RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445427.1

PRKCQ-AS1-202, PRKCQ antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCQ-AS1, Length 1,133 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ABCC6O95255 1503 aa30.05■■■□□ 2.4
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 AXIN2Q9Y2T1 843 aa30■■■□□ 2.39
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ERBB3P21860 1342 aa29.87■■■□□ 2.37
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CGNL1Q0VF96 1302 aa29.85■■■□□ 2.37
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CCDC7Q96M83 1385 aa29.85■■■□□ 2.37
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 FAM182BQ5T319 152 aa29.83■■■□□ 2.37
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ANKRD24Q8TF21 1146 aa29.83■■■□□ 2.37
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 FBLN1P23142 703 aa29.81■■■□□ 2.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NLRP2Q9NX02 1062 aa29.81■■■□□ 2.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 HOXC9P31274 260 aa29.79■■■□□ 2.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PANK3Q9H999 370 aa29.79■■■□□ 2.36
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NSD2O96028 1365 aa29.69■■■□□ 2.34
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 IL2RBP14784 551 aa29.69■■■□□ 2.34
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TNS2Q63HR2 1409 aa29.68■■■□□ 2.34
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa29.65■■■□□ 2.34
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.58■■■□□ 2.33
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NBPF6Q5VWK0 638 aa29.57■■■□□ 2.32
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NBPF4Q96M43 638 aa29.57■■■□□ 2.32
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PARD3Q8TEW0 1356 aa29.53■■■□□ 2.32
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 USHBP1Q8N6Y0 703 aa29.53■■■□□ 2.32
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa29.51■■■□□ 2.31
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CAMKK2Q96RR4 588 aa29.51■■■□□ 2.31
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TATP17735 454 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 KAT6BQ8WYB5 2073 aa29.47■■■□□ 2.31
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NHSQ6T4R5 1651 aa29.47■■■□□ 2.31
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa29.47■■■□□ 2.31
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