RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493607.1

SERBP1-208, Transcript of SERPINE1 mRNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene SERBP1, Length 615 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERBP1-208	ENST00000493607	RGPD5	Q99666	1765 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SERBP1-208	ENST00000493607	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SERBP1-208	ENST00000493607	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SERBP1-208	ENST00000493607	NME9	Q86XW9	330 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SERBP1-208	ENST00000493607	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
SERBP1-208	ENST00000493607	LTN1	O94822	1766 aa		32.61	■■■□□ 2.81
SERBP1-208	ENST00000493607	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SERBP1-208	ENST00000493607	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SERBP1-208	ENST00000493607	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		32.59	■■■□□ 2.81
SERBP1-208	ENST00000493607	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		32.58	■■■□□ 2.81
SERBP1-208	ENST00000493607	USP35	Q9P2H5	1018 aa		32.58	■■■□□ 2.81
SERBP1-208	ENST00000493607	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SERBP1-208	ENST00000493607	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SERBP1-208	ENST00000493607	MYOM1	P52179	1685 aa		32.56	■■■□□ 2.8
SERBP1-208	ENST00000493607	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
SERBP1-208	ENST00000493607	SOX12	O15370	315 aa		32.53	■■■□□ 2.8
SERBP1-208	ENST00000493607	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		32.52	■■■□□ 2.8
SERBP1-208	ENST00000493607	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		32.51	■■■□□ 2.79
SERBP1-208	ENST00000493607	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	32.5	■■■□□ 2.79
SERBP1-208	ENST00000493607	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SERBP1-208	ENST00000493607	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
SERBP1-208	ENST00000493607	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
SERBP1-208	ENST00000493607	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	32.48	■■■□□ 2.79
SERBP1-208	ENST00000493607	PDE3B	Q13370	1112 aa		32.48	■■■□□ 2.79
SERBP1-208	ENST00000493607	COG3	Q96JB2	828 aa		32.48	■■■□□ 2.79
SERBP1-208	ENST00000493607	LRRC37A3	O60309	1634 aa		32.48	■■■□□ 2.79
SERBP1-208	ENST00000493607	CCDC7	Q96M83	1385 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SERBP1-208	ENST00000493607	DISP2	A7MBM2	1401 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SERBP1-208	ENST00000493607	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SERBP1-208	ENST00000493607	ERBB3	P21860	1342 aa		32.46	■■■□□ 2.79
SERBP1-208	ENST00000493607	BAG6	P46379	1132 aa		32.44	■■■□□ 2.78
SERBP1-208	ENST00000493607	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
SERBP1-208	ENST00000493607	FYB1	O15117	783 aa		32.43	■■■□□ 2.78
SERBP1-208	ENST00000493607	FAM182B	Q5T319	152 aa		32.43	■■■□□ 2.78
SERBP1-208	ENST00000493607	PEAK1	Q9H792	1746 aa		32.43	■■■□□ 2.78
SERBP1-208	ENST00000493607	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		32.42	■■■□□ 2.78
SERBP1-208	ENST00000493607	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		32.42	■■■□□ 2.78
SERBP1-208	ENST00000493607	IP6K1	Q92551	441 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SERBP1-208	ENST00000493607	DDB1	Q16531	1140 aa		32.39	■■■□□ 2.78
SERBP1-208	ENST00000493607	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
SERBP1-208	ENST00000493607	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SERBP1-208	ENST00000493607	BCL9	O00512	1426 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SERBP1-208	ENST00000493607	SBF2	Q86WG5	1849 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SERBP1-208	ENST00000493607	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SERBP1-208	ENST00000493607	RTL1	A6NKG5	1358 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SERBP1-208	ENST00000493607	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SERBP1-208	ENST00000493607	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SERBP1-208	ENST00000493607	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SERBP1-208	ENST00000493607	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SERBP1-208	ENST00000493607	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		32.32	■■■□□ 2.77
SERBP1-208	ENST00000493607	TRIM37	O94972	964 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SERBP1-208	ENST00000493607	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SERBP1-208	ENST00000493607	HOXC9	P31274	260 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SERBP1-208	ENST00000493607	TNS2	Q63HR2	1409 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SERBP1-208	ENST00000493607	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		32.29	■■■□□ 2.76
SERBP1-208	ENST00000493607	EXOC5	O00471	708 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SERBP1-208	ENST00000493607	AMPH	P49418	695 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SERBP1-208	ENST00000493607	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
SERBP1-208	ENST00000493607	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
SERBP1-208	ENST00000493607	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SERBP1-208	ENST00000493607	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		32.26	■■■□□ 2.75
SERBP1-208	ENST00000493607	IL2RB	P14784	551 aa		32.25	■■■□□ 2.75
SERBP1-208	ENST00000493607	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
SERBP1-208	ENST00000493607	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		32.25	■■■□□ 2.75
SERBP1-208	ENST00000493607	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SERBP1-208	ENST00000493607	RREB1	Q92766	1687 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SERBP1-208	ENST00000493607	APBA3	O96018	575 aa		32.23	■■■□□ 2.75
SERBP1-208	ENST00000493607	FBLN1	P23142	703 aa		32.22	■■■□□ 2.75
SERBP1-208	ENST00000493607	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		32.2	■■■□□ 2.75
SERBP1-208	ENST00000493607	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.75
SERBP1-208	ENST00000493607	INSR	P06213	1382 aa		32.19	■■■□□ 2.74
SERBP1-208	ENST00000493607	FLT4	P35916	1363 aa		32.19	■■■□□ 2.74
SERBP1-208	ENST00000493607	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
SERBP1-208	ENST00000493607	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	32.18	■■■□□ 2.74
SERBP1-208	ENST00000493607	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	32.17	■■■□□ 2.74
SERBP1-208	ENST00000493607	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		32.17	■■■□□ 2.74
SERBP1-208	ENST00000493607	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	32.17	■■■□□ 2.74
SERBP1-208	ENST00000493607	PLSCR1	O15162	318 aa		32.15	■■■□□ 2.74
SERBP1-208	ENST00000493607	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	32.15	■■■□□ 2.74
SERBP1-208	ENST00000493607	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		32.14	■■■□□ 2.74
SERBP1-208	ENST00000493607	NSD2	O96028	1365 aa		32.13	■■■□□ 2.73
SERBP1-208	ENST00000493607	NHS	Q6T4R5	1651 aa		32.13	■■■□□ 2.73
SERBP1-208	ENST00000493607	PANK3	Q9H999	370 aa		32.13	■■■□□ 2.73
SERBP1-208	ENST00000493607	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		32.09	■■■□□ 2.73
SERBP1-208	ENST00000493607	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		32.08	■■■□□ 2.73
SERBP1-208	ENST00000493607	NBPF4	Q96M43	638 aa		32.08	■■■□□ 2.73
SERBP1-208	ENST00000493607	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		32.07	■■■□□ 2.72
SERBP1-208	ENST00000493607	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SERBP1-208	ENST00000493607	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SERBP1-208	ENST00000493607	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		32.05	■■■□□ 2.72
SERBP1-208	ENST00000493607	NCAPD2	Q15021	1401 aa		32.05	■■■□□ 2.72
SERBP1-208	ENST00000493607	MEGF6	O75095	1541 aa		32.05	■■■□□ 2.72
SERBP1-208	ENST00000493607	LRP5	O75197	1615 aa		32.04	■■■□□ 2.72
SERBP1-208	ENST00000493607	POLK	Q9UBT6	870 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SERBP1-208	ENST00000493607	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SERBP1-208	ENST00000493607	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SERBP1-208	ENST00000493607	NBPF14	Q5TI25	921 aa		32	■■■□□ 2.71
SERBP1-208	ENST00000493607	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		31.99	■■■□□ 2.71
SERBP1-208	ENST00000493607	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
SERBP1-208	ENST00000493607	BTAF1	O14981	1849 aa		31.98	■■■□□ 2.71

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