RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466037.6

HOXB-AS3-204, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 522 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OVOS2Q6IE36 1432 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXB-AS3-204ENST00000466037 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CRB1P82279 1406 aa27.39■■□□□ 1.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 USP54Q70EL1 1684 aa27.39■■□□□ 1.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BARGINQ6ZT62 677 aa27.38■■□□□ 1.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AXIN2Q9Y2T1 843 aa27.38■■□□□ 1.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCDC125Q86Z20 511 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 WDR17Q8IZU2 1322 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ABCC6O95255 1503 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BRWD3Q6RI45 1802 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FYB1O15117 783 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GGNBP2Q9H3C7 697 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NSD3Q9BZ95 1437 aa27.33■■□□□ 1.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 COL18A1P39060 1754 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PDE3BQ13370 1112 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MYOM1P52179 1685 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CARD14Q9BXL6 1004 aa27.3■■□□□ 1.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CGNL1Q0VF96 1302 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AMPHP49418 695 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CARD10Q9BWT7 1032 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LTN1O94822 1766 aa27.27■■□□□ 1.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ERBB3P21860 1342 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ANKRD24Q8TF21 1146 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IP6K1Q92551 441 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NLRP2Q9NX02 1062 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM182BQ5T319 152 aa27.25■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MAP3K19Q56UN5 1328 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCDC7Q96M83 1385 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RGPD5Q99666 1765 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM196AQ6ZSG2 479 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KIF20BQ96Q89 1820 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DDB1Q16531 1140 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PANK3Q9H999 370 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FBLN1P23142 703 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RTL1A6NKG5 1358 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HOXC9P31274 260 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KIF7Q2M1P5 1343 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BAG6P46379 1132 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EXOC5O00471 708 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DEFB132Q7Z7B7 95 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KNSTRNQ9Y448 316 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRIM37O94972 964 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IL2RBP14784 551 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FLT4P35916 1363 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KIF24Q5T7B8 1368 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DISP2A7MBM2 1401 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LRRC37A3O60309 1634 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NSD2O96028 1365 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 WNK3Q9BYP7 1800 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RGPD1P0DJD0 1748 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa27.08■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXB-AS3-204ENST00000466037 INSRP06213 1382 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TNS2Q63HR2 1409 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXB-AS3-204ENST00000466037 APBA3O96018 575 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MORC1Q86VD1 984 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa27■■□□□ 1.91
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NBPF6Q5VWK0 638 aa27■■□□□ 1.91
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NBPF4Q96M43 638 aa27■■□□□ 1.91
HOXB-AS3-204ENST00000466037 POLKQ9UBT6 870 aa27■■□□□ 1.91
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PEAK1Q9H792 1746 aa26.99■■□□□ 1.91
HOXB-AS3-204ENST00000466037 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.99■■□□□ 1.91
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa26.99■■□□□ 1.91
HOXB-AS3-204ENST00000466037 USHBP1Q8N6Y0 703 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BCL9O00512 1426 aa26.97■■□□□ 1.91
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PARD3Q8TEW0 1356 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CAMKK2Q96RR4 588 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RGPD2P0DJD1 1756 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MEGF6O75095 1541 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ACSBG1Q96GR2 724 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.5 ms