RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530500.5

ATG13-216, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG13, Length 2,030 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-216ENST00000530500 DIP2AQ14689 1571 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG13-216ENST00000530500 NRKQ7Z2Y5 1582 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG13-216ENST00000530500 PTCH1Q13635 1447 aa20.6■□□□□ 0.89
ATG13-216ENST00000530500 PTPRUQ92729 1446 aa20.6■□□□□ 0.89
ATG13-216ENST00000530500 TRIM27P14373 513 aa20.6■□□□□ 0.89
ATG13-216ENST00000530500 SLC26A8Q96RN1 970 aa20.6■□□□□ 0.89
ATG13-216ENST00000530500 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
ATG13-216ENST00000530500 GNAI1P63096 354 aa20.6■□□□□ 0.89
ATG13-216ENST00000530500 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa20.6■□□□□ 0.89
ATG13-216ENST00000530500 USP6P35125 1406 aa20.59■□□□□ 0.89
ATG13-216ENST00000530500 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
ATG13-216ENST00000530500 IFT57Q9NWB7 429 aa20.59■□□□□ 0.89
ATG13-216ENST00000530500 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
ATG13-216ENST00000530500 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa20.57■□□□□ 0.88
ATG13-216ENST00000530500 OVOS2Q6IE36 1432 aa20.57■□□□□ 0.88
ATG13-216ENST00000530500 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
ATG13-216ENST00000530500 TTC21AQ8NDW8 1320 aa20.55■□□□□ 0.88
ATG13-216ENST00000530500 ZNF853P0CG23 659 aa20.54■□□□□ 0.88
ATG13-216ENST00000530500 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
ATG13-216ENST00000530500 USP31Q70CQ4 1352 aa20.54■□□□□ 0.88
ATG13-216ENST00000530500 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.54■□□□□ 0.88
ATG13-216ENST00000530500 NALCNQ8IZF0 1738 aa20.54■□□□□ 0.88
ATG13-216ENST00000530500 SSH2Q76I76 1423 aa20.53■□□□□ 0.88
ATG13-216ENST00000530500 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
ATG13-216ENST00000530500 DLG5Q8TDM6 1919 aa20.53■□□□□ 0.88
ATG13-216ENST00000530500 CFAP44Q96MT7 982 aa20.53■□□□□ 0.88
ATG13-216ENST00000530500 ARHGAP45Q92619 1136 aa20.52■□□□□ 0.88
ATG13-216ENST00000530500 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
ATG13-216ENST00000530500 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa20.52■□□□□ 0.88
ATG13-216ENST00000530500 VAMP4O75379 141 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG13-216ENST00000530500 NUTM2FA1L443 756 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG13-216ENST00000530500 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ATG13-216ENST00000530500 PIK3R4Q99570 1358 aa20.5■□□□□ 0.87
ATG13-216ENST00000530500 TMEM57Q8N5G2 664 aa20.5■□□□□ 0.87
ATG13-216ENST00000530500 MBIPQ9NS73 344 aa20.49■□□□□ 0.87
ATG13-216ENST00000530500 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa20.49■□□□□ 0.87
ATG13-216ENST00000530500 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
ATG13-216ENST00000530500 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
ATG13-216ENST00000530500 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
ATG13-216ENST00000530500 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG13-216ENST00000530500 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG13-216ENST00000530500 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
ATG13-216ENST00000530500 ANKARQ7Z5J8 1434 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG13-216ENST00000530500 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
ATG13-216ENST00000530500 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ATG13-216ENST00000530500 NBR1Q14596 966 aa20.46■□□□□ 0.87
ATG13-216ENST00000530500 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
ATG13-216ENST00000530500 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ATG13-216ENST00000530500 RGPD1P0DJD0 1748 aa20.44■□□□□ 0.86
ATG13-216ENST00000530500 PEAK1Q9H792 1746 aa20.44■□□□□ 0.86
ATG13-216ENST00000530500 SMC5Q8IY18 1101 aa20.44■□□□□ 0.86
ATG13-216ENST00000530500 TSPYL6Q8N831 410 aa20.44■□□□□ 0.86
ATG13-216ENST00000530500 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
ATG13-216ENST00000530500 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
ATG13-216ENST00000530500 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa20.43■□□□□ 0.86
ATG13-216ENST00000530500 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
ATG13-216ENST00000530500 ARHGEF10O15013 1369 aa20.43■□□□□ 0.86
ATG13-216ENST00000530500 SBNO1A3KN83 1393 aa20.42■□□□□ 0.86
ATG13-216ENST00000530500 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
ATG13-216ENST00000530500 AEBP1Q8IUX7 1158 aa20.42■□□□□ 0.86
ATG13-216ENST00000530500 FLT4P35916 1363 aa20.42■□□□□ 0.86
ATG13-216ENST00000530500 FAM83GA6ND36 823 aa20.41■□□□□ 0.86
ATG13-216ENST00000530500 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
ATG13-216ENST00000530500 USP35Q9P2H5 1018 aa20.41■□□□□ 0.86
ATG13-216ENST00000530500 MAP3K19Q56UN5 1328 aa20.41■□□□□ 0.86
ATG13-216ENST00000530500 KCNA6P17658 529 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG13-216ENST00000530500 C8orf58Q8NAV2 365 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG13-216ENST00000530500 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
ATG13-216ENST00000530500 FMN2Q9NZ56 1722 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG13-216ENST00000530500 ABCC4O15439 1325 aa20.39■□□□□ 0.85
ATG13-216ENST00000530500 USP19O94966 1318 aa20.39■□□□□ 0.85
ATG13-216ENST00000530500 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
ATG13-216ENST00000530500 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
ATG13-216ENST00000530500 KIF24Q5T7B8 1368 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG13-216ENST00000530500 CHL1O00533 1208 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG13-216ENST00000530500 DCTN1Q14203 1278 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG13-216ENST00000530500 KIAA0232Q92628 1395 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG13-216ENST00000530500 PIK3C2AO00443 1686 aa20.36■□□□□ 0.85
ATG13-216ENST00000530500 AMPHP49418 695 aa20.36■□□□□ 0.85
ATG13-216ENST00000530500 ANKLE2Q86XL3 938 aa20.36■□□□□ 0.85
ATG13-216ENST00000530500 KDRP35968 1356 aa20.36■□□□□ 0.85
ATG13-216ENST00000530500 SEC24BO95487 1268 aa20.36■□□□□ 0.85
ATG13-216ENST00000530500 SOX12O15370 315 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG13-216ENST00000530500 NLRP6P59044 892 aa20.34■□□□□ 0.85
ATG13-216ENST00000530500 NUCB1Q02818 461 aa20.34■□□□□ 0.85
ATG13-216ENST00000530500 GCC1Q96CN9 775 aa20.34■□□□□ 0.85
ATG13-216ENST00000530500 USP54Q70EL1 1684 aa20.34■□□□□ 0.85
ATG13-216ENST00000530500 IGSF1Q8N6C5 1336 aa20.33■□□□□ 0.85
ATG13-216ENST00000530500 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
ATG13-216ENST00000530500 MCM10Q7L590 875 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG13-216ENST00000530500 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
ATG13-216ENST00000530500 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
ATG13-216ENST00000530500 BECN1Q14457 450 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG13-216ENST00000530500 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG13-216ENST00000530500 CRB1P82279 1406 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG13-216ENST00000530500 SLC4A3P48751 1232 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG13-216ENST00000530500 TBC1D32Q96NH3 1257 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG13-216ENST00000530500 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ATG13-216ENST00000530500 CHD1LQ86WJ1 897 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG13-216ENST00000530500 EYA1Q99502 592 aa20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms