RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 NFE2L2Q16236 605 aa28.08■■■□□ 2.09
SH3BP5-204ENST00000412806 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
SH3BP5-204ENST00000412806 ORAI2Q96SN7 254 aa28.06■■■□□ 2.08
SH3BP5-204ENST00000412806 IL16Q14005 1332 aa28.06■■■□□ 2.08
SH3BP5-204ENST00000412806 FLT4P35916 1363 aa28.06■■■□□ 2.08
SH3BP5-204ENST00000412806 LTN1O94822 1766 aa28.06■■■□□ 2.08
SH3BP5-204ENST00000412806 STRCQ7RTU9 1775 aa28.06■■■□□ 2.08
SH3BP5-204ENST00000412806 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.05■■■□□ 2.08
SH3BP5-204ENST00000412806 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa28.04■■■□□ 2.08
SH3BP5-204ENST00000412806 FANCIQ9NVI1 1328 aa28.04■■■□□ 2.08
SH3BP5-204ENST00000412806 KIF1AQ12756 1690 aa28.04■■■□□ 2.08
SH3BP5-204ENST00000412806 PSME1Q06323 249 aa28.04■■■□□ 2.08
SH3BP5-204ENST00000412806 AEBP1Q8IUX7 1158 aa28.03■■■□□ 2.08
SH3BP5-204ENST00000412806 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
SH3BP5-204ENST00000412806 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.02■■■□□ 2.08
SH3BP5-204ENST00000412806 AMPHP49418 695 aa28.02■■■□□ 2.08
SH3BP5-204ENST00000412806 SULT6B1Q6IMI4 303 aa28.02■■■□□ 2.08
SH3BP5-204ENST00000412806 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28.01■■■□□ 2.08
SH3BP5-204ENST00000412806 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM94Q12767 1356 aa28.01■■■□□ 2.07
SH3BP5-204ENST00000412806 RARSP54136 660 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
SH3BP5-204ENST00000412806 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
SH3BP5-204ENST00000412806 ARHGEF10O15013 1369 aa27.98■■■□□ 2.07
SH3BP5-204ENST00000412806 NFAT5O94916 1531 aa27.98■■■□□ 2.07
SH3BP5-204ENST00000412806 KIF24Q5T7B8 1368 aa27.98■■■□□ 2.07
SH3BP5-204ENST00000412806 FOXO3O43524 673 aa27.97■■■□□ 2.07
SH3BP5-204ENST00000412806 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
SH3BP5-204ENST00000412806 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa27.96■■■□□ 2.07
SH3BP5-204ENST00000412806 HOXC9P31274 260 aa27.95■■■□□ 2.06
SH3BP5-204ENST00000412806 MST1RQ04912 1400 aa27.95■■■□□ 2.06
SH3BP5-204ENST00000412806 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
SH3BP5-204ENST00000412806 DCCP43146 1447 aa27.94■■■□□ 2.06
SH3BP5-204ENST00000412806 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
SH3BP5-204ENST00000412806 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
SH3BP5-204ENST00000412806 ATF3P18847 181 aa27.91■■■□□ 2.06
SH3BP5-204ENST00000412806 LMOD3Q0VAK6 560 aa27.91■■■□□ 2.06
SH3BP5-204ENST00000412806 EYA1Q99502 592 aa27.91■■■□□ 2.06
SH3BP5-204ENST00000412806 IGSF1Q8N6C5 1336 aa27.91■■■□□ 2.06
SH3BP5-204ENST00000412806 BCL2L13Q9BXK5 485 aa27.9■■■□□ 2.06
SH3BP5-204ENST00000412806 RTL1A6NKG5 1358 aa27.9■■■□□ 2.06
SH3BP5-204ENST00000412806 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
SH3BP5-204ENST00000412806 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
SH3BP5-204ENST00000412806 KDRP35968 1356 aa27.9■■■□□ 2.06
SH3BP5-204ENST00000412806 SLIT3O75094 1523 aa27.89■■■□□ 2.06
SH3BP5-204ENST00000412806 ALS2Q96Q42 1657 aa27.89■■■□□ 2.05
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM83GA6ND36 823 aa27.88■■■□□ 2.05
SH3BP5-204ENST00000412806 CANXP27824 592 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
SH3BP5-204ENST00000412806 KRT28Q7Z3Y7 464 aa27.88■■■□□ 2.05
SH3BP5-204ENST00000412806 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
SH3BP5-204ENST00000412806 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
SH3BP5-204ENST00000412806 PDE3AQ14432 1141 aa27.88■■■□□ 2.05
SH3BP5-204ENST00000412806 KCNH5Q8NCM2 988 aa27.86■■■□□ 2.05
SH3BP5-204ENST00000412806 IFT57Q9NWB7 429 aa27.86■■■□□ 2.05
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF853P0CG23 659 aa27.85■■■□□ 2.05
SH3BP5-204ENST00000412806 DCTN1Q14203 1278 aa27.85■■■□□ 2.05
SH3BP5-204ENST00000412806 GNAI1P63096 354 aa27.84■■■□□ 2.05
SH3BP5-204ENST00000412806 RGPD2P0DJD1 1756 aa27.84■■■□□ 2.05
SH3BP5-204ENST00000412806 PANK1Q8TE04 598 aa27.83■■■□□ 2.05
SH3BP5-204ENST00000412806 IP6K1Q92551 441 aa27.83■■■□□ 2.05
SH3BP5-204ENST00000412806 MSH6P52701 1360 aa27.83■■■□□ 2.05
SH3BP5-204ENST00000412806 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
SH3BP5-204ENST00000412806 TNNQ9UQP3 1299 aa27.82■■■□□ 2.04
SH3BP5-204ENST00000412806 LMOD2Q6P5Q4 547 aa27.82■■■□□ 2.04
SH3BP5-204ENST00000412806 CADPS2Q86UW7 1296 aa27.82■■■□□ 2.04
SH3BP5-204ENST00000412806 MBIPQ9NS73 344 aa27.81■■■□□ 2.04
SH3BP5-204ENST00000412806 USP19O94966 1318 aa27.81■■■□□ 2.04
SH3BP5-204ENST00000412806 SSH1Q8WYL5 1049 aa27.8■■■□□ 2.04
SH3BP5-204ENST00000412806 SMC4Q9NTJ3 1288 aa27.8■■■□□ 2.04
SH3BP5-204ENST00000412806 GCP02774 474 aa27.8■■■□□ 2.04
SH3BP5-204ENST00000412806 CFAP44Q96MT7 982 aa27.8■■■□□ 2.04
SH3BP5-204ENST00000412806 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
SH3BP5-204ENST00000412806 ZBTB7CA1YPR0 619 aa27.79■■■□□ 2.04
SH3BP5-204ENST00000412806 PLEKHG5O94827 1062 aa27.79■■■□□ 2.04
SH3BP5-204ENST00000412806 COG6Q9Y2V7 657 aa27.79■■■□□ 2.04
SH3BP5-204ENST00000412806 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
SH3BP5-204ENST00000412806 RLBP1P12271 317 aa27.77■■■□□ 2.04
SH3BP5-204ENST00000412806 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
SH3BP5-204ENST00000412806 RGPD5Q99666 1765 aa27.77■■■□□ 2.04
SH3BP5-204ENST00000412806 MCM10Q7L590 875 aa27.77■■■□□ 2.04
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
SH3BP5-204ENST00000412806 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa27.75■■■□□ 2.03
SH3BP5-204ENST00000412806 ARHGEF25Q86VW2 580 aa27.75■■■□□ 2.03
SH3BP5-204ENST00000412806 ALDH1L2Q3SY69 923 aa27.74■■■□□ 2.03
SH3BP5-204ENST00000412806 KDM2BQ8NHM5 1336 aa27.74■■■□□ 2.03
SH3BP5-204ENST00000412806 USHBP1Q8N6Y0 703 aa27.73■■■□□ 2.03
SH3BP5-204ENST00000412806 TSPYL6Q8N831 410 aa27.73■■■□□ 2.03
SH3BP5-204ENST00000412806 VAMP4O75379 141 aa27.73■■■□□ 2.03
SH3BP5-204ENST00000412806 GAS2L2Q8NHY3 880 aa27.73■■■□□ 2.03
SH3BP5-204ENST00000412806 CLUAP1Q96AJ1 413 aa27.73■■■□□ 2.03
SH3BP5-204ENST00000412806 CRB1P82279 1406 aa27.72■■■□□ 2.03
SH3BP5-204ENST00000412806 NPHP3Q7Z494 1330 aa27.71■■■□□ 2.03
SH3BP5-204ENST00000412806 PXDNQ92626 1479 aa27.71■■■□□ 2.03
SH3BP5-204ENST00000412806 LRRC37A3O60309 1634 aa27.71■■■□□ 2.03
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF428Q96B54 188 aa27.71■■■□□ 2.03
SH3BP5-204ENST00000412806 NBPF6Q5VWK0 638 aa27.7■■■□□ 2.02
SH3BP5-204ENST00000412806 NBPF4Q96M43 638 aa27.7■■■□□ 2.02
SH3BP5-204ENST00000412806 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
SH3BP5-204ENST00000412806 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa27.69■■■□□ 2.02
SH3BP5-204ENST00000412806 C8orf58Q8NAV2 365 aa27.69■■■□□ 2.02
SH3BP5-204ENST00000412806 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms