RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420095.1

LMCD1-AS1-201, LMCD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMCD1-AS1, Length 2,144 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 SBNO1A3KN83 1393 aa15.5■□□□□ 0.07
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 HMOX1P09601 288 aa15.5■□□□□ 0.07
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PHACTR3Q96KR7 559 aa15.5■□□□□ 0.07
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 MAP3K19Q56UN5 1328 aa15.5■□□□□ 0.07
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 IL27Q8NEV9 243 aa15.49■□□□□ 0.07
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CRBNQ96SW2 442 aa15.49■□□□□ 0.07
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 RGPD1P0DJD0 1748 aa15.49■□□□□ 0.07
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 NLRP6P59044 892 aa15.49■□□□□ 0.07
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 KIF24Q5T7B8 1368 aa15.48■□□□□ 0.07
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa15.48■□□□□ 0.07
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 C14orf37Q86TY3 774 aa15.48■□□□□ 0.07
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 BCAR3O75815 825 aa15.47■□□□□ 0.07
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 C20orf194Q5TEA3 1177 aa15.47■□□□□ 0.07
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 FLT4P35916 1363 aa15.47■□□□□ 0.07
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa15.47■□□□□ 0.07
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa15.47■□□□□ 0.07
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ESCO1Q5FWF5 840 aa15.47■□□□□ 0.07
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 RARSP54136 660 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ABTB2Q8N961 1025 aa15.46■□□□□ 0.07
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 C19orf44Q9H6X5 657 aa15.46■□□□□ 0.07
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ARHGEF10O15013 1369 aa15.46■□□□□ 0.06
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PSME1Q06323 249 aa15.44■□□□□ 0.06
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 C1orf167Q5SNV9 1468 aa15.44■□□□□ 0.06
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 AMPHP49418 695 aa15.44■□□□□ 0.06
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 LMOD3Q0VAK6 560 aa15.44■□□□□ 0.06
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PDE3AQ14432 1141 aa15.44■□□□□ 0.06
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 STRCP1A6NGW2 1772 aa15.44■□□□□ 0.06
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 SOX12O15370 315 aa15.43■□□□□ 0.06
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 SULT6B1Q6IMI4 303 aa15.43■□□□□ 0.06
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 DCCP43146 1447 aa15.43■□□□□ 0.06
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 KIF1AQ12756 1690 aa15.43■□□□□ 0.06
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 AEBP1Q8IUX7 1158 aa15.43■□□□□ 0.06
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ORAI2Q96SN7 254 aa15.43■□□□□ 0.06
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 HSPA2P54652 639 aa15.42■□□□□ 0.06
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 NUTM2GQ5VZR2 741 aa15.42■□□□□ 0.06
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 RTL1A6NKG5 1358 aa15.42■□□□□ 0.06
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 TMEM94Q12767 1356 aa15.42■□□□□ 0.06
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 LMTK3Q96Q04 1460 aa15.41■□□□□ 0.06
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 NFAT5O94916 1531 aa15.41■□□□□ 0.06
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ZNF853P0CG23 659 aa15.41■□□□□ 0.06
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 HOXC9P31274 260 aa15.41■□□□□ 0.06
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 KDRP35968 1356 aa15.41■□□□□ 0.06
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 IGSF1Q8N6C5 1336 aa15.4■□□□□ 0.06
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 IFT57Q9NWB7 429 aa15.4■□□□□ 0.06
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 DLG5Q8TDM6 1919 aa15.4■□□□□ 0.06
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 MST1RQ04912 1400 aa15.4■□□□□ 0.06
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 GNAI1P63096 354 aa15.39■□□□□ 0.05
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 KCNH5Q8NCM2 988 aa15.39■□□□□ 0.05
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 EYA1Q99502 592 aa15.38■□□□□ 0.05
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 FOXO3O43524 673 aa15.38■□□□□ 0.05
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ATF3P18847 181 aa15.38■□□□□ 0.05
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 STRCQ7RTU9 1775 aa15.38■□□□□ 0.05
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 SLIT3O75094 1523 aa15.38■□□□□ 0.05
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 KRT28Q7Z3Y7 464 aa15.37■□□□□ 0.05
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 IP6K1Q92551 441 aa15.37■□□□□ 0.05
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CANXP27824 592 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ZNF428Q96B54 188 aa15.36■□□□□ 0.05
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CFAP44Q96MT7 982 aa15.36■□□□□ 0.05
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 USP19O94966 1318 aa15.36■□□□□ 0.05
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ALDH1L2Q3SY69 923 aa15.35■□□□□ 0.05
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CADPS2Q86UW7 1296 aa15.35■□□□□ 0.05
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 LTN1O94822 1766 aa15.35■□□□□ 0.05
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 AAMPQ13685 434 aa15.34■□□□□ 0.05
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 SSH1Q8WYL5 1049 aa15.34■□□□□ 0.05
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PANK1Q8TE04 598 aa15.34■□□□□ 0.05
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 MBIPQ9NS73 344 aa15.34■□□□□ 0.05
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 KDM2BQ8NHM5 1336 aa15.33■□□□□ 0.05
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 FAM83GA6ND36 823 aa15.33■□□□□ 0.04
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 MS4A1P11836 297 aa15.33■□□□□ 0.04
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa15.33■□□□□ 0.04
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 BCL2L13Q9BXK5 485 aa15.32■□□□□ 0.04
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ALS2Q96Q42 1657 aa15.32■□□□□ 0.04
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 MSH6P52701 1360 aa15.32■□□□□ 0.04
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 VAMP4O75379 141 aa15.32■□□□□ 0.04
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 GCP02774 474 aa15.32■□□□□ 0.04
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ARHGEF25Q86VW2 580 aa15.32■□□□□ 0.04
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 GAS2L2Q8NHY3 880 aa15.32■□□□□ 0.04
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 SMC4Q9NTJ3 1288 aa15.32■□□□□ 0.04
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CHL1O00533 1208 aa15.31■□□□□ 0.04
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 DCTN1Q14203 1278 aa15.31■□□□□ 0.04
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 COG6Q9Y2V7 657 aa15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.5 ms