RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529295.5

MCAM-211, Transcript of melanoma cell adhesion molecule, humanhuman

TSL 4

Gene MCAM, Length 757 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAM-211ENST00000529295 CD163L1Q9NR16 1453 aa27■■□□□ 1.91
MCAM-211ENST00000529295 USP31Q70CQ4 1352 aa26.99■■□□□ 1.91
MCAM-211ENST00000529295 APBA3O96018 575 aa26.99■■□□□ 1.91
MCAM-211ENST00000529295 NFAT5O94916 1531 aa26.99■■□□□ 1.91
MCAM-211ENST00000529295 SLC24A1O60721 1099 aa26.98■■□□□ 1.91
MCAM-211ENST00000529295 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.98■■□□□ 1.91
MCAM-211ENST00000529295 CAMKK2Q96RR4 588 aa26.98■■□□□ 1.91
MCAM-211ENST00000529295 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
MCAM-211ENST00000529295 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
MCAM-211ENST00000529295 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.97■■□□□ 1.91
MCAM-211ENST00000529295 TERF2IPQ9NYB0 399 aa26.97■■□□□ 1.91
MCAM-211ENST00000529295 ABCC6O95255 1503 aa26.96■■□□□ 1.91
MCAM-211ENST00000529295 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
MCAM-211ENST00000529295 DDB1Q16531 1140 aa26.95■■□□□ 1.9
MCAM-211ENST00000529295 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
MCAM-211ENST00000529295 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa26.94■■□□□ 1.9
MCAM-211ENST00000529295 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa26.94■■□□□ 1.9
MCAM-211ENST00000529295 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.94■■□□□ 1.9
MCAM-211ENST00000529295 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.94■■□□□ 1.9
MCAM-211ENST00000529295 NME9Q86XW9 330 aa26.94■■□□□ 1.9
MCAM-211ENST00000529295 TESK2Q96S53 571 aa26.94■■□□□ 1.9
MCAM-211ENST00000529295 CARD10Q9BWT7 1032 aa26.94■■□□□ 1.9
MCAM-211ENST00000529295 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.94■■□□□ 1.9
MCAM-211ENST00000529295 USP54Q70EL1 1684 aa26.92■■□□□ 1.9
MCAM-211ENST00000529295 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.92■■□□□ 1.9
MCAM-211ENST00000529295 A0A1W2PP64 1363 aa26.91■■□□□ 1.9
MCAM-211ENST00000529295 LRRC37A3O60309 1634 aa26.9■■□□□ 1.9
MCAM-211ENST00000529295 LRP5O75197 1615 aa26.9■■□□□ 1.9
MCAM-211ENST00000529295 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
MCAM-211ENST00000529295 CCDC7Q96M83 1385 aa26.89■■□□□ 1.9
MCAM-211ENST00000529295 PEAK1Q9H792 1746 aa26.87■■□□□ 1.89
MCAM-211ENST00000529295 BCL9O00512 1426 aa26.85■■□□□ 1.89
MCAM-211ENST00000529295 RGPD5Q99666 1765 aa26.85■■□□□ 1.89
MCAM-211ENST00000529295 WNK3Q9BYP7 1800 aa26.85■■□□□ 1.89
MCAM-211ENST00000529295 ERBB3P21860 1342 aa26.85■■□□□ 1.89
MCAM-211ENST00000529295 NBPF14Q5TI25 921 aa26.83■■□□□ 1.89
MCAM-211ENST00000529295 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
MCAM-211ENST00000529295 RREB1Q92766 1687 aa26.82■■□□□ 1.88
MCAM-211ENST00000529295 EXOC5O00471 708 aa26.82■■□□□ 1.88
MCAM-211ENST00000529295 USP47Q96K76 1375 aa26.82■■□□□ 1.88
MCAM-211ENST00000529295 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
MCAM-211ENST00000529295 PLSCR1O15162 318 aa26.79■■□□□ 1.88
MCAM-211ENST00000529295 TMF1P82094 1093 aa26.79■■□□□ 1.88
MCAM-211ENST00000529295 NLRP2Q9NX02 1062 aa26.79■■□□□ 1.88
MCAM-211ENST00000529295 ANKRD24Q8TF21 1146 aa26.78■■□□□ 1.88
MCAM-211ENST00000529295 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.78■■□□□ 1.88
MCAM-211ENST00000529295 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa26.78■■□□□ 1.88
MCAM-211ENST00000529295 TNS2Q63HR2 1409 aa26.78■■□□□ 1.88
MCAM-211ENST00000529295 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.78■■□□□ 1.88
MCAM-211ENST00000529295 LTN1O94822 1766 aa26.76■■□□□ 1.88
MCAM-211ENST00000529295 COG3Q96JB2 828 aa26.76■■□□□ 1.87
MCAM-211ENST00000529295 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.75■■□□□ 1.87
MCAM-211ENST00000529295 SBF2Q86WG5 1849 aa26.75■■□□□ 1.87
MCAM-211ENST00000529295 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
MCAM-211ENST00000529295 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.75■■□□□ 1.87
MCAM-211ENST00000529295 CDCA8Q53HL2 280 aa26.74■■□□□ 1.87
MCAM-211ENST00000529295 IP6K1Q92551 441 aa26.74■■□□□ 1.87
MCAM-211ENST00000529295 IL2RBP14784 551 aa26.73■■□□□ 1.87
MCAM-211ENST00000529295 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.72■■□□□ 1.87
MCAM-211ENST00000529295 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.69■■□□□ 1.86
MCAM-211ENST00000529295 AMPHP49418 695 aa26.66■■□□□ 1.86
MCAM-211ENST00000529295 FYB1O15117 783 aa26.65■■□□□ 1.86
MCAM-211ENST00000529295 HOXC9P31274 260 aa26.65■■□□□ 1.86
MCAM-211ENST00000529295 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.65■■□□□ 1.86
MCAM-211ENST00000529295 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
MCAM-211ENST00000529295 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
MCAM-211ENST00000529295 RTL1A6NKG5 1358 aa26.63■■□□□ 1.85
MCAM-211ENST00000529295 PROM2Q8N271 834 aa26.63■■□□□ 1.85
MCAM-211ENST00000529295 KCNQ2O43526 872 aa26.62■■□□□ 1.85
MCAM-211ENST00000529295 GGNBP2Q9H3C7 697 aa26.62■■□□□ 1.85
MCAM-211ENST00000529295 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
MCAM-211ENST00000529295 TXNRD1Q16881 649 aa26.61■■□□□ 1.85
MCAM-211ENST00000529295 SPON1Q9HCB6 807 aa26.61■■□□□ 1.85
MCAM-211ENST00000529295 NHSQ6T4R5 1651 aa26.6■■□□□ 1.85
MCAM-211ENST00000529295 FBLN1P23142 703 aa26.6■■□□□ 1.85
MCAM-211ENST00000529295 ACSBG1Q96GR2 724 aa26.59■■□□□ 1.85
MCAM-211ENST00000529295 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
MCAM-211ENST00000529295 STK32BQ9NY57 414 aa26.55■■□□□ 1.84
MCAM-211ENST00000529295 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
MCAM-211ENST00000529295 CARD14Q9BXL6 1004 aa26.54■■□□□ 1.84
MCAM-211ENST00000529295 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
MCAM-211ENST00000529295 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.53■■□□□ 1.84
MCAM-211ENST00000529295 NSD3Q9BZ95 1437 aa26.52■■□□□ 1.84
MCAM-211ENST00000529295 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
MCAM-211ENST00000529295 MYOM1P52179 1685 aa26.51■■□□□ 1.83
MCAM-211ENST00000529295 INSRP06213 1382 aa26.51■■□□□ 1.83
MCAM-211ENST00000529295 SLC15A2Q16348 729 aa26.51■■□□□ 1.83
MCAM-211ENST00000529295 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.5■■□□□ 1.83
MCAM-211ENST00000529295 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
MCAM-211ENST00000529295 KIF20BQ96Q89 1820 aa26.5■■□□□ 1.83
MCAM-211ENST00000529295 FLT4P35916 1363 aa26.49■■□□□ 1.83
MCAM-211ENST00000529295 CASZ1Q86V15 1759 aa26.49■■□□□ 1.83
MCAM-211ENST00000529295 NBPF6Q5VWK0 638 aa26.49■■□□□ 1.83
MCAM-211ENST00000529295 NBPF4Q96M43 638 aa26.49■■□□□ 1.83
MCAM-211ENST00000529295 MEGF6O75095 1541 aa26.48■■□□□ 1.83
MCAM-211ENST00000529295 BTAF1O14981 1849 aa26.47■■□□□ 1.83
MCAM-211ENST00000529295 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa26.46■■□□□ 1.83
MCAM-211ENST00000529295 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa26.46■■□□□ 1.83
MCAM-211ENST00000529295 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
MCAM-211ENST00000529295 SLC27A3Q5K4L6 730 aa26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms