RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 WDR44Q5JSH3 913 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 FAM219BQ5XKK7 198 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 TAF2Q6P1X5 1199 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 ARSKQ6UWY0 536 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 C16orf62Q7Z3J2 963 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 OR8H1Q8NGG4 311 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 TRPM4Q8TD43 1214 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 DEDD2Q8WXF8 326 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 MARC2Q969Z3 335 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 RNF145Q96MT1 663 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 BDH2Q9BUT1 245 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 PLAC1Q9HBJ0 212 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 FANCFQ9NPI8 374 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 AASSQ9UDR5 926 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 KLHL20Q9Y2M5 609 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 CIB4A0PJX0 185 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 MSH4O15457 936 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 PGLSO95336 258 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 DNTTP04053 509 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 CALB1P05937 261 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 CYP3A4P08684 503 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 KRT19P08727 400 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 PTPN5P54829 565 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 TAP1Q03518 808 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 TAB1Q15750 504 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 DPY19L1Q2PZI1 675 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 FUT11Q495W5 492 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 NRARPQ7Z6K4 114 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 TXNRD3Q86VQ6 643 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 LACC1Q8IV20 430 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 GIMAP5Q96F15 307 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 LRCH3Q96II8 777 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 CEP41Q9BYV8 373 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 TRIM15Q9C019 465 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 PNPLA8Q9NP80 782 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 EVA1BQ9NVM1 165 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 ERVK13-1Q9NX77 482 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 EHD3Q9NZN3 535 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM191CA6NGB0 347 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 FAM159BA6NKW6 160 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 LEUTXA8MZ59 168 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 SHOXO15266 292 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 SGTAO43765 313 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 RGS20O76081 388 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 FADS2O95864 444 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 CHRNA1P02708 482 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 NTRK1P04629 796 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 SOX9P48436 509 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 SLC12A2P55011 1212 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 RAD51Q06609 339 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP9.57□□□□□ -0.881e-6■■■■■ 32.5
TMOD1-203ENST00000395211 MADCAM1Q13477 382 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 TPRG1LQ5T0D9 272 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 SHEQ5VZ18 495 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 RAB43Q86YS6 212 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 PIK3C3Q8NEB9 887 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 APBB2Q92870 758 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 ACCSQ96QU6 501 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 FIZ1Q96SL8 496 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 MXRA8Q9BRK3 442 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 FEM1AQ9BSK4 669 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 TASP1Q9H6P5 420 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 SNX15Q9NRS6 342 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 HSPB11Q9Y547 144 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 CCDC154A6NI56 674 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 TRIM24O15164 1050 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 GRID2O43424 1007 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 TBC1D4O60343 1298 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 NOBOXO60393 691 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 ATP6AP2O75787 350 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 TNNI1P19237 187 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 GRIK1P39086 918 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 HADHQ16836 314 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 ARMC4Q5T2S8 1044 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 TXNDC11Q6PKC3 985 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 UBQLNLQ8IYU4 475 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 BEST2Q8NFU1 509 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 CDC26Q8NHZ8 85 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 RIT1Q92963 219 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 CEP170P1Q96L14 293 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-203ENST00000395211 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms