RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447577.5

CCDC18-AS1-216, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC18-AS1, Length 431 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 STK26Q9P289 416 aa10.09□□□□□ -0.79
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 BCL9O00512 1426 aa10.08□□□□□ -0.8
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ABHD8Q96I13 439 aa10.08□□□□□ -0.8
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa10.08□□□□□ -0.8
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 PKD1L3Q7Z443 1732 aa10.07□□□□□ -0.8
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 PIK3C2AO00443 1686 aa10.07□□□□□ -0.8
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 FOXN1O15353 648 aa10.07□□□□□ -0.8
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 EVA1CP58658 441 aa10.07□□□□□ -0.8
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SLC16A10Q8TF71 515 aa10.06□□□□□ -0.8
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 LRRC4BQ9NT99 713 aa10.06□□□□□ -0.8
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 RGS19P49795 217 aa10.05□□□□□ -0.8
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 FSTL1Q12841 308 aa10.05□□□□□ -0.8
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 DDB1Q16531 1140 aa10.05□□□□□ -0.8
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 AKT1S1Q96B36 256 aa10.05□□□□□ -0.8
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 QRICH2Q9H0J4 1663 aa10.05□□□□□ -0.8
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CRB1P82279 1406 aa10.04□□□□□ -0.8
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 PRDM10Q9NQV6 1147 aa10.03□□□□□ -0.8
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa10.03□□□□□ -0.8
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 GPRASP1Q5JY77 1395 aa10.02□□□□□ -0.8
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ABCC11Q96J66 1382 aa10.02□□□□□ -0.8
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ANKARQ7Z5J8 1434 aa10.02□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 VGFO15240 615 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 MSL1Q68DK7 614 aa10.02□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 KCPQ6ZWJ8 1503 aa10.02□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa10.02□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 IGSF1Q8N6C5 1336 aa10.01□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 NUP155O75694 1391 aa10.01□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 KAT6BQ8WYB5 2073 aa10□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 VPS8Q8N3P4 1428 aa10□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 NUTM2GQ5VZR2 741 aa10□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 PRR36Q9H6K5 1346 aa10□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 RGPD5Q99666 1765 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CCDC85CA6NKD9 419 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 TMEM132EQ6IEE7 984 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CD2APQ9Y5K6 639 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CPDO75976 1380 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 C10orf71Q711Q0 1435 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 PXDNLA1KZ92 1463 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 KCNQ4P56696 695 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ACSBG1Q96GR2 724 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 LY75O60449 1722 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 COL18A1P39060 1754 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 USP54Q70EL1 1684 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ITSN1Q15811 1721 aa9.96□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 LBX1P52954 281 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SMC1BQ8NDV3 1235 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 USP6P35125 1406 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ABCC6O95255 1503 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa9.93□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 RRAGCQ9HB90 399 aa9.93□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SBF1O95248 1867 aa9.93□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 KIF13BQ9NQT8 1826 aa9.93□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa9.93□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa9.91□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa9.91□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 MSH5O43196 834 aa9.91□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 PIK3C2GO75747 1445 aa9.9□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa9.9□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 C5P01031 1676 aa9.9□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa9.9□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 DOT1LQ8TEK3 1739 aa9.9□□□□□ -0.83
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 TAF1LQ8IZX4 1826 aa9.89□□□□□ -0.83
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 C9orf131Q5VYM1 1079 aa9.89□□□□□ -0.83
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 PRAM1Q96QH2 718 aa9.89□□□□□ -0.83
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ZBTB7CA1YPR0 619 aa9.88□□□□□ -0.83
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SLC27A3Q5K4L6 730 aa9.88□□□□□ -0.83
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 AIDAQ96BJ3 306 aa9.88□□□□□ -0.83
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CFAP44Q96MT7 982 aa9.88□□□□□ -0.83
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SIRT1Q96EB6 747 aa9.87□□□□□ -0.83
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CNTNAP1P78357 1384 aa9.87□□□□□ -0.83
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 WDR17Q8IZU2 1322 aa9.86□□□□□ -0.83
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 KDM2BQ8NHM5 1336 aa9.86□□□□□ -0.83
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa9.86□□□□□ -0.83
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SMIM5Q71RC9 77 aa9.86□□□□□ -0.83
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 TIAM2Q8IVF5 1701 aa9.86□□□□□ -0.83
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 WBP1LQ9NX94 342 aa9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms