QSOX2Q6ZRP7 698 aa3.39□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 GPR180Q86V85 440 aa3.39□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 EPHX4Q8IUS5 362 aa3.39□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 OR2AK2Q8NG84 335 aa3.39□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 HTRA1Q92743 480 aa3.39□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 TAAR8Q969N4 342 aa3.39□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 SCRN2Q96FV2 425 aa3.39□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 PCGF1Q9BSM1 259 aa3.39□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 BARHL1Q9BZE3 327 aa3.39□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 SLC6A13Q9NSD5 602 aa3.39□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 ACSL5Q9ULC5 683 aa3.39□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 OR2W1Q9Y3N9 320 aa3.39□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa3.38□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa3.38□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 PCDH7O60245 1069 aa3.38□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 AMBPP02760 352 aa3.38□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 FAM106CPP0CH98 169 aa3.38□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 HSD17B4P51659 736 aa3.38□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 TAS2R38P59533 333 aa3.38□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 ISL1P61371 349 aa3.38□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 SREBF2Q12772 1141 aa3.38□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 CCDC96Q2M329 555 aa3.38□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 SLC35E4Q6ICL7 350 aa3.38□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 CCDC70Q6NSX1 233 aa3.38□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 CLEC4GQ6UXB4 293 aa3.38□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa3.38□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 ARMC8Q8IUR7 673 aa3.38□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 BEST3Q8N1M1 668 aa3.38□□□□□ -1.87
SMIM18-201ENST00000517349 ST8SIA4Q92187 359 aa3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms