RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485765.5

NISCH-209, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-209ENST00000485765 COG3Q96JB2 828 aa26.44■■□□□ 1.82
NISCH-209ENST00000485765 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
NISCH-209ENST00000485765 MYOM1P52179 1685 aa26.44■■□□□ 1.82
NISCH-209ENST00000485765 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.43■■□□□ 1.82
NISCH-209ENST00000485765 BRWD3Q6RI45 1802 aa26.42■■□□□ 1.82
NISCH-209ENST00000485765 CRB1P82279 1406 aa26.42■■□□□ 1.82
NISCH-209ENST00000485765 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
NISCH-209ENST00000485765 ABCC6O95255 1503 aa26.42■■□□□ 1.82
NISCH-209ENST00000485765 EP400Q96L91 3159 aa26.42■■□□□ 1.82
NISCH-209ENST00000485765 USP35Q9P2H5 1018 aa26.41■■□□□ 1.82
NISCH-209ENST00000485765 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.41■■□□□ 1.82
NISCH-209ENST00000485765 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.4■■□□□ 1.82
NISCH-209ENST00000485765 A0A0G2JS52 829 aa26.39■■□□□ 1.82
NISCH-209ENST00000485765 MYT1Q01538 1121 aa26.39■■□□□ 1.82
NISCH-209ENST00000485765 CCDC125Q86Z20 511 aa26.39■■□□□ 1.82
NISCH-209ENST00000485765 GGNBP2Q9H3C7 697 aa26.38■■□□□ 1.81
NISCH-209ENST00000485765 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.37■■□□□ 1.81
NISCH-209ENST00000485765 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.36■■□□□ 1.81
NISCH-209ENST00000485765 NSD3Q9BZ95 1437 aa26.36■■□□□ 1.81
NISCH-209ENST00000485765 IP6K1Q92551 441 aa26.35■■□□□ 1.81
NISCH-209ENST00000485765 CARD10Q9BWT7 1032 aa26.35■■□□□ 1.81
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NISCH-209ENST00000485765 RGPD5Q99666 1765 aa26.33■■□□□ 1.81
NISCH-209ENST00000485765 ERBB3P21860 1342 aa26.32■■□□□ 1.8
NISCH-209ENST00000485765 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.32■■□□□ 1.8
NISCH-209ENST00000485765 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.31■■□□□ 1.8
NISCH-209ENST00000485765 LTN1O94822 1766 aa26.3■■□□□ 1.8
NISCH-209ENST00000485765 PANK3Q9H999 370 aa26.3■■□□□ 1.8
NISCH-209ENST00000485765 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
NISCH-209ENST00000485765 ANKRD24Q8TF21 1146 aa26.29■■□□□ 1.8
NISCH-209ENST00000485765 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.29■■□□□ 1.8
NISCH-209ENST00000485765 HOXC9P31274 260 aa26.28■■□□□ 1.8
NISCH-209ENST00000485765 FAM182BQ5T319 152 aa26.28■■□□□ 1.8
NISCH-209ENST00000485765 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
NISCH-209ENST00000485765 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.28■■□□□ 1.8
NISCH-209ENST00000485765 PDE3BQ13370 1112 aa26.27■■□□□ 1.8
NISCH-209ENST00000485765 CCDC7Q96M83 1385 aa26.27■■□□□ 1.8
NISCH-209ENST00000485765 AMPHP49418 695 aa26.26■■□□□ 1.79
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NISCH-209ENST00000485765 KIF20BQ96Q89 1820 aa26.25■■□□□ 1.79
NISCH-209ENST00000485765 FAM196AQ6ZSG2 479 aa26.25■■□□□ 1.79
NISCH-209ENST00000485765 DISP2A7MBM2 1401 aa26.24■■□□□ 1.79
NISCH-209ENST00000485765 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
NISCH-209ENST00000485765 RTL1A6NKG5 1358 aa26.23■■□□□ 1.79
NISCH-209ENST00000485765 NLRP2Q9NX02 1062 aa26.23■■□□□ 1.79
NISCH-209ENST00000485765 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.21■■□□□ 1.79
NISCH-209ENST00000485765 DDB1Q16531 1140 aa26.21■■□□□ 1.79
NISCH-209ENST00000485765 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
NISCH-209ENST00000485765 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
NISCH-209ENST00000485765 EXOC5O00471 708 aa26.17■■□□□ 1.78
