RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	USP47	Q96K76	1375 aa		13.16	□□□□□ -0.3
KIFC3-231	ENST00000567479	PIK3C2A	O00443	1686 aa		13.15	□□□□□ -0.3
KIFC3-231	ENST00000567479	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		13.15	□□□□□ -0.3
KIFC3-231	ENST00000567479	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		13.15	□□□□□ -0.3
KIFC3-231	ENST00000567479	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
KIFC3-231	ENST00000567479	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
KIFC3-231	ENST00000567479	CDCA8	Q53HL2	280 aa		13.15	□□□□□ -0.3
KIFC3-231	ENST00000567479	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A1W2PP64	1363 aa		13.15	□□□□□ -0.3
KIFC3-231	ENST00000567479	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		13.15	□□□□□ -0.3
KIFC3-231	ENST00000567479	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
KIFC3-231	ENST00000567479	APBA3	O96018	575 aa		13.14	□□□□□ -0.31
KIFC3-231	ENST00000567479	DDB1	Q16531	1140 aa		13.14	□□□□□ -0.31
KIFC3-231	ENST00000567479	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
KIFC3-231	ENST00000567479	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		13.14	□□□□□ -0.31
KIFC3-231	ENST00000567479	AKAP12	Q02952	1782 aa		13.14	□□□□□ -0.31
KIFC3-231	ENST00000567479	COG3	Q96JB2	828 aa		13.12	□□□□□ -0.31
KIFC3-231	ENST00000567479	EXOC5	O00471	708 aa		13.11	□□□□□ -0.31
KIFC3-231	ENST00000567479	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
KIFC3-231	ENST00000567479	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		13.1	□□□□□ -0.31
KIFC3-231	ENST00000567479	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		13.1	□□□□□ -0.31
KIFC3-231	ENST00000567479	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		13.1	□□□□□ -0.31
KIFC3-231	ENST00000567479	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		13.1	□□□□□ -0.31
KIFC3-231	ENST00000567479	COL18A1	P39060	1754 aa		13.09	□□□□□ -0.31
KIFC3-231	ENST00000567479	NFAT5	O94916	1531 aa		13.09	□□□□□ -0.31
KIFC3-231	ENST00000567479	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		13.09	□□□□□ -0.31
KIFC3-231	ENST00000567479	IP6K1	Q92551	441 aa		13.09	□□□□□ -0.31
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC7	Q96M83	1385 aa		13.08	□□□□□ -0.31
KIFC3-231	ENST00000567479	FYB1	O15117	783 aa		13.08	□□□□□ -0.32
KIFC3-231	ENST00000567479	ERBB3	P21860	1342 aa		13.08	□□□□□ -0.32
KIFC3-231	ENST00000567479	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		13.07	□□□□□ -0.32
KIFC3-231	ENST00000567479	DISP2	A7MBM2	1401 aa		13.07	□□□□□ -0.32
KIFC3-231	ENST00000567479	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		13.07	□□□□□ -0.32
KIFC3-231	ENST00000567479	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
KIFC3-231	ENST00000567479	FBLN1	P23142	703 aa		13.07	□□□□□ -0.32
KIFC3-231	ENST00000567479	AMPH	P49418	695 aa		13.07	□□□□□ -0.32
KIFC3-231	ENST00000567479	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
KIFC3-231	ENST00000567479	IL2RB	P14784	551 aa		13.06	□□□□□ -0.32
KIFC3-231	ENST00000567479	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
KIFC3-231	ENST00000567479	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		13.06	□□□□□ -0.32
KIFC3-231	ENST00000567479	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		13.05	□□□□□ -0.32
KIFC3-231	ENST00000567479	ABCC6	O95255	1503 aa		13.05	□□□□□ -0.32
KIFC3-231	ENST00000567479	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	13.05	□□□□□ -0.32
KIFC3-231	ENST00000567479	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
KIFC3-231	ENST00000567479	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		13.05	□□□□□ -0.32
KIFC3-231	ENST00000567479	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		13.05	□□□□□ -0.32
KIFC3-231	ENST00000567479	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		13.05	□□□□□ -0.32
KIFC3-231	ENST00000567479	HOXC9	P31274	260 aa		13.04	□□□□□ -0.32
KIFC3-231	ENST00000567479	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
KIFC3-231	ENST00000567479	NBPF14	Q5TI25	921 aa		13.04	□□□□□ -0.32
KIFC3-231	ENST00000567479	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		13.04	□□□□□ -0.32
KIFC3-231	ENST00000567479	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		13.04	□□□□□ -0.32
KIFC3-231	ENST00000567479	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
KIFC3-231	ENST00000567479	PLSCR1	O15162	318 aa		13.03	□□□□□ -0.32
KIFC3-231	ENST00000567479	USP54	Q70EL1	1684 aa		13.02	□□□□□ -0.32
KIFC3-231	ENST00000567479	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
KIFC3-231	ENST00000567479	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
KIFC3-231	ENST00000567479	RGPD5	Q99666	1765 aa		13.02	□□□□□ -0.33
KIFC3-231	ENST00000567479	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		13.01	□□□□□ -0.33
KIFC3-231	ENST00000567479	BCL9	O00512	1426 aa		13.01	□□□□□ -0.33
KIFC3-231	ENST00000567479	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
KIFC3-231	ENST00000567479	LRRC37A3	O60309	1634 aa		12.99	□□□□□ -0.33
KIFC3-231	ENST00000567479	KCNQ2	O43526	872 aa		12.99	□□□□□ -0.33
KIFC3-231	ENST00000567479	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
KIFC3-231	ENST00000567479	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		12.98	□□□□□ -0.33
KIFC3-231	ENST00000567479	TNS2	Q63HR2	1409 aa		12.98	□□□□□ -0.33
KIFC3-231	ENST00000567479	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		12.98	□□□□□ -0.33
KIFC3-231	ENST00000567479	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		12.98	□□□□□ -0.33
KIFC3-231	ENST00000567479	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		12.98	□□□□□ -0.33
KIFC3-231	ENST00000567479	NBPF4	Q96M43	638 aa		12.98	□□□□□ -0.33
KIFC3-231	ENST00000567479	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		12.97	□□□□□ -0.33
KIFC3-231	ENST00000567479	LTN1	O94822	1766 aa		12.97	□□□□□ -0.33
KIFC3-231	ENST00000567479	RTL1	A6NKG5	1358 aa		12.97	□□□□□ -0.33
KIFC3-231	ENST00000567479	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		12.97	□□□□□ -0.33
KIFC3-231	ENST00000567479	PROM2	Q8N271	834 aa		12.97	□□□□□ -0.33
KIFC3-231	ENST00000567479	PEAK1	Q9H792	1746 aa		12.96	□□□□□ -0.33
KIFC3-231	ENST00000567479	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
KIFC3-231	ENST00000567479	TXNRD1	Q16881	649 aa		12.96	□□□□□ -0.33
KIFC3-231	ENST00000567479	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
KIFC3-231	ENST00000567479	PANK3	Q9H999	370 aa		12.96	□□□□□ -0.33
KIFC3-231	ENST00000567479	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
KIFC3-231	ENST00000567479	INSR	P06213	1382 aa		12.94	□□□□□ -0.34
KIFC3-231	ENST00000567479	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		12.94	□□□□□ -0.34
KIFC3-231	ENST00000567479	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		12.94	□□□□□ -0.34
KIFC3-231	ENST00000567479	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		12.94	□□□□□ -0.34
KIFC3-231	ENST00000567479	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		12.94	□□□□□ -0.34
KIFC3-231	ENST00000567479	FLT4	P35916	1363 aa		12.94	□□□□□ -0.34
KIFC3-231	ENST00000567479	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
KIFC3-231	ENST00000567479	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		12.92	□□□□□ -0.34
KIFC3-231	ENST00000567479	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
KIFC3-231	ENST00000567479	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		12.91	□□□□□ -0.34
KIFC3-231	ENST00000567479	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
KIFC3-231	ENST00000567479	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
KIFC3-231	ENST00000567479	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
KIFC3-231	ENST00000567479	STK32B	Q9NY57	414 aa		12.91	□□□□□ -0.34
KIFC3-231	ENST00000567479	POLK	Q9UBT6	870 aa		12.91	□□□□□ -0.34
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC15A2	Q16348	729 aa		12.9	□□□□□ -0.34
KIFC3-231	ENST00000567479	SPON1	Q9HCB6	807 aa		12.9	□□□□□ -0.34
KIFC3-231	ENST00000567479	SBF2	Q86WG5	1849 aa		12.9	□□□□□ -0.34
KIFC3-231	ENST00000567479	MYOM1	P52179	1685 aa		12.89	□□□□□ -0.35

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms