RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561904.5

E2F4-202, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene E2F4, Length 897 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-202ENST00000561904 WDR17Q8IZU2 1322 aa25.26■■□□□ 1.63
E2F4-202ENST00000561904 DDB1Q16531 1140 aa25.25■■□□□ 1.63
E2F4-202ENST00000561904 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa25.24■■□□□ 1.63
E2F4-202ENST00000561904 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa25.24■■□□□ 1.63
E2F4-202ENST00000561904 OVOS2Q6IE36 1432 aa25.24■■□□□ 1.63
E2F4-202ENST00000561904 TTC21AQ8NDW8 1320 aa25.24■■□□□ 1.63
E2F4-202ENST00000561904 SBF2Q86WG5 1849 aa25.23■■□□□ 1.63
E2F4-202ENST00000561904 MON2Q7Z3U7 1717 aa25.23■■□□□ 1.63
E2F4-202ENST00000561904 NFAT5O94916 1531 aa25.23■■□□□ 1.63
E2F4-202ENST00000561904 PTF1AQ7RTS3 328 aa25.23■■□□□ 1.63
E2F4-202ENST00000561904 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.63
E2F4-202ENST00000561904 KCNH5Q8NCM2 988 aa25.23■■□□□ 1.63
E2F4-202ENST00000561904 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.23■■□□□ 1.63
E2F4-202ENST00000561904 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa25.22■■□□□ 1.63
E2F4-202ENST00000561904 NBPF14Q5TI25 921 aa25.2■■□□□ 1.62
E2F4-202ENST00000561904 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
E2F4-202ENST00000561904 TMC1Q8TDI8 760 aa25.19■■□□□ 1.62
E2F4-202ENST00000561904 CD163L1Q9NR16 1453 aa25.19■■□□□ 1.62
E2F4-202ENST00000561904 NME9Q86XW9 330 aa25.18■■□□□ 1.62
E2F4-202ENST00000561904 CARD10Q9BWT7 1032 aa25.17■■□□□ 1.62
E2F4-202ENST00000561904 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.17■■□□□ 1.62
E2F4-202ENST00000561904 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
E2F4-202ENST00000561904 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.15■■□□□ 1.62
E2F4-202ENST00000561904 TONSLQ96HA7 1378 aa25.15■■□□□ 1.62
E2F4-202ENST00000561904 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
E2F4-202ENST00000561904 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
E2F4-202ENST00000561904 USP31Q70CQ4 1352 aa25.12■■□□□ 1.61
E2F4-202ENST00000561904 USP54Q70EL1 1684 aa25.12■■□□□ 1.61
E2F4-202ENST00000561904 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
E2F4-202ENST00000561904 LTN1O94822 1766 aa25.12■■□□□ 1.61
E2F4-202ENST00000561904 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.12■■□□□ 1.61
E2F4-202ENST00000561904 PLSCR1O15162 318 aa25.11■■□□□ 1.61
E2F4-202ENST00000561904 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
E2F4-202ENST00000561904 EXOC5O00471 708 aa25.1■■□□□ 1.61
E2F4-202ENST00000561904 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
E2F4-202ENST00000561904 ABCC6O95255 1503 aa25.09■■□□□ 1.61
E2F4-202ENST00000561904 A0A1W2PP64 1363 aa25.08■■□□□ 1.61
E2F4-202ENST00000561904 CCDC7Q96M83 1385 aa25.08■■□□□ 1.61
E2F4-202ENST00000561904 PROM2Q8N271 834 aa25.08■■□□□ 1.61
E2F4-202ENST00000561904 NLRP2Q9NX02 1062 aa25.08■■□□□ 1.61
E2F4-202ENST00000561904 ERBB3P21860 1342 aa25.07■■□□□ 1.6
E2F4-202ENST00000561904 BCL9O00512 1426 aa25.06■■□□□ 1.6
E2F4-202ENST00000561904 TNS2Q63HR2 1409 aa25.06■■□□□ 1.6
E2F4-202ENST00000561904 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
E2F4-202ENST00000561904 KCNQ2O43526 872 aa25.05■■□□□ 1.6
E2F4-202ENST00000561904 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
E2F4-202ENST00000561904 SPON1Q9HCB6 807 aa25.05■■□□□ 1.6
E2F4-202ENST00000561904 ANKRD24Q8TF21 1146 aa25.04■■□□□ 1.6
E2F4-202ENST00000561904 ACSBG1Q96GR2 724 aa25.03■■□□□ 1.6
E2F4-202ENST00000561904 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.03■■□□□ 1.6
E2F4-202ENST00000561904 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
E2F4-202ENST00000561904 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.02■■□□□ 1.6
E2F4-202ENST00000561904 CASZ1Q86V15 1759 aa25.02■■□□□ 1.6
E2F4-202ENST00000561904 TXNRD1Q16881 649 aa25.01■■□□□ 1.59
E2F4-202ENST00000561904 TESK2Q96S53 571 aa25.01■■□□□ 1.59
E2F4-202ENST00000561904 NHSQ6T4R5 1651 aa25■■□□□ 1.59
E2F4-202ENST00000561904 IL2RBP14784 551 aa24.98■■□□□ 1.59
E2F4-202ENST00000561904 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
E2F4-202ENST00000561904 ZBTB7AO95365 584 aa24.97■■□□□ 1.59
E2F4-202ENST00000561904 FBLN1P23142 703 aa24.97■■□□□ 1.59
E2F4-202ENST00000561904 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
E2F4-202ENST00000561904 STK32BQ9NY57 414 aa24.94■■□□□ 1.58
E2F4-202ENST00000561904 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24.93■■□□□ 1.58
E2F4-202ENST00000561904 IP6K1Q92551 441 aa24.93■■□□□ 1.58
E2F4-202ENST00000561904 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
E2F4-202ENST00000561904 BTAF1O14981 1849 aa24.93■■□□□ 1.58
E2F4-202ENST00000561904 SLC15A2Q16348 729 aa24.92■■□□□ 1.58
E2F4-202ENST00000561904 MYOM1P52179 1685 aa24.91■■□□□ 1.58
E2F4-202ENST00000561904 COG3Q96JB2 828 aa24.91■■□□□ 1.58
E2F4-202ENST00000561904 MAP3K19Q56UN5 1328 aa24.9■■□□□ 1.58
E2F4-202ENST00000561904 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.9■■□□□ 1.58
E2F4-202ENST00000561904 RGPD2P0DJD1 1756 aa24.9■■□□□ 1.58
E2F4-202ENST00000561904 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
E2F4-202ENST00000561904 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
E2F4-202ENST00000561904 PTGER2P43116 358 aa24.88■■□□□ 1.57
E2F4-202ENST00000561904 HOXC9P31274 260 aa24.87■■□□□ 1.57
E2F4-202ENST00000561904 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.86■■□□□ 1.57
E2F4-202ENST00000561904 AMPHP49418 695 aa24.86■■□□□ 1.57
E2F4-202ENST00000561904 PAPPAQ13219 1627 aa24.86■■□□□ 1.57
E2F4-202ENST00000561904 YY1P25490 414 aa24.85■■□□□ 1.57
E2F4-202ENST00000561904 USP47Q96K76 1375 aa24.84■■□□□ 1.57
E2F4-202ENST00000561904 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
E2F4-202ENST00000561904 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
E2F4-202ENST00000561904 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.84■■□□□ 1.57
E2F4-202ENST00000561904 LRRC4BQ9NT99 713 aa24.84■■□□□ 1.57
E2F4-202ENST00000561904 ZNF827Q17R98 1081 aa24.83■■□□□ 1.57
E2F4-202ENST00000561904 FYB1O15117 783 aa24.81■■□□□ 1.56
E2F4-202ENST00000561904 TMF1P82094 1093 aa24.81■■□□□ 1.56
E2F4-202ENST00000561904 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.81■■□□□ 1.56
E2F4-202ENST00000561904 SHANK3Q9BYB0 1731 aa24.81■■□□□ 1.56
E2F4-202ENST00000561904 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.8■■□□□ 1.56
E2F4-202ENST00000561904 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
E2F4-202ENST00000561904 MTFR1LQ9H019 292 aa24.8■■□□□ 1.56
E2F4-202ENST00000561904 MEGF6O75095 1541 aa24.8■■□□□ 1.56
E2F4-202ENST00000561904 UTRNP46939 3433 aa24.8■■□□□ 1.56
E2F4-202ENST00000561904 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.79■■□□□ 1.56
E2F4-202ENST00000561904 SLC24A1O60721 1099 aa24.79■■□□□ 1.56
E2F4-202ENST00000561904 KCNQ4P56696 695 aa24.79■■□□□ 1.56
E2F4-202ENST00000561904 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
E2F4-202ENST00000561904 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms