RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583983.1

GPS1-222, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 5

Gene GPS1, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-222	ENST00000583983	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		30.41	■■■□□ 2.46
GPS1-222	ENST00000583983	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		30.4	■■■□□ 2.46
GPS1-222	ENST00000583983	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		30.39	■■■□□ 2.46
GPS1-222	ENST00000583983	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	30.38	■■■□□ 2.45
GPS1-222	ENST00000583983	PANK3	Q9H999	370 aa		30.37	■■■□□ 2.45
GPS1-222	ENST00000583983	ABCC6	O95255	1503 aa		30.37	■■■□□ 2.45
GPS1-222	ENST00000583983	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		30.35	■■■□□ 2.45
GPS1-222	ENST00000583983	USP35	Q9P2H5	1018 aa		30.34	■■■□□ 2.45
GPS1-222	ENST00000583983	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		30.33	■■■□□ 2.45
GPS1-222	ENST00000583983	LTN1	O94822	1766 aa		30.33	■■■□□ 2.45
GPS1-222	ENST00000583983	CRB1	P82279	1406 aa		30.32	■■■□□ 2.44
GPS1-222	ENST00000583983	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		30.32	■■■□□ 2.44
GPS1-222	ENST00000583983	RGPD5	Q99666	1765 aa		30.31	■■■□□ 2.44
GPS1-222	ENST00000583983		A0A0G2JS52	829 aa		30.31	■■■□□ 2.44
GPS1-222	ENST00000583983	FBLN1	P23142	703 aa		30.31	■■■□□ 2.44
GPS1-222	ENST00000583983	MYT1	Q01538	1121 aa		30.31	■■■□□ 2.44
GPS1-222	ENST00000583983	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		30.3	■■■□□ 2.44
GPS1-222	ENST00000583983	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		30.3	■■■□□ 2.44
GPS1-222	ENST00000583983	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		30.29	■■■□□ 2.44
GPS1-222	ENST00000583983	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		30.29	■■■□□ 2.44
GPS1-222	ENST00000583983	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	30.29	■■■□□ 2.44
GPS1-222	ENST00000583983	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		30.29	■■■□□ 2.44
GPS1-222	ENST00000583983	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		30.29	■■■□□ 2.44
GPS1-222	ENST00000583983	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	30.28	■■■□□ 2.44
GPS1-222	ENST00000583983	CCDC7	Q96M83	1385 aa		30.28	■■■□□ 2.44
GPS1-222	ENST00000583983	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		30.27	■■■□□ 2.44
GPS1-222	ENST00000583983	IP6K1	Q92551	441 aa		30.27	■■■□□ 2.44
GPS1-222	ENST00000583983	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		30.26	■■■□□ 2.43
GPS1-222	ENST00000583983	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		30.25	■■■□□ 2.43
GPS1-222	ENST00000583983	ERBB3	P21860	1342 aa		30.24	■■■□□ 2.43
GPS1-222	ENST00000583983	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	30.24	■■■□□ 2.43
GPS1-222	ENST00000583983	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	30.24	■■■□□ 2.43
GPS1-222	ENST00000583983	AMPH	P49418	695 aa		30.23	■■■□□ 2.43
GPS1-222	ENST00000583983	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		30.23	■■■□□ 2.43
GPS1-222	ENST00000583983	HOXC9	P31274	260 aa		30.22	■■■□□ 2.43
GPS1-222	ENST00000583983	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		30.22	■■■□□ 2.43
GPS1-222	ENST00000583983	RTL1	A6NKG5	1358 aa		30.2	■■■□□ 2.43
GPS1-222	ENST00000583983	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		30.19	■■■□□ 2.42
GPS1-222	ENST00000583983	EP400	Q96L91	3159 aa		30.18	■■■□□ 2.42
GPS1-222	ENST00000583983	NSD2	O96028	1365 aa		30.17	■■■□□ 2.42
GPS1-222	ENST00000583983	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		30.17	■■■□□ 2.42
GPS1-222	ENST00000583983	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		30.16	■■■□□ 2.42
GPS1-222	ENST00000583983	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	30.15	■■■□□ 2.42
GPS1-222	ENST00000583983	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		30.15	■■■□□ 2.42
GPS1-222	ENST00000583983	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	30.13	■■■□□ 2.41
GPS1-222	ENST00000583983	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		30.13	■■■□□ 2.41
GPS1-222	ENST00000583983	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	30.13	■■■□□ 2.41
GPS1-222	ENST00000583983	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	30.12	■■■□□ 2.41
GPS1-222	ENST00000583983	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	30.12	■■■□□ 2.41
GPS1-222	ENST00000583983	FAM182B	Q5T319	152 aa		30.12	■■■□□ 2.41
GPS1-222	ENST00000583983	PEAK1	Q9H792	1746 aa		30.12	■■■□□ 2.41
GPS1-222	ENST00000583983	FLT4	P35916	1363 aa		30.12	■■■□□ 2.41
GPS1-222	ENST00000583983	PDE3B	Q13370	1112 aa		30.11	■■■□□ 2.41
GPS1-222	ENST00000583983	DISP2	A7MBM2	1401 aa		30.11	■■■□□ 2.41
GPS1-222	ENST00000583983	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	30.1	■■■□□ 2.41
GPS1-222	ENST00000583983	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		30.1	■■■□□ 2.41
GPS1-222	ENST00000583983	INSR	P06213	1382 aa		30.1	■■■□□ 2.41
GPS1-222	ENST00000583983	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		30.1	■■■□□ 2.41
GPS1-222	ENST00000583983	MORC1	Q86VD1	984 aa		30.08	■■■□□ 2.41
GPS1-222	ENST00000583983	CCDC125	Q86Z20	511 aa		30.08	■■■□□ 2.41
GPS1-222	ENST00000583983	POLK	Q9UBT6	870 aa		30.08	■■■□□ 2.41
GPS1-222	ENST00000583983	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	30.07	■■■□□ 2.41
GPS1-222	ENST00000583983	DDB1	Q16531	1140 aa		30.07	■■■□□ 2.4
GPS1-222	ENST00000583983	LRRC37A3	O60309	1634 aa		30.07	■■■□□ 2.4
GPS1-222	ENST00000583983	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	30.06	■■■□□ 2.4
GPS1-222	ENST00000583983	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	30.06	■■■□□ 2.4
GPS1-222	ENST00000583983	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	30.05	■■■□□ 2.4
GPS1-222	ENST00000583983	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	30.05	■■■□□ 2.4
GPS1-222	ENST00000583983	IL2RB	P14784	551 aa		30.03	■■■□□ 2.4
GPS1-222	ENST00000583983	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		30.03	■■■□□ 2.4
GPS1-222	ENST00000583983	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		30.02	■■■□□ 2.4
GPS1-222	ENST00000583983	NBPF4	Q96M43	638 aa		30.02	■■■□□ 2.4
GPS1-222	ENST00000583983	EXOC5	O00471	708 aa		30	■■■□□ 2.39
GPS1-222	ENST00000583983	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		30	■■■□□ 2.39
GPS1-222	ENST00000583983	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		29.99	■■■□□ 2.39
GPS1-222	ENST00000583983	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	29.98	■■■□□ 2.39
GPS1-222	ENST00000583983	TNS2	Q63HR2	1409 aa		29.97	■■■□□ 2.39
GPS1-222	ENST00000583983	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	29.97	■■■□□ 2.39
GPS1-222	ENST00000583983	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	29.96	■■■□□ 2.39
GPS1-222	ENST00000583983	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		29.96	■■■□□ 2.39
GPS1-222	ENST00000583983	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		29.95	■■■□□ 2.39
GPS1-222	ENST00000583983	TRIM37	O94972	964 aa		29.93	■■■□□ 2.38
GPS1-222	ENST00000583983	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		29.91	■■■□□ 2.38
GPS1-222	ENST00000583983	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	29.9	■■■□□ 2.38
GPS1-222	ENST00000583983	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		29.9	■■■□□ 2.38
GPS1-222	ENST00000583983	MEGF6	O75095	1541 aa		29.9	■■■□□ 2.38
GPS1-222	ENST00000583983	BCL9	O00512	1426 aa		29.89	■■■□□ 2.38
GPS1-222	ENST00000583983	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	29.88	■■■□□ 2.37
GPS1-222	ENST00000583983	EYA1	Q99502	592 aa		29.88	■■■□□ 2.37
GPS1-222	ENST00000583983	NCAPD2	Q15021	1401 aa		29.88	■■■□□ 2.37
GPS1-222	ENST00000583983	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		29.87	■■■□□ 2.37
GPS1-222	ENST00000583983	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	29.87	■■■□□ 2.37
GPS1-222	ENST00000583983	BAG6	P46379	1132 aa		29.86	■■■□□ 2.37
GPS1-222	ENST00000583983	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	29.84	■■■□□ 2.37
GPS1-222	ENST00000583983	MTHFS	P49914	203 aa		29.84	■■■□□ 2.37
GPS1-222	ENST00000583983	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	29.84	■■■□□ 2.37
GPS1-222	ENST00000583983	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	29.82	■■■□□ 2.36
GPS1-222	ENST00000583983	SBF2	Q86WG5	1849 aa		29.81	■■■□□ 2.36
GPS1-222	ENST00000583983	APBA3	O96018	575 aa		29.81	■■■□□ 2.36
GPS1-222	ENST00000583983	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		29.8	■■■□□ 2.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms