RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528987.1

CD59-211, Transcript of CD59 molecule (CD59 blood group), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD59, Length 3,716 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD59-211ENST00000528987 CHADLQ6NUI6 762 aa7.16□□□□□ -1.26
CD59-211ENST00000528987 PLPP6Q8IY26 295 aa7.16□□□□□ -1.26
CD59-211ENST00000528987 TMC2Q8TDI7 906 aa7.16□□□□□ -1.26
CD59-211ENST00000528987 TBX22Q9Y458 520 aa7.16□□□□□ -1.26
CD59-211ENST00000528987 NUTM1Q86Y26 1132 aa7.15□□□□□ -1.26
CD59-211ENST00000528987 WWC3Q9ULE0 1092 aa7.15□□□□□ -1.26
CD59-211ENST00000528987 CTDSPL2Q05D32 466 aa7.15□□□□□ -1.26
CD59-211ENST00000528987 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CD59-211ENST00000528987 CHD1O14646 1710 aa7.15□□□□□ -1.26
CD59-211ENST00000528987 ARHGEF11O15085 1522 aa7.15□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 USP5P45974 858 aa7.15□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 LONRF3Q496Y0 759 aa7.15□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 TMC1Q8TDI8 760 aa7.15□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 RPS6KC1Q96S38 1066 aa7.15□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 CCDC189A1A4V9 331 aa7.14□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa7.14□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 PPP2R2DQ66LE6 453 aa7.14□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 FBXO33Q7Z6M2 555 aa7.14□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 SYNJ1O43426 1573 aa7.14□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 RASA1P20936 1047 aa7.14□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 MAPK8P45983 427 aa7.14□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 SPIRE2Q8WWL2 714 aa7.14□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 CCDC181Q5TID7 509 aa7.13□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 SKIP12755 728 aa7.13□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 PDE3BQ13370 1112 aa7.13□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 SYNJ2O15056 1496 aa7.13□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 SMC5Q8IY18 1101 aa7.13□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 PRIMPOLQ96LW4 560 aa7.13□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa7.13□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 TINF2Q9BSI4 451 aa7.12□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa7.12□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa7.12□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa7.12□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 MAP3K13O43283 966 aa7.12□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 ATP9BO43861 1147 aa7.12□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa7.12□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 PCDH12Q9NPG4 1184 aa7.12□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 VTI1BQ9UEU0 232 aa7.12□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa7.12□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa7.12□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 USP17L3A6NCW0 530 aa7.11□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 USP17L4A6NCW7 530 aa7.11□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 CCER2I3L3R5 266 aa7.11□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 GPR37L1O60883 481 aa7.11□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 USP17L2Q6R6M4 530 aa7.11□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 USP17L1Q7RTZ2 530 aa7.11□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 TBX4P57082 545 aa7.11□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 RHBDL3P58872 404 aa7.11□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 GAS2L2Q8NHY3 880 aa7.11□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa7.11□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 TOP2BQ02880 1626 aa7.11□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 PLEKHG6Q3KR16 790 aa7.11□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 ODR4Q5SWX8 454 aa7.11□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 EVA1CP58658 441 aa7.1□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 DDX11L8A8MPP1 907 aa7.1□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 C11orf96Q7Z7L8 435 aa7.1□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 NME8Q8N427 588 aa7.1□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 FAM200AQ8TCP9 573 aa7.1□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 OSBPL2Q9H1P3 480 aa7.1□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 CCDC61Q9Y6R9 512 aa7.1□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 JPH4Q96JJ6 628 aa7.09□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 DIXDC1Q155Q3 683 aa7.09□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CD59-211ENST00000528987 USP17L15C9J2P7 530 aa7.09□□□□□ -1.28
CD59-211ENST00000528987 USP17L10C9JJH3 530 aa7.09□□□□□ -1.28
CD59-211ENST00000528987 USP17L13C9JLJ4 530 aa7.09□□□□□ -1.28
CD59-211ENST00000528987 USP17L12C9JPN9 530 aa7.09□□□□□ -1.28
CD59-211ENST00000528987 USP17L11C9JVI0 530 aa7.09□□□□□ -1.28
CD59-211ENST00000528987 USP17L21D6R901 530 aa7.09□□□□□ -1.28
CD59-211ENST00000528987 USP17L18D6R9N7 530 aa7.09□□□□□ -1.28
CD59-211ENST00000528987 USP17L22D6RA61 530 aa7.09□□□□□ -1.28
CD59-211ENST00000528987 USP17L17D6RBQ6 530 aa7.09□□□□□ -1.28
CD59-211ENST00000528987 USP17L19D6RCP7 530 aa7.09□□□□□ -1.28
CD59-211ENST00000528987 USP17L20D6RJB6 530 aa7.09□□□□□ -1.28
CD59-211ENST00000528987 USP17L24Q0WX57 530 aa7.09□□□□□ -1.28
CD59-211ENST00000528987 PPP4R4Q6NUP7 873 aa7.09□□□□□ -1.28
CD59-211ENST00000528987 SEPT3Q9UH03 358 aa7.09□□□□□ -1.28
CD59-211ENST00000528987 KIF27Q86VH2 1401 aa7.08□□□□□ -1.28
CD59-211ENST00000528987 DSG3P32926 999 aa7.08□□□□□ -1.28
CD59-211ENST00000528987 KCNH2Q12809 1159 aa7.08□□□□□ -1.28
CD59-211ENST00000528987 STK10O94804 968 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CD59-211ENST00000528987 VAMP1P23763 118 aa7.08□□□□□ -1.28
CD59-211ENST00000528987 ZNF394Q53GI3 561 aa7.08□□□□□ -1.28
CD59-211ENST00000528987 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 159.9 ms