RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

BASIC

Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa31.04■■■□□ 2.56
SYT6-210ENST00000641643 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
SYT6-210ENST00000641643 BRWD3Q6RI45 1802 aa31.03■■■□□ 2.56
SYT6-210ENST00000641643 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa31.03■■■□□ 2.56
SYT6-210ENST00000641643 OVOS2Q6IE36 1432 aa31.03■■■□□ 2.56
SYT6-210ENST00000641643 USP54Q70EL1 1684 aa31.03■■■□□ 2.56
SYT6-210ENST00000641643 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa31.02■■■□□ 2.56
SYT6-210ENST00000641643 EP400Q96L91 3159 aa31.02■■■□□ 2.56
SYT6-210ENST00000641643 CRB1P82279 1406 aa31.02■■■□□ 2.56
SYT6-210ENST00000641643 CCDC125Q86Z20 511 aa31.01■■■□□ 2.56
SYT6-210ENST00000641643 WDR17Q8IZU2 1322 aa31■■■□□ 2.55
SYT6-210ENST00000641643 COL18A1P39060 1754 aa30.99■■■□□ 2.55
SYT6-210ENST00000641643 FYB1O15117 783 aa30.97■■■□□ 2.55
SYT6-210ENST00000641643 GGNBP2Q9H3C7 697 aa30.96■■■□□ 2.55
SYT6-210ENST00000641643 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa30.96■■■□□ 2.55
SYT6-210ENST00000641643 PDE3BQ13370 1112 aa30.95■■■□□ 2.54
SYT6-210ENST00000641643 ABCC6O95255 1503 aa30.94■■■□□ 2.54
SYT6-210ENST00000641643 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
SYT6-210ENST00000641643 CARD14Q9BXL6 1004 aa30.93■■■□□ 2.54
SYT6-210ENST00000641643 NSD3Q9BZ95 1437 aa30.93■■■□□ 2.54
SYT6-210ENST00000641643 MYOM1P52179 1685 aa30.92■■■□□ 2.54
SYT6-210ENST00000641643 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
SYT6-210ENST00000641643 CARD10Q9BWT7 1032 aa30.92■■■□□ 2.54
SYT6-210ENST00000641643 FAM182BQ5T319 152 aa30.9■■■□□ 2.54
SYT6-210ENST00000641643 LTN1O94822 1766 aa30.89■■■□□ 2.54
SYT6-210ENST00000641643 RGPD5Q99666 1765 aa30.89■■■□□ 2.54
SYT6-210ENST00000641643 ERBB3P21860 1342 aa30.89■■■□□ 2.53
SYT6-210ENST00000641643 AMPHP49418 695 aa30.88■■■□□ 2.53
SYT6-210ENST00000641643 IP6K1Q92551 441 aa30.88■■■□□ 2.53
SYT6-210ENST00000641643 FBLN1P23142 703 aa30.87■■■□□ 2.53
SYT6-210ENST00000641643 FAM196AQ6ZSG2 479 aa30.87■■■□□ 2.53
SYT6-210ENST00000641643 ANKRD24Q8TF21 1146 aa30.87■■■□□ 2.53
SYT6-210ENST00000641643 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
SYT6-210ENST00000641643 CGNL1Q0VF96 1302 aa30.86■■■□□ 2.53
SYT6-210ENST00000641643 MAP3K19Q56UN5 1328 aa30.86■■■□□ 2.53
SYT6-210ENST00000641643 NLRP2Q9NX02 1062 aa30.86■■■□□ 2.53
SYT6-210ENST00000641643 CCDC7Q96M83 1385 aa30.85■■■□□ 2.53
SYT6-210ENST00000641643 DDB1Q16531 1140 aa30.84■■■□□ 2.53
SYT6-210ENST00000641643 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
SYT6-210ENST00000641643 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
SYT6-210ENST00000641643 KIF20BQ96Q89 1820 aa30.82■■■□□ 2.52
SYT6-210ENST00000641643 PANK3Q9H999 370 aa30.82■■■□□ 2.52
SYT6-210ENST00000641643 HOXC9P31274 260 aa30.81■■■□□ 2.52
SYT6-210ENST00000641643 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
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SYT6-210ENST00000641643 DEFB132Q7Z7B7 95 aa30.79■■■□□ 2.52
SYT6-210ENST00000641643 BAG6P46379 1132 aa30.77■■■□□ 2.52
SYT6-210ENST00000641643 RTL1A6NKG5 1358 aa30.77■■■□□ 2.52
SYT6-210ENST00000641643 EXOC5O00471 708 aa30.75■■■□□ 2.51
SYT6-210ENST00000641643 KIF7Q2M1P5 1343 aa30.75■■■□□ 2.51
SYT6-210ENST00000641643 TRIM37O94972 964 aa30.75■■■□□ 2.51
SYT6-210ENST00000641643 DISP2A7MBM2 1401 aa30.73■■■□□ 2.51
SYT6-210ENST00000641643 IL2RBP14784 551 aa30.72■■■□□ 2.51
SYT6-210ENST00000641643 LRRC37A3O60309 1634 aa30.71■■■□□ 2.51
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SYT6-210ENST00000641643 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa30.7■■■□□ 2.51
SYT6-210ENST00000641643 FLT4P35916 1363 aa30.69■■■□□ 2.5
SYT6-210ENST00000641643 KIF24Q5T7B8 1368 aa30.69■■■□□ 2.5
SYT6-210ENST00000641643 WNK3Q9BYP7 1800 aa30.69■■■□□ 2.5
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SYT6-210ENST00000641643 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa30.67■■■□□ 2.5
SYT6-210ENST00000641643 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
SYT6-210ENST00000641643 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa30.66■■■□□ 2.5
SYT6-210ENST00000641643 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
SYT6-210ENST00000641643 INSRP06213 1382 aa30.66■■■□□ 2.5
SYT6-210ENST00000641643 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
SYT6-210ENST00000641643 APBA3O96018 575 aa30.65■■■□□ 2.5
SYT6-210ENST00000641643 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
SYT6-210ENST00000641643 NSD2O96028 1365 aa30.64■■■□□ 2.5
SYT6-210ENST00000641643 TNS2Q63HR2 1409 aa30.64■■■□□ 2.5
SYT6-210ENST00000641643 NBPF6Q5VWK0 638 aa30.6■■■□□ 2.49
SYT6-210ENST00000641643 MORC1Q86VD1 984 aa30.6■■■□□ 2.49
SYT6-210ENST00000641643 NBPF4Q96M43 638 aa30.6■■■□□ 2.49
SYT6-210ENST00000641643 POLKQ9UBT6 870 aa30.6■■■□□ 2.49
SYT6-210ENST00000641643 PEAK1Q9H792 1746 aa30.58■■■□□ 2.49
SYT6-210ENST00000641643 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
SYT6-210ENST00000641643 WASHC2AQ641Q2 1341 aa30.57■■■□□ 2.49
SYT6-210ENST00000641643 BCL9O00512 1426 aa30.57■■■□□ 2.48
SYT6-210ENST00000641643 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
SYT6-210ENST00000641643 USHBP1Q8N6Y0 703 aa30.57■■■□□ 2.48
SYT6-210ENST00000641643 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa30.56■■■□□ 2.48
SYT6-210ENST00000641643 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
SYT6-210ENST00000641643 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
SYT6-210ENST00000641643 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa30.54■■■□□ 2.48
SYT6-210ENST00000641643 CAMKK2Q96RR4 588 aa30.54■■■□□ 2.48
SYT6-210ENST00000641643 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
SYT6-210ENST00000641643 RGPD2P0DJD1 1756 aa30.53■■■□□ 2.48
SYT6-210ENST00000641643 PARD3Q8TEW0 1356 aa30.52■■■□□ 2.48
SYT6-210ENST00000641643 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
SYT6-210ENST00000641643 TATP17735 454 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
SYT6-210ENST00000641643 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
SYT6-210ENST00000641643 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
SYT6-210ENST00000641643 ACSBG1Q96GR2 724 aa30.48■■■□□ 2.47
SYT6-210ENST00000641643 SBF2Q86WG5 1849 aa30.48■■■□□ 2.47
SYT6-210ENST00000641643 MEGF6O75095 1541 aa30.48■■■□□ 2.47
SYT6-210ENST00000641643 PTF1AQ7RTS3 328 aa30.46■■■□□ 2.47
SYT6-210ENST00000641643 PLSCR1O15162 318 aa30.45■■■□□ 2.47
SYT6-210ENST00000641643 KAT6BQ8WYB5 2073 aa30.45■■■□□ 2.47
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