RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 USP17L18D6R9N7 530 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 USP17L22D6RA61 530 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 USP17L19D6RCP7 530 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 USP17L20D6RJB6 530 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 USP17L24Q0WX57 530 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 TSGA10IPQ3SY00 556 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 WBP1LQ9NX94 342 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 CECR2Q9BXF3 1484 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 WIZO95785 1651 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 DKK1O94907 266 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 CTHP32929 405 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 NCOA4Q13772 614 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 WNT2BQ93097 391 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 SPSB2Q99619 263 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 SMARCA4P51532 1647 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 SOWAHDA6NJG2 315 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 ERCC3P19447 782 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 PTK2Q05397 1052 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 PLPP7Q8NBV4 271 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 ADAM32Q8TC27 787 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 RASA1P20936 1047 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 ARMC2Q8NEN0 867 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM200AQ8TCP9 573 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 USP35Q9P2H5 1018 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 TLL1O43897 1013 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 SERPINB4P48594 390 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 CLDN10P78369 228 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 SIRT1Q96EB6 747 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 BICRAQ9NZM4 1560 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 GOLGA8CPA6NN73 597 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 COPS2P61201 443 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 SLFNL1Q499Z3 407 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 NBPF14Q5TI25 921 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF135Q8IUD6 432 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 ANKMY2Q8IV38 441 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 UNC93B1Q9H1C4 597 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 ADH1BP00325 375 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 ATP2B4P23634 1241 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 SCNN1AP37088 669 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 MAP7D1Q3KQU3 841 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 THSD4Q6ZMP0 1018 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 KIAA1024Q9UPX6 916 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 POTEMA6NI47 508 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 ZPR1O75312 459 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 MARSP56192 900 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 DPYDQ12882 1025 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 OGFOD1Q8N543 542 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 BCL2L13Q9BXK5 485 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF592Q92610 1267 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 EML3Q32P44 896 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 TJAP1Q5JTD0 557 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 SIX5Q8N196 739 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 C1orf216Q8TAB5 229 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF516Q92618 1163 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 MTRQ99707 1265 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 ANKRD33BA6NCL7 494 aa6.42□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 OCLNQ16625 522 aa6.42□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 ERFEQ4G0M1 354 aa6.42□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 ZBTB33Q86T24 672 aa6.42□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 NPAS4Q8IUM7 802 aa6.42□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 LARGE2Q8N3Y3 721 aa6.42□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 GIPC2Q8TF65 315 aa6.42□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 BAP1Q92560 729 aa6.42□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 FOXJ1Q92949 421 aa6.42□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 STAC3Q96MF2 364 aa6.42□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa6.42□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.42□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 PEG3Q9GZU2 1588 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPNS1-210ENST00000590211 ESPNB1AK53 854 aa6.41□□□□□ -1.38
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