RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	CASC4	Q6P4E1	433 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	LRRC6	Q86X45	466 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	TTC8	Q8TAM2	541 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	RMDN1	Q96DB5	314 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM129B	Q96TA1	746 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	GABRG3	Q99928	467 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	FBRS	Q9HAH7	460 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	IL36A	Q9UHA7	158 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	C5orf42	Q9H799	3197 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	C2orf81	A6NN90	581 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529		H7C0S8	307 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC7A4	O43246	635 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	MYZAP	P0CAP1	466 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	PAM	P19021	973 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	SOX9	P48436	509 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	CRADD	P78560	199 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	PRKCQ	Q04759	706 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	MGAT5	Q09328	741 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	MTM1	Q13496	603 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	POU6F1	Q14863	301 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	CNGA3	Q16281	694 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	GALNT7	Q86SF2	657 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	CHST14	Q8NCH0	376 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	EDA	Q92838	391 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	MFSD3	Q96ES6	412 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	RUFY1	Q96T51	708 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	WNT16	Q9UBV4	365 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	LEFTY1	O75610	366 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	PIGN	O95427	931 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	ASGR2	P07307	311 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	CTSL	P07711	333 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	NMBR	P28336	390 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	GCA	P28676	217 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC8A1	P32418	973 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	IL12RB1	P42701	662 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	ZXDA	P98168	799 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	DNAJC3	Q13217	504 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	GALNT3	Q14435	633 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	UGP2	Q16851	508 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	LONRF1	Q17RB8	773 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	ARSI	Q5FYB1	569 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	EMC10	Q5UCC4	262 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	GPR150	Q8NGU9	434 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	CDKL2	Q92772	493 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	CERS2	Q96G23	380 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	CFAP36	Q96G28	342 aa		12.79	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms