RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540665.5

TTC28-AS1-221, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-221ENST00000540665 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.19
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.5■■□□□ 1.19
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EVA1CP58658 441 aa22.49■■□□□ 1.19
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.49■■□□□ 1.19
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SOX12O15370 315 aa22.46■■□□□ 1.19
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BARGINQ6ZT62 677 aa22.46■■□□□ 1.19
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.46■■□□□ 1.19
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.45■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 COG3Q96JB2 828 aa22.45■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.45■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LRRC37A3O60309 1634 aa22.45■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.44■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.43■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 A0A0G2JS52 829 aa22.42■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FYB1O15117 783 aa22.42■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MYT1Q01538 1121 aa22.42■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.42■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.42■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.41■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RTL1A6NKG5 1358 aa22.39■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 USP35Q9P2H5 1018 aa22.39■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ERBB3P21860 1342 aa22.38■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CCDC125Q86Z20 511 aa22.38■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.37■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.37■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PEAK1Q9H792 1746 aa22.37■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CCDC7Q96M83 1385 aa22.37■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-221ENST00000540665 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.36■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.35■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.35■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DISP2A7MBM2 1401 aa22.35■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.35■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.35■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.34■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IP6K1Q92551 441 aa22.34■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.33■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.33■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SBF2Q86WG5 1849 aa22.33■■□□□ 1.16
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NSD2O96028 1365 aa22.32■■□□□ 1.16
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HOXC9P31274 260 aa22.3■■□□□ 1.16
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.3■■□□□ 1.16
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PANK3Q9H999 370 aa22.29■■□□□ 1.16
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FLT4P35916 1363 aa22.28■■□□□ 1.16
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AMPHP49418 695 aa22.28■■□□□ 1.16
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PDE3BQ13370 1112 aa22.28■■□□□ 1.16
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TNS2Q63HR2 1409 aa22.28■■□□□ 1.16
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.27■■□□□ 1.16
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FBLN1P23142 703 aa22.26■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.26■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-221ENST00000540665 INSRP06213 1382 aa22.25■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DDB1Q16531 1140 aa22.25■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.25■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.24■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.24■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BCL9O00512 1426 aa22.23■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAM182BQ5T319 152 aa22.23■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RREB1Q92766 1687 aa22.2■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IL2RBP14784 551 aa22.2■■□□□ 1.14
TTC28-AS1-221ENST00000540665 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.2■■□□□ 1.14
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NHSQ6T4R5 1651 aa22.2■■□□□ 1.14
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.19■■□□□ 1.14
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.18■■□□□ 1.14
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NCAPD2Q15021 1401 aa22.17■■□□□ 1.14
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BAG6P46379 1132 aa22.17■■□□□ 1.14
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.17■■□□□ 1.14
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.17■■□□□ 1.14
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EXOC5O00471 708 aa22.16■■□□□ 1.14
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TTC28-AS1-221ENST00000540665 POLKQ9UBT6 870 aa22.15■■□□□ 1.14
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MEGF6O75095 1541 aa22.15■■□□□ 1.14
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRIM37O94972 964 aa22.14■■□□□ 1.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.14■■□□□ 1.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.14■■□□□ 1.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.13■■□□□ 1.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.13■■□□□ 1.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.12■■□□□ 1.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NBPF4Q96M43 638 aa22.12■■□□□ 1.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.11■■□□□ 1.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MORC1Q86VD1 984 aa22.11■■□□□ 1.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BTAF1O14981 1849 aa22.09■■□□□ 1.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.07■■□□□ 1.12
TTC28-AS1-221ENST00000540665 APBA3O96018 575 aa22.06■■□□□ 1.12
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
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