RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436022.2

EFCC1-201, Transcript of EF-hand and coiled-coil domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene EFCC1, Length 2,691 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCC1-201ENST00000436022 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa28.47■■■□□ 2.15
EFCC1-201ENST00000436022 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
EFCC1-201ENST00000436022 KCNA6P17658 529 aa28.46■■■□□ 2.15
EFCC1-201ENST00000436022 NRKQ7Z2Y5 1582 aa28.46■■■□□ 2.15
EFCC1-201ENST00000436022 PTCH1Q13635 1447 aa28.46■■■□□ 2.15
EFCC1-201ENST00000436022 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa28.46■■■□□ 2.15
EFCC1-201ENST00000436022 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa28.45■■■□□ 2.15
EFCC1-201ENST00000436022 OVOS2Q6IE36 1432 aa28.45■■■□□ 2.15
EFCC1-201ENST00000436022 AEBP1Q8IUX7 1158 aa28.44■■■□□ 2.14
EFCC1-201ENST00000436022 TRIM27P14373 513 aa28.43■■■□□ 2.14
EFCC1-201ENST00000436022 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
EFCC1-201ENST00000436022 SSH2Q76I76 1423 aa28.43■■■□□ 2.14
EFCC1-201ENST00000436022 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa28.41■■■□□ 2.14
EFCC1-201ENST00000436022 FAM83GA6ND36 823 aa28.41■■■□□ 2.14
EFCC1-201ENST00000436022 MVPQ14764 893 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
EFCC1-201ENST00000436022 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
EFCC1-201ENST00000436022 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
EFCC1-201ENST00000436022 DIP2AQ14689 1571 aa28.4■■■□□ 2.14
EFCC1-201ENST00000436022 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
EFCC1-201ENST00000436022 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
EFCC1-201ENST00000436022 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.13
EFCC1-201ENST00000436022 DCTN1Q14203 1278 aa28.38■■■□□ 2.13
EFCC1-201ENST00000436022 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
EFCC1-201ENST00000436022 SULT6B1Q6IMI4 303 aa28.37■■■□□ 2.13
EFCC1-201ENST00000436022 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
EFCC1-201ENST00000436022 TSPYL6Q8N831 410 aa28.36■■■□□ 2.13
EFCC1-201ENST00000436022 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
EFCC1-201ENST00000436022 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa28.36■■■□□ 2.13
EFCC1-201ENST00000436022 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
EFCC1-201ENST00000436022 USP31Q70CQ4 1352 aa28.35■■■□□ 2.13
EFCC1-201ENST00000436022 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
EFCC1-201ENST00000436022 PEAK1Q9H792 1746 aa28.35■■■□□ 2.13
EFCC1-201ENST00000436022 MBIPQ9NS73 344 aa28.34■■■□□ 2.13
EFCC1-201ENST00000436022 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
EFCC1-201ENST00000436022 ZNF853P0CG23 659 aa28.33■■■□□ 2.13
EFCC1-201ENST00000436022 MAP3K19Q56UN5 1328 aa28.32■■■□□ 2.12
EFCC1-201ENST00000436022 ITPRIPQ8IWB1 547 aa28.31■■■□□ 2.12
EFCC1-201ENST00000436022 VAMP4O75379 141 aa28.31■■■□□ 2.12
EFCC1-201ENST00000436022 AAMPQ13685 434 aa28.31■■■□□ 2.12
EFCC1-201ENST00000436022 IFT57Q9NWB7 429 aa28.31■■■□□ 2.12
EFCC1-201ENST00000436022 TTC21AQ8NDW8 1320 aa28.3■■■□□ 2.12
EFCC1-201ENST00000436022 TMEM57Q8N5G2 664 aa28.3■■■□□ 2.12
EFCC1-201ENST00000436022 GNAI1P63096 354 aa28.3■■■□□ 2.12
EFCC1-201ENST00000436022 NUTM2GQ5VZR2 741 aa28.29■■■□□ 2.12
EFCC1-201ENST00000436022 NALCNQ8IZF0 1738 aa28.29■■■□□ 2.12
EFCC1-201ENST00000436022 DLG5Q8TDM6 1919 aa28.29■■■□□ 2.12
EFCC1-201ENST00000436022 SEC24BO95487 1268 aa28.28■■■□□ 2.12
EFCC1-201ENST00000436022 ALDH1L2Q3SY69 923 aa28.28■■■□□ 2.12
EFCC1-201ENST00000436022 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
EFCC1-201ENST00000436022 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.27■■■□□ 2.12
EFCC1-201ENST00000436022 CFAP44Q96MT7 982 aa28.27■■■□□ 2.12
EFCC1-201ENST00000436022 C8orf58Q8NAV2 365 aa28.26■■■□□ 2.12
EFCC1-201ENST00000436022 KIF16BQ96L93 1317 aa28.26■■■□□ 2.11
EFCC1-201ENST00000436022 PIK3R4Q99570 1358 aa28.25■■■□□ 2.11
EFCC1-201ENST00000436022 NLRP6P59044 892 aa28.24■■■□□ 2.11
EFCC1-201ENST00000436022 LMOD3Q0VAK6 560 aa28.24■■■□□ 2.11
EFCC1-201ENST00000436022 USP35Q9P2H5 1018 aa28.24■■■□□ 2.11
EFCC1-201ENST00000436022 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa28.24■■■□□ 2.11
EFCC1-201ENST00000436022 DDX19BQ9UMR2 479 aa28.24■■■□□ 2.11
EFCC1-201ENST00000436022 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
EFCC1-201ENST00000436022 MCM10Q7L590 875 aa28.23■■■□□ 2.11
EFCC1-201ENST00000436022 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
EFCC1-201ENST00000436022 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
EFCC1-201ENST00000436022 PIK3C2AO00443 1686 aa28.22■■■□□ 2.11
EFCC1-201ENST00000436022 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
EFCC1-201ENST00000436022 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.21■■■□□ 2.11
EFCC1-201ENST00000436022 NFKBIBQ15653 356 aa28.2■■■□□ 2.11
EFCC1-201ENST00000436022 USP19O94966 1318 aa28.2■■■□□ 2.11
EFCC1-201ENST00000436022 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa28.2■■■□□ 2.1
EFCC1-201ENST00000436022 FOXO3O43524 673 aa28.19■■■□□ 2.1
EFCC1-201ENST00000436022 KRT24Q2M2I5 525 aa28.19■■■□□ 2.1
EFCC1-201ENST00000436022 ZNF428Q96B54 188 aa28.19■■■□□ 2.1
EFCC1-201ENST00000436022 SBNO1A3KN83 1393 aa28.19■■■□□ 2.1
EFCC1-201ENST00000436022 FLT4P35916 1363 aa28.19■■■□□ 2.1
EFCC1-201ENST00000436022 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
EFCC1-201ENST00000436022 RGPD1P0DJD0 1748 aa28.19■■■□□ 2.1
EFCC1-201ENST00000436022 AMPHP49418 695 aa28.18■■■□□ 2.1
EFCC1-201ENST00000436022 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
EFCC1-201ENST00000436022 FMN2Q9NZ56 1722 aa28.17■■■□□ 2.1
EFCC1-201ENST00000436022 EYA1Q99502 592 aa28.16■■■□□ 2.1
EFCC1-201ENST00000436022 ABTB2Q8N961 1025 aa28.16■■■□□ 2.1
EFCC1-201ENST00000436022 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.14■■■□□ 2.1
EFCC1-201ENST00000436022 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
EFCC1-201ENST00000436022 ARHGEF10O15013 1369 aa28.13■■■□□ 2.09
EFCC1-201ENST00000436022 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
EFCC1-201ENST00000436022 PHF8Q9UPP1 1060 aa28.13■■■□□ 2.09
EFCC1-201ENST00000436022 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
EFCC1-201ENST00000436022 C14orf37Q86TY3 774 aa28.12■■■□□ 2.09
EFCC1-201ENST00000436022 CHL1O00533 1208 aa28.11■■■□□ 2.09
EFCC1-201ENST00000436022 MIS18AQ9NYP9 233 aa28.11■■■□□ 2.09
EFCC1-201ENST00000436022 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
EFCC1-201ENST00000436022 HOXC9P31274 260 aa28.1■■■□□ 2.09
EFCC1-201ENST00000436022 IGSF1Q8N6C5 1336 aa28.1■■■□□ 2.09
EFCC1-201ENST00000436022 ARHGAP45Q92619 1136 aa28.09■■■□□ 2.09
EFCC1-201ENST00000436022 KDRP35968 1356 aa28.09■■■□□ 2.09
EFCC1-201ENST00000436022 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
EFCC1-201ENST00000436022 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
EFCC1-201ENST00000436022 C1orf115Q9H7X2 142 aa28.08■■■□□ 2.09
EFCC1-201ENST00000436022 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
EFCC1-201ENST00000436022 CRB1P82279 1406 aa28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms