RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591760.5

PTPRS-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRS, Length 478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-209ENST00000591760 ABCC6O95255 1503 aa36.06■■■■□ 3.36
PTPRS-209ENST00000591760 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
PTPRS-209ENST00000591760 CDCA8Q53HL2 280 aa36.04■■■■□ 3.36
PTPRS-209ENST00000591760 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
PTPRS-209ENST00000591760 ZRANB1Q9UGI0 708 aa36.03■■■■□ 3.36
PTPRS-209ENST00000591760 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa36.02■■■■□ 3.36
PTPRS-209ENST00000591760 RGPD5Q99666 1765 aa36■■■■□ 3.35
PTPRS-209ENST00000591760 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa36■■■■□ 3.35
PTPRS-209ENST00000591760 OVOS2Q6IE36 1432 aa36■■■■□ 3.35
PTPRS-209ENST00000591760 AXIN2Q9Y2T1 843 aa35.99■■■■□ 3.35
PTPRS-209ENST00000591760 LTN1O94822 1766 aa35.99■■■■□ 3.35
PTPRS-209ENST00000591760 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP35.98■■■■□ 3.35
PTPRS-209ENST00000591760 WDR17Q8IZU2 1322 aa35.98■■■■□ 3.35
PTPRS-209ENST00000591760 RGPD1P0DJD0 1748 aa35.97■■■■□ 3.35
PTPRS-209ENST00000591760 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa35.97■■■■□ 3.35
PTPRS-209ENST00000591760 FAM182BQ5T319 152 aa35.94■■■■□ 3.34
PTPRS-209ENST00000591760 WNK3Q9BYP7 1800 aa35.93■■■■□ 3.34
PTPRS-209ENST00000591760 PDE3BQ13370 1112 aa35.92■■■■□ 3.34
PTPRS-209ENST00000591760 MYOM1P52179 1685 aa35.91■■■■□ 3.34
PTPRS-209ENST00000591760 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa35.9■■■■□ 3.34
PTPRS-209ENST00000591760 FAM196AQ6ZSG2 479 aa35.89■■■■□ 3.34
PTPRS-209ENST00000591760 LRRC37A3O60309 1634 aa35.88■■■■□ 3.33
PTPRS-209ENST00000591760 DEFB132Q7Z7B7 95 aa35.88■■■■□ 3.33
PTPRS-209ENST00000591760 COG3Q96JB2 828 aa35.88■■■■□ 3.33
PTPRS-209ENST00000591760 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP35.87■■■■□ 3.33
PTPRS-209ENST00000591760 BAG6P46379 1132 aa35.86■■■■□ 3.33
PTPRS-209ENST00000591760 CARD10Q9BWT7 1032 aa35.85■■■■□ 3.33
PTPRS-209ENST00000591760 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP35.83■■■■□ 3.331e-7■■■■■ 32.2
PTPRS-209ENST00000591760 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
PTPRS-209ENST00000591760 KIF20BQ96Q89 1820 aa35.83■■■■□ 3.33
PTPRS-209ENST00000591760 CCDC7Q96M83 1385 aa35.82■■■■□ 3.32
PTPRS-209ENST00000591760 ERBB3P21860 1342 aa35.82■■■■□ 3.32
PTPRS-209ENST00000591760 DISP2A7MBM2 1401 aa35.8■■■■□ 3.32
PTPRS-209ENST00000591760 DDB1Q16531 1140 aa35.79■■■■□ 3.32
PTPRS-209ENST00000591760 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
PTPRS-209ENST00000591760 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa35.76■■■■□ 3.32
PTPRS-209ENST00000591760 FYB1O15117 783 aa35.76■■■■□ 3.32
PTPRS-209ENST00000591760 TRIM37O94972 964 aa35.76■■■■□ 3.32
PTPRS-209ENST00000591760 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP35.75■■■■□ 3.31
PTPRS-209ENST00000591760 PEAK1Q9H792 1746 aa35.75■■■■□ 3.31
PTPRS-209ENST00000591760 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP35.75■■■■□ 3.31
PTPRS-209ENST00000591760 ANKRD24Q8TF21 1146 aa35.75■■■■□ 3.31
PTPRS-209ENST00000591760 IP6K1Q92551 441 aa35.73■■■■□ 3.31
PTPRS-209ENST00000591760 GGNBP2Q9H3C7 697 aa35.73■■■■□ 3.31
PTPRS-209ENST00000591760 NSD3Q9BZ95 1437 aa35.73■■■■□ 3.31
PTPRS-209ENST00000591760 NLRP2Q9NX02 1062 aa35.72■■■■□ 3.31
PTPRS-209ENST00000591760 MAP3K19Q56UN5 1328 aa35.72■■■■□ 3.31
PTPRS-209ENST00000591760 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP35.7■■■■□ 3.31
PTPRS-209ENST00000591760 RTL1A6NKG5 1358 aa35.69■■■■□ 3.3
PTPRS-209ENST00000591760 CARD14Q9BXL6 1004 aa35.69■■■■□ 3.3
PTPRS-209ENST00000591760 POLR3GLQ9BT43 218 aa35.68■■■■□ 3.3
PTPRS-209ENST00000591760 AMPHP49418 695 aa35.67■■■■□ 3.3
PTPRS-209ENST00000591760 TNS2Q63HR2 1409 aa35.66■■■■□ 3.3
PTPRS-209ENST00000591760 APBA3O96018 575 aa35.65■■■■□ 3.3
PTPRS-209ENST00000591760 HOXC9P31274 260 aa35.65■■■■□ 3.3
PTPRS-209ENST00000591760 PARD3Q8TEW0 1356 aa35.64■■■■□ 3.3
PTPRS-209ENST00000591760 SBF2Q86WG5 1849 aa35.64■■■■□ 3.3
PTPRS-209ENST00000591760 EXOC5O00471 708 aa35.64■■■■□ 3.3
PTPRS-209ENST00000591760 FBLN1P23142 703 aa35.64■■■■□ 3.3
PTPRS-209ENST00000591760 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
PTPRS-209ENST00000591760 BCL9O00512 1426 aa35.62■■■■□ 3.29
PTPRS-209ENST00000591760 IL2RBP14784 551 aa35.61■■■■□ 3.29
PTPRS-209ENST00000591760 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
PTPRS-209ENST00000591760 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
PTPRS-209ENST00000591760 CGNL1Q0VF96 1302 aa35.6■■■■□ 3.29
PTPRS-209ENST00000591760 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
PTPRS-209ENST00000591760 CAMKK2Q96RR4 588 aa35.59■■■■□ 3.29
PTPRS-209ENST00000591760 RREB1Q92766 1687 aa35.58■■■■□ 3.29
PTPRS-209ENST00000591760 KIF24Q5T7B8 1368 aa35.56■■■■□ 3.28
PTPRS-209ENST00000591760 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
PTPRS-209ENST00000591760 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
PTPRS-209ENST00000591760 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa35.55■■■■□ 3.28
PTPRS-209ENST00000591760 FLT4P35916 1363 aa35.53■■■■□ 3.28
PTPRS-209ENST00000591760 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa35.53■■■■□ 3.28
PTPRS-209ENST00000591760 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa35.53■■■■□ 3.28
PTPRS-209ENST00000591760 RGPD2P0DJD1 1756 aa35.53■■■■□ 3.28
PTPRS-209ENST00000591760 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP35.52■■■■□ 3.28
PTPRS-209ENST00000591760 NUP188Q5SRE5 1749 aa35.51■■■■□ 3.27
PTPRS-209ENST00000591760 INSRP06213 1382 aa35.5■■■■□ 3.27
PTPRS-209ENST00000591760 NHSQ6T4R5 1651 aa35.46■■■■□ 3.27
PTPRS-209ENST00000591760 PANK3Q9H999 370 aa35.46■■■■□ 3.27
PTPRS-209ENST00000591760 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP35.45■■■■□ 3.27
PTPRS-209ENST00000591760 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa35.44■■■■□ 3.26
PTPRS-209ENST00000591760 PLSCR1O15162 318 aa35.43■■■■□ 3.26
PTPRS-209ENST00000591760 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa35.43■■■■□ 3.26
PTPRS-209ENST00000591760 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
PTPRS-209ENST00000591760 PTF1AQ7RTS3 328 aa35.41■■■■□ 3.26
PTPRS-209ENST00000591760 NSD2O96028 1365 aa35.4■■■■□ 3.26
PTPRS-209ENST00000591760 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
PTPRS-209ENST00000591760 NBPF6Q5VWK0 638 aa35.4■■■■□ 3.26
PTPRS-209ENST00000591760 NBPF4Q96M43 638 aa35.4■■■■□ 3.26
PTPRS-209ENST00000591760 MEGF6O75095 1541 aa35.4■■■■□ 3.26
PTPRS-209ENST00000591760 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP35.38■■■■□ 3.25
PTPRS-209ENST00000591760 NBPF14Q5TI25 921 aa35.38■■■■□ 3.25
PTPRS-209ENST00000591760 LRP5O75197 1615 aa35.38■■■■□ 3.25
PTPRS-209ENST00000591760 SHANK3Q9BYB0 1731 aa35.37■■■■□ 3.25
PTPRS-209ENST00000591760 KIF7Q2M1P5 1343 aa35.36■■■■□ 3.25
PTPRS-209ENST00000591760 USHBP1Q8N6Y0 703 aa35.35■■■■□ 3.25
PTPRS-209ENST00000591760 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
PTPRS-209ENST00000591760 KCNQ2O43526 872 aa35.34■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.6 ms