RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 TMEM150AQ86TG1 271 aa18.14■□□□□ 0.5
USP18-201ENST00000215794 ARHGAP24Q8N264 748 aa18.14■□□□□ 0.5
USP18-201ENST00000215794 BBS5Q8N3I7 341 aa18.14■□□□□ 0.5
USP18-201ENST00000215794 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.5
USP18-201ENST00000215794 FAM136AQ96C01 138 aa18.14■□□□□ 0.5
USP18-201ENST00000215794 UBXN10Q96LJ8 280 aa18.14■□□□□ 0.5
USP18-201ENST00000215794 C1orf21Q9H246 121 aa18.14■□□□□ 0.5
USP18-201ENST00000215794 SLC7A8Q9UHI5 535 aa18.14■□□□□ 0.5
USP18-201ENST00000215794 A0A1B0GVM2 712 aa18.14■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 ILVBLA1L0T0 632 aa18.14■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 TCAF2A6NFQ2 919 aa18.14■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 INSIG1O15503 277 aa18.14■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 RPP40O75818 363 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 PDHA1P08559 390 aa18.14■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 CR2P20023 1033 aa18.14■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 PFKPQ01813 784 aa18.14■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 NAA25Q14CX7 972 aa18.14■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 RCN1Q15293 331 aa18.14■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 AGAP9Q5VTM2 703 aa18.14■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 FRMD7Q6ZUT3 714 aa18.14■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 TSPAN17Q96FV3 270 aa18.14■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 LRCH3Q96II8 777 aa18.14■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 CORO1BQ9BR76 489 aa18.14■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 MUC3BQ9H195 1237 aa18.14■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 DCLRE1BQ9H816 532 aa18.14■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 TRPC7Q9HCX4 862 aa18.14■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 HSFX1Q9UBD0 423 aa18.14■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 A8MT66 165 aa18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 LINC01565O15544 149 aa18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 SNAP91O60641 907 aa18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 KCNC1P48547 511 aa18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 SESN3P58005 492 aa18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 NTHL1P78549 312 aa18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 ARF5P84085 180 aa18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 KLF10Q13118 480 aa18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 PTPRRQ15256 657 aa18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 FSCBQ5H9T9 825 aa18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 TTC16Q8NEE8 873 aa18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 MDGA1Q8NFP4 955 aa18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 RMDN1Q96DB5 314 aa18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 PANX3Q96QZ0 392 aa18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 SCUBE2Q9NQ36 999 aa18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 A0A088AWK7 358 aa18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 CD160O95971 181 aa18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 PRLP01236 227 aa18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 SERPINB5P36952 375 aa18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 ZXDBP98169 803 aa18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 CYP4F8P98187 520 aa18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 GRIN2CQ14957 1233 aa18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 EML3Q32P44 896 aa18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 SH2D4BQ5SQS7 431 aa18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 TMEM198Q66K66 360 aa18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 CCDC149Q6ZUS6 474 aa18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 KDM1BQ8NB78 822 aa18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 DTX3LQ8TDB6 740 aa18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 PHF21BQ96EK2 531 aa18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 MARK4Q96L34 752 aa18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 ALG9Q9H6U8 611 aa18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 FIS1Q9Y3D6 152 aa18.13■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 A0A0U1RQS6 177 aa18.12■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 NPHS1O60500 1241 aa18.12■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 PSMG1O95456 288 aa18.12■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 TCEAL5Q5H9L2 206 aa18.12■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa18.12■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 CHST9Q7L1S5 443 aa18.12■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 OR4L1Q8NH43 312 aa18.12■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 BHMTQ93088 406 aa18.12■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa18.12■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 ZNF570Q96NI8 536 aa18.12■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 CATSPERZQ9NTU4 200 aa18.12■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 GTSE1Q9NYZ3 720 aa18.12■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa18.12■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 C1RP00736 705 aa18.11■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 F11P03951 625 aa18.11■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 COX4I1P13073 169 aa18.11■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 ARSAP15289 507 aa18.11■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 FDXRP22570 491 aa18.11■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 CCR2P41597 374 aa18.11■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 DNAJB13P59910 316 aa18.11■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 DUSP6Q16828 381 aa18.11■□□□□ 0.49
USP18-201ENST00000215794 FAM45BPQ6NSW5 357 aa18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms