RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492213.5

POLR2F-212, Transcript of RNA polymerase II subunit F, humanhuman

TSL 4

Gene POLR2F, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2F-212ENST00000492213 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa29.52■■■□□ 2.32
POLR2F-212ENST00000492213 BRWD3Q6RI45 1802 aa29.52■■■□□ 2.32
POLR2F-212ENST00000492213 EVA1CP58658 441 aa29.51■■■□□ 2.31
POLR2F-212ENST00000492213 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP29.51■■■□□ 2.31
POLR2F-212ENST00000492213 COG3Q96JB2 828 aa29.49■■■□□ 2.31
POLR2F-212ENST00000492213 POLR3GLQ9BT43 218 aa29.49■■■□□ 2.31
POLR2F-212ENST00000492213 GGNBP2Q9H3C7 697 aa29.48■■■□□ 2.31
POLR2F-212ENST00000492213 KIF20BQ96Q89 1820 aa29.48■■■□□ 2.31
POLR2F-212ENST00000492213 RGPD5Q99666 1765 aa29.47■■■□□ 2.31
POLR2F-212ENST00000492213 LTN1O94822 1766 aa29.47■■■□□ 2.31
POLR2F-212ENST00000492213 CRB1P82279 1406 aa29.45■■■□□ 2.31
POLR2F-212ENST00000492213 KIF7Q2M1P5 1343 aa29.45■■■□□ 2.3
POLR2F-212ENST00000492213 WDR17Q8IZU2 1322 aa29.45■■■□□ 2.3
POLR2F-212ENST00000492213 BARGINQ6ZT62 677 aa29.44■■■□□ 2.3
POLR2F-212ENST00000492213 EP400Q96L91 3159 aa29.43■■■□□ 2.3
POLR2F-212ENST00000492213 FBLN1P23142 703 aa29.43■■■□□ 2.3
POLR2F-212ENST00000492213 TCP11L2Q8N4U5 519 aa29.42■■■□□ 2.3
POLR2F-212ENST00000492213 USP35Q9P2H5 1018 aa29.42■■■□□ 2.3
POLR2F-212ENST00000492213 MAP3K19Q56UN5 1328 aa29.41■■■□□ 2.3
POLR2F-212ENST00000492213 PANK3Q9H999 370 aa29.4■■■□□ 2.3
POLR2F-212ENST00000492213 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
POLR2F-212ENST00000492213 KRT27Q7Z3Y8 459 aa29.39■■■□□ 2.3
POLR2F-212ENST00000492213 ERBB3P21860 1342 aa29.38■■■□□ 2.29
POLR2F-212ENST00000492213 A0A0G2JS52 829 aa29.37■■■□□ 2.29
POLR2F-212ENST00000492213 MYT1Q01538 1121 aa29.37■■■□□ 2.29
POLR2F-212ENST00000492213 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa29.37■■■□□ 2.29
POLR2F-212ENST00000492213 IP6K1Q92551 441 aa29.37■■■□□ 2.29
POLR2F-212ENST00000492213 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
POLR2F-212ENST00000492213 CGNL1Q0VF96 1302 aa29.36■■■□□ 2.29
POLR2F-212ENST00000492213 CARD10Q9BWT7 1032 aa29.35■■■□□ 2.29
POLR2F-212ENST00000492213 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
POLR2F-212ENST00000492213 CCDC7Q96M83 1385 aa29.33■■■□□ 2.29
POLR2F-212ENST00000492213 DISP2A7MBM2 1401 aa29.33■■■□□ 2.29
POLR2F-212ENST00000492213 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
POLR2F-212ENST00000492213 WNK3Q9BYP7 1800 aa29.32■■■□□ 2.28
POLR2F-212ENST00000492213 RTL1A6NKG5 1358 aa29.32■■■□□ 2.28
POLR2F-212ENST00000492213 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa29.32■■■□□ 2.28
POLR2F-212ENST00000492213 HOXC9P31274 260 aa29.32■■■□□ 2.28
POLR2F-212ENST00000492213 ANKRD24Q8TF21 1146 aa29.32■■■□□ 2.28
POLR2F-212ENST00000492213 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.31■■■□□ 2.28
POLR2F-212ENST00000492213 PEAK1Q9H792 1746 aa29.31■■■□□ 2.28
POLR2F-212ENST00000492213 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa29.29■■■□□ 2.28
POLR2F-212ENST00000492213 AMPHP49418 695 aa29.28■■■□□ 2.28
POLR2F-212ENST00000492213 LRRC37A3O60309 1634 aa29.27■■■□□ 2.28
POLR2F-212ENST00000492213 FAM182BQ5T319 152 aa29.27■■■□□ 2.28
POLR2F-212ENST00000492213 NSD2O96028 1365 aa29.25■■■□□ 2.27
POLR2F-212ENST00000492213 KIF24Q5T7B8 1368 aa29.25■■■□□ 2.27
POLR2F-212ENST00000492213 NLRP2Q9NX02 1062 aa29.24■■■□□ 2.27
POLR2F-212ENST00000492213 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa29.24■■■□□ 2.27
POLR2F-212ENST00000492213 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
