RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587269.5

SMAD2-208, Transcript of SMAD family member 2, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD2, Length 1,042 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD2-208ENST00000587269 APBA3O96018 575 aa41.45■■■■■ 4.23
SMAD2-208ENST00000587269 NME9Q86XW9 330 aa41.45■■■■■ 4.23
SMAD2-208ENST00000587269 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.22
SMAD2-208ENST00000587269 DDB1Q16531 1140 aa41.42■■■■■ 4.22
SMAD2-208ENST00000587269 TESK2Q96S53 571 aa41.42■■■■■ 4.22
SMAD2-208ENST00000587269 USP31Q70CQ4 1352 aa41.41■■■■■ 4.22
SMAD2-208ENST00000587269 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
SMAD2-208ENST00000587269 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP41.4■■■■■ 4.22
SMAD2-208ENST00000587269 CD163L1Q9NR16 1453 aa41.4■■■■■ 4.22
SMAD2-208ENST00000587269 COL18A1P39060 1754 aa41.4■■■■■ 4.22
SMAD2-208ENST00000587269 NINLQ9Y2I6 1382 aa41.38■■■■■ 4.22
SMAD2-208ENST00000587269 A0A1W2PP64 1363 aa41.37■■■■■ 4.21
SMAD2-208ENST00000587269 TMF1P82094 1093 aa41.37■■■■■ 4.21
SMAD2-208ENST00000587269 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP41.37■■■■■ 4.21
SMAD2-208ENST00000587269 CARD10Q9BWT7 1032 aa41.37■■■■■ 4.21
SMAD2-208ENST00000587269 DISP2A7MBM2 1401 aa41.35■■■■■ 4.21
SMAD2-208ENST00000587269 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
SMAD2-208ENST00000587269 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP41.35■■■■■ 4.21
SMAD2-208ENST00000587269 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa41.35■■■■■ 4.21
SMAD2-208ENST00000587269 NFAT5O94916 1531 aa41.34■■■■■ 4.21
SMAD2-208ENST00000587269 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa41.34■■■■■ 4.21
SMAD2-208ENST00000587269 USP47Q96K76 1375 aa41.33■■■■■ 4.21
SMAD2-208ENST00000587269 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP41.32■■■■■ 4.2
SMAD2-208ENST00000587269 RGPD5Q99666 1765 aa41.32■■■■■ 4.2
SMAD2-208ENST00000587269 CAMKK2Q96RR4 588 aa41.31■■■■■ 4.2
SMAD2-208ENST00000587269 CLSPNQ9HAW4 1339 aa41.29■■■■■ 4.2
SMAD2-208ENST00000587269 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa41.28■■■■■ 4.2
SMAD2-208ENST00000587269 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa41.28■■■■■ 4.2
SMAD2-208ENST00000587269 OVOS2Q6IE36 1432 aa41.28■■■■■ 4.2
SMAD2-208ENST00000587269 PARD3Q8TEW0 1356 aa41.28■■■■■ 4.2
SMAD2-208ENST00000587269 CDCA8Q53HL2 280 aa41.28■■■■■ 4.2
SMAD2-208ENST00000587269 NLRP2Q9NX02 1062 aa41.27■■■■■ 4.2
SMAD2-208ENST00000587269 CCDC7Q96M83 1385 aa41.26■■■■■ 4.2
SMAD2-208ENST00000587269 EXOC5O00471 708 aa41.26■■■■■ 4.2
SMAD2-208ENST00000587269 COG3Q96JB2 828 aa41.26■■■■■ 4.2
SMAD2-208ENST00000587269 ABCC6O95255 1503 aa41.26■■■■■ 4.2
SMAD2-208ENST00000587269 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP41.24■■■■■ 4.19
SMAD2-208ENST00000587269 USP54Q70EL1 1684 aa41.22■■■■■ 4.19
SMAD2-208ENST00000587269 NBPF14Q5TI25 921 aa41.2■■■■■ 4.19
SMAD2-208ENST00000587269 ANKRD24Q8TF21 1146 aa41.19■■■■■ 4.18
SMAD2-208ENST00000587269 ERBB3P21860 1342 aa41.18■■■■■ 4.18
SMAD2-208ENST00000587269 LRRC37A3O60309 1634 aa41.18■■■■■ 4.18
SMAD2-208ENST00000587269 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa41.18■■■■■ 4.18
SMAD2-208ENST00000587269 LTN1O94822 1766 aa41.17■■■■■ 4.18
SMAD2-208ENST00000587269 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP41.17■■■■■ 4.18
SMAD2-208ENST00000587269 IP6K1Q92551 441 aa41.13■■■■■ 4.17
SMAD2-208ENST00000587269 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.17
SMAD2-208ENST00000587269 WNK3Q9BYP7 1800 aa41.13■■■■■ 4.17
SMAD2-208ENST00000587269 AMPHP49418 695 aa41.12■■■■■ 4.17
SMAD2-208ENST00000587269 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP41.11■■■■■ 4.17
SMAD2-208ENST00000587269 IL2RBP14784 551 aa41.1■■■■■ 4.17
SMAD2-208ENST00000587269 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP41.1■■■■■ 4.17
SMAD2-208ENST00000587269 PEAK1Q9H792 1746 aa41.07■■■■■ 4.17
SMAD2-208ENST00000587269 PLSCR1O15162 318 aa41.06■■■■■ 4.16
SMAD2-208ENST00000587269 GGNBP2Q9H3C7 697 aa41.03■■■■■ 4.16
SMAD2-208ENST00000587269 SBF2Q86WG5 1849 aa41.02■■■■■ 4.16
SMAD2-208ENST00000587269 MAP3K19Q56UN5 1328 aa41.02■■■■■ 4.16
SMAD2-208ENST00000587269 BCL9O00512 1426 aa41.01■■■■■ 4.16
SMAD2-208ENST00000587269 TNS2Q63HR2 1409 aa41.01■■■■■ 4.16
SMAD2-208ENST00000587269 FYB1O15117 783 aa41.01■■■■■ 4.16
SMAD2-208ENST00000587269 LRP5O75197 1615 aa41■■■■■ 4.15
SMAD2-208ENST00000587269 RREB1Q92766 1687 aa40.99■■■■■ 4.15
SMAD2-208ENST00000587269 HOXC9P31274 260 aa40.99■■■■■ 4.15
SMAD2-208ENST00000587269 FBLN1P23142 703 aa40.98■■■■■ 4.15
SMAD2-208ENST00000587269 PTF1AQ7RTS3 328 aa40.97■■■■■ 4.15
SMAD2-208ENST00000587269 POLR3GLQ9BT43 218 aa40.96■■■■■ 4.15
SMAD2-208ENST00000587269 NUP188Q5SRE5 1749 aa40.94■■■■■ 4.14
SMAD2-208ENST00000587269 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
SMAD2-208ENST00000587269 ACSBG1Q96GR2 724 aa40.93■■■■■ 4.14
SMAD2-208ENST00000587269 KAT6BQ8WYB5 2073 aa40.9■■■■■ 4.14
SMAD2-208ENST00000587269 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
SMAD2-208ENST00000587269 KCNQ2O43526 872 aa40.88■■■■■ 4.13
SMAD2-208ENST00000587269 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.13
SMAD2-208ENST00000587269 RTL1A6NKG5 1358 aa40.87■■■■■ 4.13
SMAD2-208ENST00000587269 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
SMAD2-208ENST00000587269 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa40.87■■■■■ 4.13
SMAD2-208ENST00000587269 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP40.87■■■■■ 4.13
SMAD2-208ENST00000587269 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
SMAD2-208ENST00000587269 TXNRD1Q16881 649 aa40.84■■■■■ 4.13
SMAD2-208ENST00000587269 CARD14Q9BXL6 1004 aa40.83■■■■■ 4.13
SMAD2-208ENST00000587269 NSD3Q9BZ95 1437 aa40.83■■■■■ 4.13
SMAD2-208ENST00000587269 KIF20BQ96Q89 1820 aa40.81■■■■■ 4.12
SMAD2-208ENST00000587269 PROM2Q8N271 834 aa40.81■■■■■ 4.12
SMAD2-208ENST00000587269 SPON1Q9HCB6 807 aa40.79■■■■■ 4.12
SMAD2-208ENST00000587269 STK32BQ9NY57 414 aa40.79■■■■■ 4.12
SMAD2-208ENST00000587269 CGNL1Q0VF96 1302 aa40.77■■■■■ 4.12
SMAD2-208ENST00000587269 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP40.77■■■■■ 4.12
SMAD2-208ENST00000587269 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
SMAD2-208ENST00000587269 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa40.76■■■■■ 4.12
SMAD2-208ENST00000587269 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
SMAD2-208ENST00000587269 NBPF6Q5VWK0 638 aa40.75■■■■■ 4.11
SMAD2-208ENST00000587269 NBPF4Q96M43 638 aa40.75■■■■■ 4.11
SMAD2-208ENST00000587269 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP40.75■■■■■ 4.11
SMAD2-208ENST00000587269 NHSQ6T4R5 1651 aa40.75■■■■■ 4.11
SMAD2-208ENST00000587269 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa40.74■■■■■ 4.11
SMAD2-208ENST00000587269 FLT4P35916 1363 aa40.74■■■■■ 4.11
SMAD2-208ENST00000587269 MYOM1P52179 1685 aa40.73■■■■■ 4.11
SMAD2-208ENST00000587269 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP40.73■■■■■ 4.11
SMAD2-208ENST00000587269 KIF24Q5T7B8 1368 aa40.73■■■■■ 4.11
SMAD2-208ENST00000587269 USHBP1Q8N6Y0 703 aa40.72■■■■■ 4.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms