RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530005.5

SLC43A3-217, Transcript of solute carrier family 43 member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLC43A3, Length 1,434 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A3-217ENST00000530005 ABCC6O95255 1503 aa26.98■■□□□ 1.91
SLC43A3-217ENST00000530005 RGPD5Q99666 1765 aa26.97■■□□□ 1.91
SLC43A3-217ENST00000530005 BARGINQ6ZT62 677 aa26.96■■□□□ 1.91
SLC43A3-217ENST00000530005 KRT27Q7Z3Y8 459 aa26.96■■□□□ 1.91
SLC43A3-217ENST00000530005 CRB1P82279 1406 aa26.95■■□□□ 1.9
SLC43A3-217ENST00000530005 CARD14Q9BXL6 1004 aa26.94■■□□□ 1.9
SLC43A3-217ENST00000530005 USP35Q9P2H5 1018 aa26.94■■□□□ 1.9
SLC43A3-217ENST00000530005 A0A0G2JS52 829 aa26.93■■□□□ 1.9
SLC43A3-217ENST00000530005 FYB1O15117 783 aa26.93■■□□□ 1.9
SLC43A3-217ENST00000530005 MYT1Q01538 1121 aa26.93■■□□□ 1.9
SLC43A3-217ENST00000530005 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.93■■□□□ 1.9
SLC43A3-217ENST00000530005 LTN1O94822 1766 aa26.93■■□□□ 1.9
SLC43A3-217ENST00000530005 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.92■■□□□ 1.9
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SLC43A3-217ENST00000530005 CCDC125Q86Z20 511 aa26.87■■□□□ 1.89
SLC43A3-217ENST00000530005 GGNBP2Q9H3C7 697 aa26.87■■□□□ 1.89
SLC43A3-217ENST00000530005 KIF20BQ96Q89 1820 aa26.87■■□□□ 1.89
SLC43A3-217ENST00000530005 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.86■■□□□ 1.89
SLC43A3-217ENST00000530005 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
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SLC43A3-217ENST00000530005 ERBB3P21860 1342 aa26.85■■□□□ 1.89
SLC43A3-217ENST00000530005 FBLN1P23142 703 aa26.84■■□□□ 1.89
SLC43A3-217ENST00000530005 FAM182BQ5T319 152 aa26.83■■□□□ 1.89
SLC43A3-217ENST00000530005 CARD10Q9BWT7 1032 aa26.83■■□□□ 1.89
SLC43A3-217ENST00000530005 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.83■■□□□ 1.89
SLC43A3-217ENST00000530005 IP6K1Q92551 441 aa26.82■■□□□ 1.88
SLC43A3-217ENST00000530005 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.82■■□□□ 1.88
SLC43A3-217ENST00000530005 WNK3Q9BYP7 1800 aa26.82■■□□□ 1.88
SLC43A3-217ENST00000530005 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.8■■□□□ 1.88
SLC43A3-217ENST00000530005 DISP2A7MBM2 1401 aa26.79■■□□□ 1.88
SLC43A3-217ENST00000530005 LRRC37A3O60309 1634 aa26.78■■□□□ 1.88
SLC43A3-217ENST00000530005 ANKRD24Q8TF21 1146 aa26.78■■□□□ 1.88
SLC43A3-217ENST00000530005 CCDC7Q96M83 1385 aa26.77■■□□□ 1.88
SLC43A3-217ENST00000530005 HOXC9P31274 260 aa26.76■■□□□ 1.87
SLC43A3-217ENST00000530005 PDE3BQ13370 1112 aa26.75■■□□□ 1.87
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SLC43A3-217ENST00000530005 PANK3Q9H999 370 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC43A3-217ENST00000530005 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC43A3-217ENST00000530005 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC43A3-217ENST00000530005 RTL1A6NKG5 1358 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC43A3-217ENST00000530005 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
SLC43A3-217ENST00000530005 FAM196AQ6ZSG2 479 aa26.73■■□□□ 1.87
SLC43A3-217ENST00000530005 AMPHP49418 695 aa26.73■■□□□ 1.87
SLC43A3-217ENST00000530005 NLRP2Q9NX02 1062 aa26.73■■□□□ 1.87
SLC43A3-217ENST00000530005 PEAK1Q9H792 1746 aa26.72■■□□□ 1.87
SLC43A3-217ENST00000530005 DEFB132Q7Z7B7 95 aa26.72■■□□□ 1.87
SLC43A3-217ENST00000530005 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
SLC43A3-217ENST00000530005 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.71■■□□□ 1.87
SLC43A3-217ENST00000530005 DDB1Q16531 1140 aa26.71■■□□□ 1.87
SLC43A3-217ENST00000530005 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
SLC43A3-217ENST00000530005 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa26.69■■□□□ 1.86
SLC43A3-217ENST00000530005 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.69■■□□□ 1.86
SLC43A3-217ENST00000530005 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
SLC43A3-217ENST00000530005 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
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SLC43A3-217ENST00000530005 TRIM37O94972 964 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC43A3-217ENST00000530005 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
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SLC43A3-217ENST00000530005 TNS2Q63HR2 1409 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC43A3-217ENST00000530005 INSRP06213 1382 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC43A3-217ENST00000530005 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC43A3-217ENST00000530005 IL2RBP14784 551 aa26.64■■□□□ 1.85
SLC43A3-217ENST00000530005 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa26.64■■□□□ 1.85
SLC43A3-217ENST00000530005 BCL9O00512 1426 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC43A3-217ENST00000530005 BAG6P46379 1132 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC43A3-217ENST00000530005 NSD2O96028 1365 aa26.62■■□□□ 1.85
SLC43A3-217ENST00000530005 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
SLC43A3-217ENST00000530005 EXOC5O00471 708 aa26.62■■□□□ 1.85
SLC43A3-217ENST00000530005 SBF2Q86WG5 1849 aa26.62■■□□□ 1.85
SLC43A3-217ENST00000530005 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.6■■□□□ 1.85
SLC43A3-217ENST00000530005 POLKQ9UBT6 870 aa26.6■■□□□ 1.85
SLC43A3-217ENST00000530005 NBPF6Q5VWK0 638 aa26.59■■□□□ 1.85
SLC43A3-217ENST00000530005 NBPF4Q96M43 638 aa26.59■■□□□ 1.85
SLC43A3-217ENST00000530005 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
SLC43A3-217ENST00000530005 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
SLC43A3-217ENST00000530005 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
SLC43A3-217ENST00000530005 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.56■■□□□ 1.84
SLC43A3-217ENST00000530005 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
SLC43A3-217ENST00000530005 MEGF6O75095 1541 aa26.55■■□□□ 1.84
SLC43A3-217ENST00000530005 APBA3O96018 575 aa26.55■■□□□ 1.84
SLC43A3-217ENST00000530005 CAMKK2Q96RR4 588 aa26.55■■□□□ 1.84
SLC43A3-217ENST00000530005 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
SLC43A3-217ENST00000530005 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
SLC43A3-217ENST00000530005 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.54■■□□□ 1.84
SLC43A3-217ENST00000530005 NCAPD2Q15021 1401 aa26.53■■□□□ 1.84
SLC43A3-217ENST00000530005 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
SLC43A3-217ENST00000530005 USHBP1Q8N6Y0 703 aa26.52■■□□□ 1.84
SLC43A3-217ENST00000530005 SHANK3Q9BYB0 1731 aa26.51■■□□□ 1.83
SLC43A3-217ENST00000530005 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
SLC43A3-217ENST00000530005 PARD3Q8TEW0 1356 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC43A3-217ENST00000530005 MORC1Q86VD1 984 aa26.49■■□□□ 1.83
SLC43A3-217ENST00000530005 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa26.48■■□□□ 1.83
SLC43A3-217ENST00000530005 RREB1Q92766 1687 aa26.48■■□□□ 1.83
SLC43A3-217ENST00000530005 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
SLC43A3-217ENST00000530005 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.46■■□□□ 1.83
SLC43A3-217ENST00000530005 NHSQ6T4R5 1651 aa26.46■■□□□ 1.83
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