POLR2F-212ENST00000492213 CCDC125Q86Z20 511 aa29.22■■■□□ 2.27
POLR2F-212ENST00000492213 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
POLR2F-212ENST00000492213 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
POLR2F-212ENST00000492213 FLT4P35916 1363 aa29.22■■■□□ 2.27
POLR2F-212ENST00000492213 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
POLR2F-212ENST00000492213 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
POLR2F-212ENST00000492213 INSRP06213 1382 aa29.21■■■□□ 2.27
POLR2F-212ENST00000492213 PDE3BQ13370 1112 aa29.2■■■□□ 2.26
POLR2F-212ENST00000492213 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa29.2■■■□□ 2.26
POLR2F-212ENST00000492213 POLKQ9UBT6 870 aa29.19■■■□□ 2.26
POLR2F-212ENST00000492213 KNSTRNQ9Y448 316 aa29.19■■■□□ 2.26
POLR2F-212ENST00000492213 RGPD2P0DJD1 1756 aa29.17■■■□□ 2.26
POLR2F-212ENST00000492213 DDB1Q16531 1140 aa29.17■■■□□ 2.26
POLR2F-212ENST00000492213 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
POLR2F-212ENST00000492213 FAM196AQ6ZSG2 479 aa29.16■■■□□ 2.26
POLR2F-212ENST00000492213 TNS2Q63HR2 1409 aa29.15■■■□□ 2.26
POLR2F-212ENST00000492213 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
POLR2F-212ENST00000492213 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
POLR2F-212ENST00000492213 IL2RBP14784 551 aa29.13■■■□□ 2.25
POLR2F-212ENST00000492213 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
POLR2F-212ENST00000492213 NBPF6Q5VWK0 638 aa29.13■■■□□ 2.25
POLR2F-212ENST00000492213 NBPF4Q96M43 638 aa29.13■■■□□ 2.25
POLR2F-212ENST00000492213 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
POLR2F-212ENST00000492213 RGPD1P0DJD0 1748 aa29.12■■■□□ 2.25
POLR2F-212ENST00000492213 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa29.11■■■□□ 2.25
POLR2F-212ENST00000492213 DEFB132Q7Z7B7 95 aa29.11■■■□□ 2.25
POLR2F-212ENST00000492213 MORC1Q86VD1 984 aa29.1■■■□□ 2.25
POLR2F-212ENST00000492213 BCL9O00512 1426 aa29.1■■■□□ 2.25
POLR2F-212ENST00000492213 EXOC5O00471 708 aa29.09■■■□□ 2.25
POLR2F-212ENST00000492213 NCAPD2Q15021 1401 aa29.09■■■□□ 2.25
POLR2F-212ENST00000492213 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
POLR2F-212ENST00000492213 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa29.08■■■□□ 2.25
POLR2F-212ENST00000492213 MEGF6O75095 1541 aa29.08■■■□□ 2.25
POLR2F-212ENST00000492213 TRIM37O94972 964 aa29.07■■■□□ 2.24
POLR2F-212ENST00000492213 USHBP1Q8N6Y0 703 aa29.07■■■□□ 2.24
POLR2F-212ENST00000492213 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
POLR2F-212ENST00000492213 SBF2Q86WG5 1849 aa29.04■■■□□ 2.24
POLR2F-212ENST00000492213 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
POLR2F-212ENST00000492213 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
POLR2F-212ENST00000492213 SHANK3Q9BYB0 1731 aa29■■■□□ 2.23
POLR2F-212ENST00000492213 BAG6P46379 1132 aa29■■■□□ 2.23
POLR2F-212ENST00000492213 EYA1Q99502 592 aa29■■■□□ 2.23
POLR2F-212ENST00000492213 PTF1AQ7RTS3 328 aa28.99■■■□□ 2.23
POLR2F-212ENST00000492213 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
POLR2F-212ENST00000492213 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
POLR2F-212ENST00000492213 CAMKK2Q96RR4 588 aa28.95■■■□□ 2.22
POLR2F-212ENST00000492213 APBA3O96018 575 aa28.94■■■□□ 2.22
POLR2F-212ENST00000492213 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
POLR2F-212ENST00000492213 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa28.93■■■□□ 2.22
POLR2F-212ENST00000492213 IGSF1Q8N6C5 1336 aa28.93■■■□□ 2.22
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