RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEPT3Q9UH03 358 aa26.34■■□□□ 1.81
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SATB2Q9UPW6 733 aa26.33■■□□□ 1.81
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLA2G15Q8NCC3 412 aa26.32■■□□□ 1.8
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 THSD1Q9NS62 852 aa26.32■■□□□ 1.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SIRPGQ9P1W8 387 aa26.32■■□□□ 1.8
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL1R2P27930 398 aa26.31■■□□□ 1.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC10A7Q0GE19 358 aa26.31■■□□□ 1.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IQCB1Q15051 598 aa26.31■■□□□ 1.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DPYSL2Q16555 572 aa26.31■■□□□ 1.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMTNL2Q2TAL5 461 aa26.31■■□□□ 1.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BOLA3Q53S33 107 aa26.31■■□□□ 1.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FIGNQ5HY92 759 aa26.31■■□□□ 1.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGF2-ASQ6U949 168 aa26.31■■□□□ 1.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NYAP1Q6ZVC0 841 aa26.31■■□□□ 1.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DPPA4Q7L190 304 aa26.31■■□□□ 1.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KYQ8NBH2 561 aa26.31■■□□□ 1.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa26.31■■□□□ 1.8
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SHROOM3Q8TF72 1996 aa26.29■■□□□ 1.8
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AMPD1P23109 780 aa26.29■■□□□ 1.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIAA1024LP59773 190 aa26.29■■□□□ 1.8
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BROXQ5VW32 411 aa26.29■■□□□ 1.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POLNQ7Z5Q5 900 aa26.29■■□□□ 1.8
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP26.29■■□□□ 1.8
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa26.29■■□□□ 1.8
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCTD16Q68DU8 428 aa26.28■■□□□ 1.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR56A4Q8NGH8 313 aa26.28■■□□□ 1.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNE4Q8WWG9 221 aa26.28■■□□□ 1.8
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC46A1Q96NT5 459 aa26.28■■□□□ 1.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CSPG4P5Q96PW8 444 aa26.28■■□□□ 1.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FUCA2Q9BTY2 467 aa26.28■■□□□ 1.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1W2PQ67 120 aa26.27■■□□□ 1.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM202A6NGA9 273 aa26.27■■□□□ 1.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SOCS5O75159 536 aa26.27■■□□□ 1.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RARAP10276 462 aa26.27■■□□□ 1.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TPM4P67936 248 aa26.27■■□□□ 1.8
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