RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa29.21■■■□□ 2.27
SH3BP4-204ENST00000416021 OVOS2Q6IE36 1432 aa29.21■■■□□ 2.27
SH3BP4-204ENST00000416021 BARGINQ6ZT62 677 aa29.21■■■□□ 2.27
SH3BP4-204ENST00000416021 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
SH3BP4-204ENST00000416021 LMO7Q8WWI1 1683 aa29.21■■■□□ 2.27
SH3BP4-204ENST00000416021 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa29.2■■■□□ 2.26
SH3BP4-204ENST00000416021 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
SH3BP4-204ENST00000416021 NFAT5O94916 1531 aa29.2■■■□□ 2.26
SH3BP4-204ENST00000416021 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa29.18■■■□□ 2.26
SH3BP4-204ENST00000416021 FBLN1P23142 703 aa29.18■■■□□ 2.26
SH3BP4-204ENST00000416021 WDR17Q8IZU2 1322 aa29.17■■■□□ 2.26
SH3BP4-204ENST00000416021 PANK3Q9H999 370 aa29.16■■■□□ 2.26
SH3BP4-204ENST00000416021 CRB1P82279 1406 aa29.15■■■□□ 2.26
SH3BP4-204ENST00000416021 NSD3Q9BZ95 1437 aa29.14■■■□□ 2.26
SH3BP4-204ENST00000416021 IP6K1Q92551 441 aa29.13■■■□□ 2.25
SH3BP4-204ENST00000416021 COL18A1P39060 1754 aa29.13■■■□□ 2.25
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC125Q86Z20 511 aa29.12■■■□□ 2.25
SH3BP4-204ENST00000416021 CARD10Q9BWT7 1032 aa29.12■■■□□ 2.25
SH3BP4-204ENST00000416021 USP54Q70EL1 1684 aa29.12■■■□□ 2.25
SH3BP4-204ENST00000416021 AMPHP49418 695 aa29.1■■■□□ 2.25
SH3BP4-204ENST00000416021 CGNL1Q0VF96 1302 aa29.1■■■□□ 2.25
SH3BP4-204ENST00000416021 MAP3K19Q56UN5 1328 aa29.1■■■□□ 2.25
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM182BQ5T319 152 aa29.09■■■□□ 2.25
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKRD24Q8TF21 1146 aa29.09■■■□□ 2.25
SH3BP4-204ENST00000416021 PDE3BQ13370 1112 aa29.08■■■□□ 2.25
SH3BP4-204ENST00000416021 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
SH3BP4-204ENST00000416021 KIF7Q2M1P5 1343 aa29.08■■■□□ 2.25
SH3BP4-204ENST00000416021 MYOM1P52179 1685 aa29.08■■■□□ 2.25
SH3BP4-204ENST00000416021 ERBB3P21860 1342 aa29.06■■■□□ 2.24
SH3BP4-204ENST00000416021 HOXC9P31274 260 aa29.06■■■□□ 2.24
SH3BP4-204ENST00000416021 NLRP2Q9NX02 1062 aa29.06■■■□□ 2.24
SH3BP4-204ENST00000416021 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
SH3BP4-204ENST00000416021 ABCC6O95255 1503 aa29.04■■■□□ 2.24
SH3BP4-204ENST00000416021 BRWD3Q6RI45 1802 aa29.04■■■□□ 2.24
SH3BP4-204ENST00000416021 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
SH3BP4-204ENST00000416021 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa29.02■■■□□ 2.24
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM196AQ6ZSG2 479 aa29.01■■■□□ 2.23
SH3BP4-204ENST00000416021 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
SH3BP4-204ENST00000416021 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
SH3BP4-204ENST00000416021 DDB1Q16531 1140 aa29■■■□□ 2.23
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC7Q96M83 1385 aa29■■■□□ 2.23
SH3BP4-204ENST00000416021 KNSTRNQ9Y448 316 aa28.99■■■□□ 2.23
SH3BP4-204ENST00000416021 EP400Q96L91 3159 aa28.98■■■□□ 2.23
SH3BP4-204ENST00000416021 RGPD5Q99666 1765 aa28.97■■■□□ 2.23
SH3BP4-204ENST00000416021 EXOC5O00471 708 aa28.96■■■□□ 2.23
SH3BP4-204ENST00000416021 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa28.95■■■□□ 2.22
SH3BP4-204ENST00000416021 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28.95■■■□□ 2.22
SH3BP4-204ENST00000416021 LTN1O94822 1766 aa28.94■■■□□ 2.22
SH3BP4-204ENST00000416021 RTL1A6NKG5 1358 aa28.94■■■□□ 2.22
SH3BP4-204ENST00000416021 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
SH3BP4-204ENST00000416021 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
SH3BP4-204ENST00000416021 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.94■■■□□ 2.22
SH3BP4-204ENST00000416021 IL2RBP14784 551 aa28.92■■■□□ 2.22
SH3BP4-204ENST00000416021 DEFB132Q7Z7B7 95 aa28.92■■■□□ 2.22
SH3BP4-204ENST00000416021 TRIM37O94972 964 aa28.91■■■□□ 2.22
SH3BP4-204ENST00000416021 POLKQ9UBT6 870 aa28.91■■■□□ 2.22
SH3BP4-204ENST00000416021 KIF24Q5T7B8 1368 aa28.9■■■□□ 2.22
SH3BP4-204ENST00000416021 DISP2A7MBM2 1401 aa28.9■■■□□ 2.22
SH3BP4-204ENST00000416021 MORC1Q86VD1 984 aa28.9■■■□□ 2.22
SH3BP4-204ENST00000416021 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
SH3BP4-204ENST00000416021 KIF20BQ96Q89 1820 aa28.9■■■□□ 2.22
SH3BP4-204ENST00000416021 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
SH3BP4-204ENST00000416021 NBPF6Q5VWK0 638 aa28.89■■■□□ 2.22
SH3BP4-204ENST00000416021 NBPF4Q96M43 638 aa28.89■■■□□ 2.22
SH3BP4-204ENST00000416021 INSRP06213 1382 aa28.88■■■□□ 2.21
SH3BP4-204ENST00000416021 FLT4P35916 1363 aa28.88■■■□□ 2.21
SH3BP4-204ENST00000416021 NSD2O96028 1365 aa28.88■■■□□ 2.21
SH3BP4-204ENST00000416021 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
SH3BP4-204ENST00000416021 BAG6P46379 1132 aa28.86■■■□□ 2.21
SH3BP4-204ENST00000416021 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
SH3BP4-204ENST00000416021 APBA3O96018 575 aa28.82■■■□□ 2.2
SH3BP4-204ENST00000416021 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
SH3BP4-204ENST00000416021 USHBP1Q8N6Y0 703 aa28.82■■■□□ 2.2
SH3BP4-204ENST00000416021 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
SH3BP4-204ENST00000416021 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa28.8■■■□□ 2.2
SH3BP4-204ENST00000416021 PEAK1Q9H792 1746 aa28.77■■■□□ 2.2
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRC37A3O60309 1634 aa28.77■■■□□ 2.2
SH3BP4-204ENST00000416021 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
SH3BP4-204ENST00000416021 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
SH3BP4-204ENST00000416021 TNS2Q63HR2 1409 aa28.76■■■□□ 2.19
SH3BP4-204ENST00000416021 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
SH3BP4-204ENST00000416021 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa28.75■■■□□ 2.19
SH3BP4-204ENST00000416021 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
SH3BP4-204ENST00000416021 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
SH3BP4-204ENST00000416021 CAMKK2Q96RR4 588 aa28.74■■■□□ 2.19
SH3BP4-204ENST00000416021 EYA1Q99502 592 aa28.74■■■□□ 2.19
SH3BP4-204ENST00000416021 BCL9O00512 1426 aa28.74■■■□□ 2.19
SH3BP4-204ENST00000416021 TATP17735 454 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
SH3BP4-204ENST00000416021 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
SH3BP4-204ENST00000416021 PTF1AQ7RTS3 328 aa28.73■■■□□ 2.19
SH3BP4-204ENST00000416021 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
SH3BP4-204ENST00000416021 WNK3Q9BYP7 1800 aa28.69■■■□□ 2.18
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNQ2O43526 872 aa28.69■■■□□ 2.18
SH3BP4-204ENST00000416021 ACSBG1Q96GR2 724 aa28.69■■■□□ 2.18
SH3BP4-204ENST00000416021 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa28.68■■■□□ 2.18
SH3BP4-204ENST00000416021 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa28.67■■■□□ 2.18
SH3BP4-204ENST00000416021 RGPD1P0DJD0 1748 aa28.67■■■□□ 2.18
SH3BP4-204ENST00000416021 MEGF6O75095 1541 aa28.67■■■□□ 2.18
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