RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472800.1

AUP1-207, Transcript of AUP1, lipid droplet regulating VLDL assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene AUP1, Length 663 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1-207ENST00000472800 EP400Q96L91 3159 aa26.77■■□□□ 1.88
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AUP1-207ENST00000472800 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.75■■□□□ 1.87
AUP1-207ENST00000472800 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.75■■□□□ 1.87
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AUP1-207ENST00000472800 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa26.74■■□□□ 1.87
AUP1-207ENST00000472800 FBLN1P23142 703 aa26.74■■□□□ 1.87
AUP1-207ENST00000472800 AMPHP49418 695 aa26.74■■□□□ 1.87
AUP1-207ENST00000472800 IP6K1Q92551 441 aa26.74■■□□□ 1.87
AUP1-207ENST00000472800 ABCC6O95255 1503 aa26.74■■□□□ 1.87
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AUP1-207ENST00000472800 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.71■■□□□ 1.87
AUP1-207ENST00000472800 RTL1A6NKG5 1358 aa26.71■■□□□ 1.87
AUP1-207ENST00000472800 SEPT12Q8IYM1 358 aa26.7■■□□□ 1.86
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AUP1-207ENST00000472800 COL18A1P39060 1754 aa26.69■■□□□ 1.86
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AUP1-207ENST00000472800 PLCH1Q4KWH8 1693 aa26.68■■□□□ 1.86
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AUP1-207ENST00000472800 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
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AUP1-207ENST00000472800 BRWD3Q6RI45 1802 aa26.63■■□□□ 1.85
AUP1-207ENST00000472800 INSRP06213 1382 aa26.63■■□□□ 1.85
AUP1-207ENST00000472800 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
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AUP1-207ENST00000472800 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.63■■□□□ 1.85
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AUP1-207ENST00000472800 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
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AUP1-207ENST00000472800 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.61■■□□□ 1.85
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AUP1-207ENST00000472800 IGSF1Q8N6C5 1336 aa26.39■■□□□ 1.82
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AUP1-207ENST00000472800 USHBP1Q8N6Y0 703 aa26.36■■□□□ 1.81
AUP1-207ENST00000472800 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
AUP1-207ENST00000472800 DDB1Q16531 1140 aa26.34■■□□□ 1.81
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AUP1-207ENST00000472800 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa26.33■■□□□ 1.81
AUP1-207ENST00000472800 RGPD2P0DJD1 1756 aa26.33■■□□□ 1.81
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