RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615959.1

MIR3648-1-201, Transcript of microRNA 3648-1, humanhuman

BASIC

Gene MIR3648-1, Length 180 nt, Biotype miRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIR3648-1-201ENST00000615959 TERF2IPQ9NYB0 399 aa36.2■■■■□ 3.39
MIR3648-1-201ENST00000615959 NFAT5O94916 1531 aa36.19■■■■□ 3.38
MIR3648-1-201ENST00000615959 TRIM37O94972 964 aa36.19■■■■□ 3.38
MIR3648-1-201ENST00000615959 WDR17Q8IZU2 1322 aa36.18■■■■□ 3.38
MIR3648-1-201ENST00000615959 NME9Q86XW9 330 aa36.18■■■■□ 3.38
MIR3648-1-201ENST00000615959 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
MIR3648-1-201ENST00000615959 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
MIR3648-1-201ENST00000615959 RGPD5Q99666 1765 aa36.17■■■■□ 3.38
MIR3648-1-201ENST00000615959 DISP2A7MBM2 1401 aa36.17■■■■□ 3.38
MIR3648-1-201ENST00000615959 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
MIR3648-1-201ENST00000615959 A0A1W2PP64 1363 aa36.15■■■■□ 3.38
MIR3648-1-201ENST00000615959 USP54Q70EL1 1684 aa36.14■■■■□ 3.38
MIR3648-1-201ENST00000615959 NINLQ9Y2I6 1382 aa36.11■■■■□ 3.37
MIR3648-1-201ENST00000615959 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa36.09■■■■□ 3.37
MIR3648-1-201ENST00000615959 CARD10Q9BWT7 1032 aa36.09■■■■□ 3.37
MIR3648-1-201ENST00000615959 ABCC6O95255 1503 aa36.08■■■■□ 3.37
MIR3648-1-201ENST00000615959 APBA3O96018 575 aa36.08■■■■□ 3.37
MIR3648-1-201ENST00000615959 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
MIR3648-1-201ENST00000615959 CAMKK2Q96RR4 588 aa36.08■■■■□ 3.37
MIR3648-1-201ENST00000615959 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa36.08■■■■□ 3.37
MIR3648-1-201ENST00000615959 USP47Q96K76 1375 aa36.07■■■■□ 3.36
MIR3648-1-201ENST00000615959 DDB1Q16531 1140 aa36.07■■■■□ 3.36
MIR3648-1-201ENST00000615959 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.07■■■■□ 3.36
MIR3648-1-201ENST00000615959 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
MIR3648-1-201ENST00000615959 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
MIR3648-1-201ENST00000615959 CLSPNQ9HAW4 1339 aa36.06■■■■□ 3.36
MIR3648-1-201ENST00000615959 LRRC37A3O60309 1634 aa36.03■■■■□ 3.36
MIR3648-1-201ENST00000615959 WNK3Q9BYP7 1800 aa36.02■■■■□ 3.36
MIR3648-1-201ENST00000615959 TMF1P82094 1093 aa36.02■■■■□ 3.36
MIR3648-1-201ENST00000615959 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP36.01■■■■□ 3.36
MIR3648-1-201ENST00000615959 LTN1O94822 1766 aa36.01■■■■□ 3.35
MIR3648-1-201ENST00000615959 PARD3Q8TEW0 1356 aa36.01■■■■□ 3.35
MIR3648-1-201ENST00000615959 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa36■■■■□ 3.35
MIR3648-1-201ENST00000615959 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa36■■■■□ 3.35
MIR3648-1-201ENST00000615959 OVOS2Q6IE36 1432 aa36■■■■□ 3.35
MIR3648-1-201ENST00000615959 PEAK1Q9H792 1746 aa36■■■■□ 3.35
MIR3648-1-201ENST00000615959 CCDC7Q96M83 1385 aa35.98■■■■□ 3.35
MIR3648-1-201ENST00000615959 ERBB3P21860 1342 aa35.97■■■■□ 3.35
MIR3648-1-201ENST00000615959 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa35.96■■■■□ 3.35
MIR3648-1-201ENST00000615959 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.35
MIR3648-1-201ENST00000615959 SBF2Q86WG5 1849 aa35.93■■■■□ 3.34
MIR3648-1-201ENST00000615959 EXOC5O00471 708 aa35.92■■■■□ 3.34
MIR3648-1-201ENST00000615959 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
MIR3648-1-201ENST00000615959 COG3Q96JB2 828 aa35.92■■■■□ 3.34
MIR3648-1-201ENST00000615959 NLRP2Q9NX02 1062 aa35.92■■■■□ 3.34
MIR3648-1-201ENST00000615959 CDCA8Q53HL2 280 aa35.91■■■■□ 3.34
MIR3648-1-201ENST00000615959 ANKRD24Q8TF21 1146 aa35.91■■■■□ 3.34
MIR3648-1-201ENST00000615959 RREB1Q92766 1687 aa35.89■■■■□ 3.34
MIR3648-1-201ENST00000615959 IP6K1Q92551 441 aa35.89■■■■□ 3.34
MIR3648-1-201ENST00000615959 BCL9O00512 1426 aa35.89■■■■□ 3.34
MIR3648-1-201ENST00000615959 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
MIR3648-1-201ENST00000615959 LRP5O75197 1615 aa35.86■■■■□ 3.33
MIR3648-1-201ENST00000615959 FYB1O15117 783 aa35.83■■■■□ 3.33
MIR3648-1-201ENST00000615959 PLSCR1O15162 318 aa35.83■■■■□ 3.33
MIR3648-1-201ENST00000615959 PTF1AQ7RTS3 328 aa35.83■■■■□ 3.33
MIR3648-1-201ENST00000615959 NUP188Q5SRE5 1749 aa35.83■■■■□ 3.33
MIR3648-1-201ENST00000615959 IL2RBP14784 551 aa35.82■■■■□ 3.32
MIR3648-1-201ENST00000615959 FBLN1P23142 703 aa35.82■■■■□ 3.32
MIR3648-1-201ENST00000615959 TNS2Q63HR2 1409 aa35.82■■■■□ 3.32
MIR3648-1-201ENST00000615959 MAP3K19Q56UN5 1328 aa35.81■■■■□ 3.32
MIR3648-1-201ENST00000615959 NBPF14Q5TI25 921 aa35.8■■■■□ 3.32
MIR3648-1-201ENST00000615959 GGNBP2Q9H3C7 697 aa35.78■■■■□ 3.32
MIR3648-1-201ENST00000615959 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
MIR3648-1-201ENST00000615959 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa35.77■■■■□ 3.32
MIR3648-1-201ENST00000615959 HOXC9P31274 260 aa35.77■■■■□ 3.32
MIR3648-1-201ENST00000615959 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
MIR3648-1-201ENST00000615959 AMPHP49418 695 aa35.76■■■■□ 3.32
MIR3648-1-201ENST00000615959 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
MIR3648-1-201ENST00000615959 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
MIR3648-1-201ENST00000615959 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
MIR3648-1-201ENST00000615959 CARD14Q9BXL6 1004 aa35.71■■■■□ 3.31
MIR3648-1-201ENST00000615959 MYOM1P52179 1685 aa35.7■■■■□ 3.31
MIR3648-1-201ENST00000615959 KCNQ2O43526 872 aa35.69■■■■□ 3.3
MIR3648-1-201ENST00000615959 PROM2Q8N271 834 aa35.69■■■■□ 3.3
MIR3648-1-201ENST00000615959 RTL1A6NKG5 1358 aa35.68■■■■□ 3.3
MIR3648-1-201ENST00000615959 KIF20BQ96Q89 1820 aa35.68■■■■□ 3.3
MIR3648-1-201ENST00000615959 ACSBG1Q96GR2 724 aa35.65■■■■□ 3.3
MIR3648-1-201ENST00000615959 RGPD2P0DJD1 1756 aa35.64■■■■□ 3.3
MIR3648-1-201ENST00000615959 NHSQ6T4R5 1651 aa35.63■■■■□ 3.29
MIR3648-1-201ENST00000615959 NSD3Q9BZ95 1437 aa35.63■■■■□ 3.29
MIR3648-1-201ENST00000615959 KAT6BQ8WYB5 2073 aa35.63■■■■□ 3.29
MIR3648-1-201ENST00000615959 TXNRD1Q16881 649 aa35.61■■■■□ 3.29
MIR3648-1-201ENST00000615959 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP35.6■■■■□ 3.29
MIR3648-1-201ENST00000615959 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
MIR3648-1-201ENST00000615959 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
MIR3648-1-201ENST00000615959 NBPF6Q5VWK0 638 aa35.58■■■■□ 3.29
MIR3648-1-201ENST00000615959 NBPF4Q96M43 638 aa35.58■■■■□ 3.29
MIR3648-1-201ENST00000615959 KIF24Q5T7B8 1368 aa35.56■■■■□ 3.28
MIR3648-1-201ENST00000615959 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
MIR3648-1-201ENST00000615959 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa35.56■■■■□ 3.28
MIR3648-1-201ENST00000615959 INSRP06213 1382 aa35.55■■■■□ 3.28
MIR3648-1-201ENST00000615959 POLR3GLQ9BT43 218 aa35.55■■■■□ 3.28
MIR3648-1-201ENST00000615959 FLT4P35916 1363 aa35.54■■■■□ 3.28
MIR3648-1-201ENST00000615959 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
MIR3648-1-201ENST00000615959 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
MIR3648-1-201ENST00000615959 CGNL1Q0VF96 1302 aa35.53■■■■□ 3.28
MIR3648-1-201ENST00000615959 BTAF1O14981 1849 aa35.52■■■■□ 3.28
MIR3648-1-201ENST00000615959 MEGF6O75095 1541 aa35.52■■■■□ 3.28
MIR3648-1-201ENST00000615959 USHBP1Q8N6Y0 703 aa35.5■■■■□ 3.27
MIR3648-1-201ENST00000615959 SPON1Q9HCB6 807 aa35.5■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms