RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
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HDDC3-202ENST00000394272 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
HDDC3-202ENST00000394272 GCP02774 474 aa26.77■■□□□ 1.88
HDDC3-202ENST00000394272 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.77■■□□□ 1.88
HDDC3-202ENST00000394272 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.76■■□□□ 1.87
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HDDC3-202ENST00000394272 CCDC27Q2M243 656 aa26.75■■□□□ 1.87
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HDDC3-202ENST00000394272 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.75■■□□□ 1.87
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HDDC3-202ENST00000394272 IP6K1Q92551 441 aa26.72■■□□□ 1.87
HDDC3-202ENST00000394272 ARHGEF10O15013 1369 aa26.72■■□□□ 1.87
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HDDC3-202ENST00000394272 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.68■■□□□ 1.86
HDDC3-202ENST00000394272 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
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HDDC3-202ENST00000394272 KDRP35968 1356 aa26.67■■□□□ 1.86
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HDDC3-202ENST00000394272 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.67■■□□□ 1.86
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HDDC3-202ENST00000394272 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
HDDC3-202ENST00000394272 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.66■■□□□ 1.86
HDDC3-202ENST00000394272 WDR63Q8IWG1 891 aa26.66■■□□□ 1.86
HDDC3-202ENST00000394272 PLEKHG5O94827 1062 aa26.65■■□□□ 1.86
HDDC3-202ENST00000394272 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.65■■□□□ 1.86
HDDC3-202ENST00000394272 E9PSI1 815 aa26.64■■□□□ 1.86
HDDC3-202ENST00000394272 DLG5Q8TDM6 1919 aa26.64■■□□□ 1.85
HDDC3-202ENST00000394272 RIPK4P57078 832 aa26.63■■□□□ 1.85
HDDC3-202ENST00000394272 NFE2L2Q16236 605 aa26.63■■□□□ 1.85
HDDC3-202ENST00000394272 COL18A1P39060 1754 aa26.61■■□□□ 1.85
HDDC3-202ENST00000394272 CABLES1Q8TDN4 633 aa26.61■■□□□ 1.85
HDDC3-202ENST00000394272 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
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HDDC3-202ENST00000394272 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.58■■□□□ 1.85
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HDDC3-202ENST00000394272 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.57■■□□□ 1.84
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HDDC3-202ENST00000394272 KIAA0232Q92628 1395 aa26.53■■□□□ 1.84
HDDC3-202ENST00000394272 ANKRD24Q8TF21 1146 aa26.53■■□□□ 1.84
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HDDC3-202ENST00000394272 ERBB3P21860 1342 aa26.51■■□□□ 1.83
HDDC3-202ENST00000394272 LMO7Q8WWI1 1683 aa26.5■■□□□ 1.83
HDDC3-202ENST00000394272 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.5■■□□□ 1.83
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HDDC3-202ENST00000394272 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.49■■□□□ 1.83
HDDC3-202ENST00000394272 TOM1O60784 492 aa26.48■■□□□ 1.83
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HDDC3-202ENST00000394272 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
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HDDC3-202ENST00000394272 CHRNA2Q15822 529 aa26.46■■□□□ 1.83
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HDDC3-202ENST00000394272 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.44■■□□□ 1.82
HDDC3-202ENST00000394272 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
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HDDC3-202ENST00000394272 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
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HDDC3-202ENST00000394272 PIP4K2BP78356 416 aa26.37■■□□□ 1.81
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HDDC3-202ENST00000394272 CFAP44Q96MT7 982 aa26.36■■□□□ 1.81
HDDC3-202ENST00000394272 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
HDDC3-202ENST00000394272 ERICH6BQ5W0A0 696 aa26.36■■□□□ 1.81
HDDC3-202ENST00000394272 MCM10Q7L590 875 aa26.36■■□□□ 1.81
HDDC3-202ENST00000394272 LRRC37A3O60309 1634 aa26.35■■□□□ 1.81
HDDC3-202ENST00000394272 MAP3K5Q99683 1374 aa26.34■■□□□ 1.81
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