RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 PLCH2O75038 1416 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRJ-208ENST00000615445 HIP1O00291 1037 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRJ-208ENST00000615445 FYB1O15117 783 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRJ-208ENST00000615445 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRJ-208ENST00000615445 FOXO3O43524 673 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRJ-208ENST00000615445 MCM2P49736 904 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRJ-208ENST00000615445 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRJ-208ENST00000615445 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRJ-208ENST00000615445 TPM3P06753 285 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRJ-208ENST00000615445 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.58
PTPRJ-208ENST00000615445 ABCC11Q96J66 1382 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRJ-208ENST00000615445 IFT57Q9NWB7 429 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRJ-208ENST00000615445 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRJ-208ENST00000615445 MAPKBP1O60336 1514 aa24.89■■□□□ 1.58
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa24.89■■□□□ 1.57
PTPRJ-208ENST00000615445 CNNM1Q9NRU3 951 aa24.89■■□□□ 1.57
PTPRJ-208ENST00000615445 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.89■■□□□ 1.57
PTPRJ-208ENST00000615445 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
PTPRJ-208ENST00000615445 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
PTPRJ-208ENST00000615445 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
PTPRJ-208ENST00000615445 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRJ-208ENST00000615445 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
PTPRJ-208ENST00000615445 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
PTPRJ-208ENST00000615445 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPRJ-208ENST00000615445 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
PTPRJ-208ENST00000615445 TRAK2O60296 914 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC158Q5M9N0 1113 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPRJ-208ENST00000615445 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRJ-208ENST00000615445 SASS6Q6UVJ0 657 aa24.85■■□□□ 1.57
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PTPRJ-208ENST00000615445 ASXL2Q76L83 1435 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRJ-208ENST00000615445 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
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PTPRJ-208ENST00000615445 PDCP20941 246 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC57Q2TAC2 916 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRJ-208ENST00000615445 TTC39AQ5SRH9 613 aa24.82■■□□□ 1.56
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PTPRJ-208ENST00000615445 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRJ-208ENST00000615445 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
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PTPRJ-208ENST00000615445 SART3Q15020 963 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
PTPRJ-208ENST00000615445 RNF214Q8ND24 703 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRJ-208ENST00000615445 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRJ-208ENST00000615445 KDM4AO75164 1064 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRJ-208ENST00000615445 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
PTPRJ-208ENST00000615445 FBLN1P23142 703 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRJ-208ENST00000615445 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
PTPRJ-208ENST00000615445 SDF4Q9BRK5 362 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRJ-208ENST00000615445 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PTPRJ-208ENST00000615445 MTMR7Q9Y216 660 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRJ-208ENST00000615445 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.78■■□□□ 1.56
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PTPRJ-208ENST00000615445 MBD3O95983 291 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRJ-208ENST00000615445 TPM2P07951 284 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRJ-208ENST00000615445 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
PTPRJ-208ENST00000615445 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 FIBPO43427 364 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 ACEP12821 1306 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 MPHOSPH8Q99549 860 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 A2MP01023 1474 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.74■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 XBP1P17861 261 aa24.74■■□□□ 1.55
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PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF592Q92610 1267 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 ATP2B1P20020 1258 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 PDE4CQ08493 712 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 STK3Q13188 491 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 KIF1BPQ96EK5 621 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 KIAA0556O60303 1618 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM83GA6ND36 823 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 BRMS1Q9HCU9 246 aa24.71■■□□□ 1.55
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