RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498399.1

TIMMDC1-209, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TIMMDC1, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-209ENST00000498399 NR5A1Q13285 461 aa8.52□□□□□ -1.05
TIMMDC1-209ENST00000498399 KIFC2Q96AC6 838 aa8.52□□□□□ -1.05
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.52□□□□□ -1.05
TIMMDC1-209ENST00000498399 GPSM3Q9Y4H4 160 aa8.52□□□□□ -1.05
TIMMDC1-209ENST00000498399 TIMP2P16035 220 aa8.51□□□□□ -1.05
TIMMDC1-209ENST00000498399 RAB15P59190 212 aa8.51□□□□□ -1.05
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMEM132AQ24JP5 1023 aa8.51□□□□□ -1.05
TIMMDC1-209ENST00000498399 ITPKCQ96DU7 683 aa8.51□□□□□ -1.05
TIMMDC1-209ENST00000498399 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa8.51□□□□□ -1.05
TIMMDC1-209ENST00000498399 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa8.51□□□□□ -1.05
TIMMDC1-209ENST00000498399 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa8.51□□□□□ -1.05
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZBBXA8MT70 800 aa8.5□□□□□ -1.05
TIMMDC1-209ENST00000498399 TERTO14746 1132 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
TIMMDC1-209ENST00000498399 GPR37L1O60883 481 aa8.5□□□□□ -1.05
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
TIMMDC1-209ENST00000498399 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
TIMMDC1-209ENST00000498399 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
TIMMDC1-209ENST00000498399 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
TIMMDC1-209ENST00000498399 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TIMMDC1-209ENST00000498399 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa8.49□□□□□ -1.05
TIMMDC1-209ENST00000498399 APBB1O00213 710 aa8.48□□□□□ -1.05
TIMMDC1-209ENST00000498399 TRIM46Q7Z4K8 759 aa8.48□□□□□ -1.05
TIMMDC1-209ENST00000498399 CCDC116Q8IYX3 515 aa8.48□□□□□ -1.05
TIMMDC1-209ENST00000498399 MCM6Q14566 821 aa8.47□□□□□ -1.05
TIMMDC1-209ENST00000498399 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
TIMMDC1-209ENST00000498399 SOCS7O14512 581 aa8.46□□□□□ -1.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 GDPD2Q9HCC8 539 aa8.46□□□□□ -1.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 ABL2P42684 1182 aa8.45□□□□□ -1.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 NR1H3Q13133 447 aa8.45□□□□□ -1.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 NBPF20Q3BBV1 942 aa8.45□□□□□ -1.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa8.45□□□□□ -1.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 C6orf118Q5T5N4 469 aa8.44□□□□□ -1.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 PRM3Q9NNZ6 103 aa8.44□□□□□ -1.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa8.44□□□□□ -1.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 CBLBQ13191 982 aa8.43□□□□□ -1.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 IRF5Q13568 498 aa8.42□□□□□ -1.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 NPAS3Q8IXF0 933 aa8.42□□□□□ -1.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZFP42Q96MM3 310 aa8.42□□□□□ -1.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 ERVH48-1M5A8F1 160 aa8.41□□□□□ -1.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 SCARF1Q14162 830 aa8.41□□□□□ -1.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.41□□□□□ -1.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 ESPNB1AK53 854 aa8.4□□□□□ -1.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 VAC14Q08AM6 782 aa8.4□□□□□ -1.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 MEIOBQ8N635 442 aa8.4□□□□□ -1.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 BMP2P12643 396 aa8.39□□□□□ -1.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 POM121Q96HA1 1249 aa8.39□□□□□ -1.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 AGBL1Q96MI9 1066 aa8.39□□□□□ -1.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 COG6Q9Y2V7 657 aa8.39□□□□□ -1.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 SOBPA7XYQ1 873 aa8.38□□□□□ -1.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 UPP2O95045 317 aa8.38□□□□□ -1.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.38□□□□□ -1.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 CYLDQ9NQC7 956 aa8.38□□□□□ -1.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa8.38□□□□□ -1.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 UBTFP17480 764 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 RELBQ01201 579 aa8.36□□□□□ -1.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC16A10Q8TF71 515 aa8.36□□□□□ -1.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 H3BM21 787 aa8.35□□□□□ -1.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 ADD1P35611 737 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 FLIIQ13045 1269 aa8.35□□□□□ -1.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 SEPT12Q8IYM1 358 aa8.35□□□□□ -1.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 LILRA1O75019 489 aa8.34□□□□□ -1.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP8.34□□□□□ -1.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 Q6ZVU0 165 aa8.34□□□□□ -1.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 CEP126Q9P2H0 1117 aa8.34□□□□□ -1.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa8.34□□□□□ -1.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 RAD21O60216 631 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 GMPRP36959 345 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 IRF7Q92985 503 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 MAN1A2O60476 641 aa8.32□□□□□ -1.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 RNF20Q5VTR2 975 aa8.32□□□□□ -1.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF592Q92610 1267 aa8.32□□□□□ -1.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 FIGNL2A6NMB9 653 aa8.31□□□□□ -1.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 ADH1AP07327 375 aa8.31□□□□□ -1.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 SCTRP47872 440 aa8.31□□□□□ -1.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 WASHC4Q2M389 1173 aa8.31□□□□□ -1.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 TSGA10IPQ3SY00 556 aa8.31□□□□□ -1.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 CLUAP1Q96AJ1 413 aa8.31□□□□□ -1.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAM181BA6NEQ2 426 aa8.3□□□□□ -1.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 ERBB4Q15303 1308 aa8.29□□□□□ -1.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 TTLL8A6PVC2 850 aa8.29□□□□□ -1.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 SPINT1O43278 529 aa8.29□□□□□ -1.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 VSIG8P0DPA2 414 aa8.29□□□□□ -1.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 VEGFBP49765 207 aa8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms