RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 RGPD5Q99666 1765 aa28.47■■■□□ 2.15
ACTB-212ENST00000484841 WDR17Q8IZU2 1322 aa28.46■■■□□ 2.15
ACTB-212ENST00000484841 DDB1Q16531 1140 aa28.45■■■□□ 2.14
ACTB-212ENST00000484841 PARD3Q8TEW0 1356 aa28.45■■■□□ 2.14
ACTB-212ENST00000484841 TERF2IPQ9NYB0 399 aa28.44■■■□□ 2.14
ACTB-212ENST00000484841 AXIN2Q9Y2T1 843 aa28.44■■■□□ 2.14
ACTB-212ENST00000484841 SLC24A1O60721 1099 aa28.43■■■□□ 2.14
ACTB-212ENST00000484841 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
ACTB-212ENST00000484841 CAMKK2Q96RR4 588 aa28.42■■■□□ 2.14
ACTB-212ENST00000484841 LRP5O75197 1615 aa28.41■■■□□ 2.14
ACTB-212ENST00000484841 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
ACTB-212ENST00000484841 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa28.41■■■□□ 2.14
ACTB-212ENST00000484841 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa28.41■■■□□ 2.14
ACTB-212ENST00000484841 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa28.41■■■□□ 2.14
ACTB-212ENST00000484841 OVOS2Q6IE36 1432 aa28.41■■■□□ 2.14
ACTB-212ENST00000484841 WNK3Q9BYP7 1800 aa28.41■■■□□ 2.14
ACTB-212ENST00000484841 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
ACTB-212ENST00000484841 LRRC37A3O60309 1634 aa28.4■■■□□ 2.14
ACTB-212ENST00000484841 NFAT5O94916 1531 aa28.38■■■□□ 2.13
ACTB-212ENST00000484841 NME9Q86XW9 330 aa28.38■■■□□ 2.13
ACTB-212ENST00000484841 USP31Q70CQ4 1352 aa28.37■■■□□ 2.13
ACTB-212ENST00000484841 NBPF14Q5TI25 921 aa28.37■■■□□ 2.13
ACTB-212ENST00000484841 CARD10Q9BWT7 1032 aa28.37■■■□□ 2.13
ACTB-212ENST00000484841 ABCC6O95255 1503 aa28.37■■■□□ 2.13
ACTB-212ENST00000484841 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
ACTB-212ENST00000484841 CD163L1Q9NR16 1453 aa28.36■■■□□ 2.13
ACTB-212ENST00000484841 LTN1O94822 1766 aa28.35■■■□□ 2.13
ACTB-212ENST00000484841 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa28.35■■■□□ 2.13
ACTB-212ENST00000484841 USP54Q70EL1 1684 aa28.35■■■□□ 2.13
ACTB-212ENST00000484841 CCDC7Q96M83 1385 aa28.34■■■□□ 2.13
ACTB-212ENST00000484841 RREB1Q92766 1687 aa28.33■■■□□ 2.13
ACTB-212ENST00000484841 NINLQ9Y2I6 1382 aa28.33■■■□□ 2.13
ACTB-212ENST00000484841 SBF2Q86WG5 1849 aa28.32■■■□□ 2.12
ACTB-212ENST00000484841 EXOC5O00471 708 aa28.32■■■□□ 2.12
ACTB-212ENST00000484841 A0A1W2PP64 1363 aa28.32■■■□□ 2.12
ACTB-212ENST00000484841 PEAK1Q9H792 1746 aa28.32■■■□□ 2.12
ACTB-212ENST00000484841 NUP188Q5SRE5 1749 aa28.3■■■□□ 2.12
ACTB-212ENST00000484841 NLRP2Q9NX02 1062 aa28.29■■■□□ 2.12
ACTB-212ENST00000484841 TESK2Q96S53 571 aa28.28■■■□□ 2.12
ACTB-212ENST00000484841 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
ACTB-212ENST00000484841 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
ACTB-212ENST00000484841 TMF1P82094 1093 aa28.25■■■□□ 2.11
ACTB-212ENST00000484841 ERBB3P21860 1342 aa28.24■■■□□ 2.11
ACTB-212ENST00000484841 PLSCR1O15162 318 aa28.24■■■□□ 2.11
ACTB-212ENST00000484841 COG3Q96JB2 828 aa28.24■■■□□ 2.11
ACTB-212ENST00000484841 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
ACTB-212ENST00000484841 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa28.24■■■□□ 2.11
ACTB-212ENST00000484841 ANKRD24Q8TF21 1146 aa28.23■■■□□ 2.11
ACTB-212ENST00000484841 IL2RBP14784 551 aa28.21■■■□□ 2.11
ACTB-212ENST00000484841 USP47Q96K76 1375 aa28.21■■■□□ 2.11
ACTB-212ENST00000484841 BCL9O00512 1426 aa28.2■■■□□ 2.11
ACTB-212ENST00000484841 TNS2Q63HR2 1409 aa28.19■■■□□ 2.1
ACTB-212ENST00000484841 CDCA8Q53HL2 280 aa28.19■■■□□ 2.1
ACTB-212ENST00000484841 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa28.18■■■□□ 2.1
ACTB-212ENST00000484841 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa28.17■■■□□ 2.1
ACTB-212ENST00000484841 IP6K1Q92551 441 aa28.17■■■□□ 2.1
ACTB-212ENST00000484841 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
ACTB-212ENST00000484841 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
ACTB-212ENST00000484841 AMPHP49418 695 aa28.15■■■□□ 2.1
ACTB-212ENST00000484841 PTF1AQ7RTS3 328 aa28.14■■■□□ 2.1
ACTB-212ENST00000484841 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.14■■■□□ 2.1
ACTB-212ENST00000484841 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.14■■■□□ 2.1
ACTB-212ENST00000484841 SPON1Q9HCB6 807 aa28.11■■■□□ 2.09
ACTB-212ENST00000484841 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
ACTB-212ENST00000484841 KAT6BQ8WYB5 2073 aa28.11■■■□□ 2.09
ACTB-212ENST00000484841 ACSBG1Q96GR2 724 aa28.1■■■□□ 2.09
ACTB-212ENST00000484841 MAP3K19Q56UN5 1328 aa28.09■■■□□ 2.09
ACTB-212ENST00000484841 NHSQ6T4R5 1651 aa28.09■■■□□ 2.09
ACTB-212ENST00000484841 HOXC9P31274 260 aa28.08■■■□□ 2.09
ACTB-212ENST00000484841 TXNRD1Q16881 649 aa28.08■■■□□ 2.09
ACTB-212ENST00000484841 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.08■■■□□ 2.09
ACTB-212ENST00000484841 KCNQ2O43526 872 aa28.07■■■□□ 2.08
ACTB-212ENST00000484841 STK32BQ9NY57 414 aa28.07■■■□□ 2.08
ACTB-212ENST00000484841 GGNBP2Q9H3C7 697 aa28.06■■■□□ 2.08
ACTB-212ENST00000484841 KIF20BQ96Q89 1820 aa28.05■■■□□ 2.08
ACTB-212ENST00000484841 FYB1O15117 783 aa28.04■■■□□ 2.08
ACTB-212ENST00000484841 PROM2Q8N271 834 aa28.04■■■□□ 2.08
ACTB-212ENST00000484841 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
ACTB-212ENST00000484841 FBLN1P23142 703 aa28.03■■■□□ 2.08
ACTB-212ENST00000484841 RTL1A6NKG5 1358 aa28.02■■■□□ 2.08
ACTB-212ENST00000484841 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
ACTB-212ENST00000484841 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.08
ACTB-212ENST00000484841 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
ACTB-212ENST00000484841 RGPD2P0DJD1 1756 aa28.01■■■□□ 2.07
ACTB-212ENST00000484841 BTAF1O14981 1849 aa28■■■□□ 2.07
ACTB-212ENST00000484841 DCAF8L1A6NGE4 600 aa27.98■■■□□ 2.07
ACTB-212ENST00000484841 SLC15A2Q16348 729 aa27.98■■■□□ 2.07
ACTB-212ENST00000484841 CASZ1Q86V15 1759 aa27.96■■■□□ 2.07
ACTB-212ENST00000484841 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
ACTB-212ENST00000484841 POLR3GLQ9BT43 218 aa27.95■■■□□ 2.06
ACTB-212ENST00000484841 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
ACTB-212ENST00000484841 ZBTB7AO95365 584 aa27.93■■■□□ 2.06
ACTB-212ENST00000484841 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa27.93■■■□□ 2.06
ACTB-212ENST00000484841 MYOM1P52179 1685 aa27.93■■■□□ 2.06
ACTB-212ENST00000484841 NSD3Q9BZ95 1437 aa27.92■■■□□ 2.06
ACTB-212ENST00000484841 NBPF6Q5VWK0 638 aa27.91■■■□□ 2.06
ACTB-212ENST00000484841 NBPF4Q96M43 638 aa27.91■■■□□ 2.06
ACTB-212ENST00000484841 CGNL1Q0VF96 1302 aa27.91■■■□□ 2.06
ACTB-212ENST00000484841 FLT4P35916 1363 aa27.9■■■□□ 2.06
ACTB-212ENST00000484841 KIF24Q5T7B8 1368 aa27.9■■■□□ 2.06
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