RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
NISCH-211ENST00000488243 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
NISCH-211ENST00000488243 PARD3Q8TEW0 1356 aa15.87■□□□□ 0.13
NISCH-211ENST00000488243 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
NISCH-211ENST00000488243 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
NISCH-211ENST00000488243 MORC1Q86VD1 984 aa15.86■□□□□ 0.13
NISCH-211ENST00000488243 USP54Q70EL1 1684 aa15.86■□□□□ 0.13
NISCH-211ENST00000488243 KIF20BQ96Q89 1820 aa15.85■□□□□ 0.13
NISCH-211ENST00000488243 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa15.85■□□□□ 0.13
NISCH-211ENST00000488243 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa15.85■□□□□ 0.13
NISCH-211ENST00000488243 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa15.85■□□□□ 0.13
NISCH-211ENST00000488243 DISP2A7MBM2 1401 aa15.85■□□□□ 0.13
NISCH-211ENST00000488243 OVOS2Q6IE36 1432 aa15.85■□□□□ 0.13
NISCH-211ENST00000488243 ALS2Q96Q42 1657 aa15.84■□□□□ 0.13
NISCH-211ENST00000488243 NLRP6P59044 892 aa15.84■□□□□ 0.13
NISCH-211ENST00000488243 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
NISCH-211ENST00000488243 NME9Q86XW9 330 aa15.84■□□□□ 0.13
NISCH-211ENST00000488243 GGNBP2Q9H3C7 697 aa15.84■□□□□ 0.13
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NISCH-211ENST00000488243 PRDM11Q9NQV5 511 aa15.83■□□□□ 0.12
NISCH-211ENST00000488243 AATKQ6ZMQ8 1374 aa15.83■□□□□ 0.12
NISCH-211ENST00000488243 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
NISCH-211ENST00000488243 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
NISCH-211ENST00000488243 PIK3C2AO00443 1686 aa15.82■□□□□ 0.12
NISCH-211ENST00000488243 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa15.82■□□□□ 0.12
NISCH-211ENST00000488243 USP19O94966 1318 aa15.81■□□□□ 0.12
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NISCH-211ENST00000488243 CAMKK2Q96RR4 588 aa15.81■□□□□ 0.12
NISCH-211ENST00000488243 STRN4Q9NRL3 753 aa15.8■□□□□ 0.12
NISCH-211ENST00000488243 KIF24Q5T7B8 1368 aa15.79■□□□□ 0.12
NISCH-211ENST00000488243 CCER2I3L3R5 266 aa15.79■□□□□ 0.12
NISCH-211ENST00000488243 CHRNA2Q15822 529 aa15.79■□□□□ 0.12
NISCH-211ENST00000488243 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa15.79■□□□□ 0.12
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NISCH-211ENST00000488243 APBA3O96018 575 aa15.78■□□□□ 0.12
NISCH-211ENST00000488243 USP35Q9P2H5 1018 aa15.78■□□□□ 0.12
NISCH-211ENST00000488243 KIAA0232Q92628 1395 aa15.77■□□□□ 0.12
NISCH-211ENST00000488243 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa15.77■□□□□ 0.12
NISCH-211ENST00000488243 FAM196AQ6ZSG2 479 aa15.77■□□□□ 0.12
NISCH-211ENST00000488243 DCAF8L1A6NGE4 600 aa15.76■□□□□ 0.11
NISCH-211ENST00000488243 GCP02774 474 aa15.76■□□□□ 0.11
NISCH-211ENST00000488243 PPP2R1AP30153 589 aa15.76■□□□□ 0.11
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NISCH-211ENST00000488243 INSRP06213 1382 aa15.74■□□□□ 0.11
NISCH-211ENST00000488243 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
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NISCH-211ENST00000488243 RREB1Q92766 1687 aa15.71■□□□□ 0.11
NISCH-211ENST00000488243 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
NISCH-211ENST00000488243 MTHFSP49914 203 aa15.71■□□□□ 0.11
NISCH-211ENST00000488243 ARHGEF25Q86VW2 580 aa15.71■□□□□ 0.11
NISCH-211ENST00000488243 KCNQ2O43526 872 aa15.7■□□□□ 0.1
NISCH-211ENST00000488243 NUP188Q5SRE5 1749 aa15.7■□□□□ 0.1
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NISCH-211ENST00000488243 IP6K1Q92551 441 aa15.68■□□□□ 0.1
NISCH-211ENST00000488243 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa15.67■□□□□ 0.1
NISCH-211ENST00000488243 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
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NISCH-211ENST00000488243 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
NISCH-211ENST00000488243 MRS2Q9HD23 443 aa15.66■□□□□ 0.1
NISCH-211ENST00000488243 NUDCQ9Y266 331 aa15.66■□□□□ 0.1
NISCH-211ENST00000488243 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa15.66■□□□□ 0.1
NISCH-211ENST00000488243 SOX12O15370 315 aa15.65■□□□□ 0.1
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NISCH-211ENST00000488243 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
NISCH-211ENST00000488243 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa15.64■□□□□ 0.09
NISCH-211ENST00000488243 ZBTB7CA1YPR0 619 aa15.64■□□□□ 0.09
NISCH-211ENST00000488243 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
NISCH-211ENST00000488243 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
NISCH-211ENST00000488243 UTRNP46939 3433 aa15.64■□□□□ 0.09
NISCH-211ENST00000488243 IFFO2Q5TF58 517 aa15.63■□□□□ 0.09
NISCH-211ENST00000488243 FBLN1P23142 703 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-211ENST00000488243 LMO7Q8WWI1 1683 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-211ENST00000488243 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
NISCH-211ENST00000488243 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP15.61■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 54.5
NISCH-211ENST00000488243 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
NISCH-211ENST00000488243 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
NISCH-211ENST00000488243 LTN1O94822 1766 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-211ENST00000488243 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
NISCH-211ENST00000488243 PEAK1Q9H792 1746 aa15.6■□□□□ 0.09
NISCH-211ENST00000488243 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
NISCH-211ENST00000488243 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
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