NISCH-209ENST00000485765 INSRP06213 1382 aa26.17■■□□□ 1.78
NISCH-209ENST00000485765 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa26.16■■□□□ 1.78
NISCH-209ENST00000485765 DEFB132Q7Z7B7 95 aa26.16■■□□□ 1.78
NISCH-209ENST00000485765 LRRC37A3O60309 1634 aa26.15■■□□□ 1.78
NISCH-209ENST00000485765 IL2RBP14784 551 aa26.15■■□□□ 1.78
NISCH-209ENST00000485765 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
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NISCH-209ENST00000485765 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26.15■■□□□ 1.78
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NISCH-209ENST00000485765 FLT4P35916 1363 aa26.15■■□□□ 1.78
NISCH-209ENST00000485765 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.14■■□□□ 1.78
NISCH-209ENST00000485765 POLKQ9UBT6 870 aa26.14■■□□□ 1.78
NISCH-209ENST00000485765 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
NISCH-209ENST00000485765 TRIM37O94972 964 aa26.13■■□□□ 1.77
NISCH-209ENST00000485765 PEAK1Q9H792 1746 aa26.12■■□□□ 1.77
NISCH-209ENST00000485765 BCL9O00512 1426 aa26.12■■□□□ 1.77
NISCH-209ENST00000485765 BAG6P46379 1132 aa26.11■■□□□ 1.77
NISCH-209ENST00000485765 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
NISCH-209ENST00000485765 NBPF6Q5VWK0 638 aa26.11■■□□□ 1.77
NISCH-209ENST00000485765 NBPF4Q96M43 638 aa26.11■■□□□ 1.77
NISCH-209ENST00000485765 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
NISCH-209ENST00000485765 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa26.11■■□□□ 1.77
NISCH-209ENST00000485765 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.09■■□□□ 1.77
NISCH-209ENST00000485765 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa26.09■■□□□ 1.77
NISCH-209ENST00000485765 TNS2Q63HR2 1409 aa26.08■■□□□ 1.77
NISCH-209ENST00000485765 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
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NISCH-209ENST00000485765 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
NISCH-209ENST00000485765 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
NISCH-209ENST00000485765 MORC1Q86VD1 984 aa26.06■■□□□ 1.76
NISCH-209ENST00000485765 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
NISCH-209ENST00000485765 APBA3O96018 575 aa26.05■■□□□ 1.76
NISCH-209ENST00000485765 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
NISCH-209ENST00000485765 CAMKK2Q96RR4 588 aa26.04■■□□□ 1.76
NISCH-209ENST00000485765 RGPD2P0DJD1 1756 aa26.02■■□□□ 1.76
NISCH-209ENST00000485765 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
NISCH-209ENST00000485765 USHBP1Q8N6Y0 703 aa26.01■■□□□ 1.75
NISCH-209ENST00000485765 NCAPD2Q15021 1401 aa25.99■■□□□ 1.75
NISCH-209ENST00000485765 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.99■■□□□ 1.75
NISCH-209ENST00000485765 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
NISCH-209ENST00000485765 PTF1AQ7RTS3 328 aa25.99■■□□□ 1.75
NISCH-209ENST00000485765 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
NISCH-209ENST00000485765 MEGF6O75095 1541 aa25.98■■□□□ 1.75
NISCH-209ENST00000485765 SBF2Q86WG5 1849 aa25.98■■□□□ 1.75
NISCH-209ENST00000485765 EYA1Q99502 592 aa25.98■■□□□ 1.75
NISCH-209ENST00000485765 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.97■■□□□ 1.75
NISCH-209ENST00000485765 PLSCR1O15162 318 aa25.97■■□□□ 1.75
NISCH-209ENST00000485765 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
NISCH-209ENST00000485765 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.97■■□□□ 1.75
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